Merge branch 'Jalview-JS/develop' into merge_js_develop
[jalview.git] / src / jalview / util / Platform.java
index 8f8350f..daaab3a 100644 (file)
@@ -22,7 +22,9 @@ package jalview.util;
 
 import java.awt.Component;
 import java.awt.Dimension;
+import java.awt.GraphicsEnvironment;
 import java.awt.Toolkit;
+import java.awt.event.KeyEvent;
 import java.awt.event.MouseEvent;
 import java.io.BufferedReader;
 import java.io.File;
@@ -32,9 +34,14 @@ import java.io.IOException;
 import java.io.InputStream;
 import java.io.InputStreamReader;
 import java.io.Reader;
+import java.lang.reflect.Method;
 import java.net.URL;
+import java.nio.channels.Channels;
+import java.nio.channels.ReadableByteChannel;
 import java.nio.file.Files;
 import java.nio.file.Path;
+import java.nio.file.Paths;
+import java.nio.file.StandardCopyOption;
 import java.nio.file.attribute.BasicFileAttributes;
 import java.util.Date;
 import java.util.Locale;
@@ -69,8 +76,6 @@ public class Platform
   private static Boolean isNoJSMac = null, isNoJSWin = null, isMac = null,
           isWin = null;
 
-  private static Boolean isHeadless = null;
-
   private static swingjs.api.JSUtilI jsutil;
 
   static
@@ -90,7 +95,6 @@ public class Platform
       }
     }
   }
-  // private static Boolean isHeadless = null;
 
   /**
    * added to group mouse events into Windows and nonWindows (mac, unix, linux)
@@ -104,6 +108,56 @@ public class Platform
             : isMac);
   }
 
+  public static int SHORTCUT_KEY_MASK = (Platform.isMac()
+          ? KeyEvent.META_DOWN_MASK
+          : KeyEvent.CTRL_DOWN_MASK);
+
+  static
+  {
+    if (!GraphicsEnvironment.isHeadless())
+    {
+      // Using non-deprecated Extended key mask modifiers, but Java 8 has no
+      // getMenuShortcutKeyMaskEx method
+      Toolkit tk = Toolkit.getDefaultToolkit();
+      Method method = null;
+      try
+      {
+        method = tk.getClass().getMethod("getMenuShortcutKeyMaskEx");
+      } catch (Exception e)
+      {
+        System.err.println(
+                "Could not find Toolkit method getMenuShortcutKeyMaskEx. Trying getMenuShortcutKeyMask.");
+      }
+      if (method == null)
+      {
+        try
+        {
+          method = tk.getClass().getMethod("getMenuShortcutKeyMask");
+        } catch (Exception e)
+        {
+          System.err.println(
+                  "Could not find Toolkit method getMenuShortcutKeyMaskEx or getMenuShortcutKeyMask.");
+          e.printStackTrace();
+        }
+      }
+      if (method != null)
+      {
+        try
+        {
+          method.setAccessible(true);
+          SHORTCUT_KEY_MASK = ((int) method.invoke(tk, new Object[0]));
+        } catch (Exception e)
+        {
+          e.printStackTrace();
+        }
+      }
+      if (SHORTCUT_KEY_MASK <= 0xF)
+      {
+        // shift this into the extended region (was Java 8)
+        SHORTCUT_KEY_MASK = SHORTCUT_KEY_MASK << 6;
+      }
+    }
+  }
   /**
    * added to group mouse events into Windows and nonWindows (mac, unix, linux)
    * 
@@ -138,7 +192,7 @@ public class Platform
   }
 
   /**
-   * Check if we are on a Microsoft plaform...
+   * Check if we are on a Microsoft platform...
    * 
    * @return true if we have to cope with another platform variation
    */
@@ -147,18 +201,6 @@ public class Platform
     return (isNoJSWin == null ? (isNoJSWin = !isJS && isWin()) : isNoJSWin);
   }
 
-  /**
-   *
-   * @return true if we are running in non-interactive no UI mode
-   */
-  public static boolean isHeadless()
-  {
-    if (isHeadless == null)
-    {
-      isHeadless = "true".equals(System.getProperty("java.awt.headless"));
-    }
-    return isHeadless;
-  }
 
   /**
    * 
@@ -205,30 +247,14 @@ public class Platform
    */
   protected static boolean isControlDown(MouseEvent e, boolean aMac)
   {
-    if (!aMac)
-    {
-      return e.isControlDown();
-
-      // Jalview 2.11 code below: above is as amended for JalviewJS
-      // /*
-      // * answer false for right mouse button
-      // */
-      // if (e.isPopupTrigger())
-      // {
-      // return false;
-      // }
-      // return
-      // (jalview.util.ShortcutKeyMaskExWrapper.getMenuShortcutKeyMaskEx() //
-      // .getMenuShortcutKeyMaskEx()
-      // & jalview.util.ShortcutKeyMaskExWrapper
-      // .getModifiersEx(e)) != 0; // getModifiers()) != 0;
-    }
-    // answer false for right mouse button
-    // shortcut key will be META for a Mac
-    return !e.isPopupTrigger()
-            && (Toolkit.getDefaultToolkit().getMenuShortcutKeyMask()
-                    & e.getModifiers()) != 0;
-    // could we use e.isMetaDown() here?
+    //
+    // System.out.println(e.isPopupTrigger()
+    // + " " + ((SHORTCUT_KEY_MASK & e.getModifiersEx()) != 0)
+    // + " " + e.isControlDown());
+    return (aMac
+            ? !e.isPopupTrigger()
+                    && (SHORTCUT_KEY_MASK & e.getModifiersEx()) != 0
+            : e.isControlDown());
   }
 
   // BH: I don't know about that previous method. Here is what SwingJS uses.
@@ -637,20 +663,22 @@ public class Platform
   public static void getURLCommandArguments()
   {
 
-    try {
-    /**
-     * Retrieve the first query field as command arguments to Jalview. Include
-     * only if prior to "?j2s" or "&j2s" or "#". Assign the applet's __Info.args
-     * element to this value.
-     * 
-     * @j2sNative var a =
-     *            decodeURI((document.location.href.replace("&","?").split("?j2s")[0]
-     *            + "?").split("?")[1].split("#")[0]); a &&
-     *            (J2S.thisApplet.__Info.args = a.split(" "));
-     *            
-     *            System.out.println("URL arguments: " + a);
-     */
-    } catch (Throwable t) {
+    try
+    {
+      /**
+       * Retrieve the first query field as command arguments to Jalview. Include
+       * only if prior to "?j2s" or "&j2s" or "#". Assign the applet's
+       * __Info.args element to this value.
+       * 
+       * @j2sNative var a =
+       *            decodeURI((document.location.href.replace("&","?").split("?j2s")[0]
+       *            + "?").split("?")[1].split("#")[0]); a &&
+       *            (J2S.thisApplet.__Info.args = a.split(" "));
+       * 
+       *            System.out.println("URL arguments: " + a);
+       */
+    } catch (Throwable t)
+    {
     }
   }
 
@@ -804,17 +832,18 @@ public class Platform
   {
     if (isJS)
     {
-      jsutil.setAppletAttribute("app", j);
+      jsutil.setAppClass(j);
     }
   }
 
   /**
    *
-   * If this frame ia embedded in a web page, return a known type.
+   * If this frame is embedded in a web page, return a known type.
    * 
    * @param frame
    *          a JFrame or JInternalFrame
    * @param type
+   *          "name", "node", "init", "dim", or any DOM attribute, such as "id"
    * @return null if frame is not embedded.
    */
   public static Object getEmbeddedAttribute(Component frame, String type)
@@ -930,16 +959,17 @@ public class Platform
    */
   public static String getAppID(String frameType)
   {
+
     String id = Jalview.getInstance().j2sAppletID;
     if (id == null)
     {
-      Jalview.getInstance().j2sAppletID = id = (String) jsutil
-              .getAppletAttribute("_id");
+      Jalview.getInstance().j2sAppletID = id = (isJS
+              ? (String) jsutil.getAppletAttribute("_id")
+              : "jalview");
     }
     return id + (frameType == null ? "" : "-" + frameType);
   }
 
-
   /**
    * Option to avoid unnecessary seeking of nonexistent resources in JavaScript.
    * Works in Java as well.
@@ -949,7 +979,54 @@ public class Platform
    */
   public static Locale getLocaleOrNone(Locale loc)
   {
-    return (isJS && loc.getCountry() == "en" ? new Locale("") : loc);
+    return (isJS && loc.getLanguage() == "en" ? new Locale("") : loc);
+  }
+
+  /**
+   * From UrlDownloadClient; trivial in JavaScript; painful in Java.
+   * 
+   * @param urlstring
+   * @param outfile
+   * @throws IOException
+   */
+  public static void download(String urlstring, String outfile)
+          throws IOException
+  {
+    Path temp = null;
+    try (InputStream is = new URL(urlstring).openStream())
+    {
+      if (isJS)
+      { // so much easier!
+        streamToFile(is, new File(outfile));
+        return;
+      }
+      temp = Files.createTempFile(".jalview_", ".tmp");
+      try (FileOutputStream fos = new FileOutputStream(temp.toString());
+              ReadableByteChannel rbc = Channels.newChannel(is))
+      {
+        fos.getChannel().transferFrom(rbc, 0, Long.MAX_VALUE);
+        // copy tempfile to outfile once our download completes
+        // incase something goes wrong
+        Files.copy(temp, Paths.get(outfile),
+                StandardCopyOption.REPLACE_EXISTING);
+      }
+    } catch (IOException e)
+    {
+      throw e;
+    } finally
+    {
+      try
+      {
+        if (temp != null)
+        {
+          Files.deleteIfExists(temp);
+        }
+      } catch (IOException e)
+      {
+        System.out.println("Exception while deleting download temp file: "
+                + e.getMessage());
+      }
+    }
   }
 
 }