JAL-4134 only build tree when showing it in the tree viewer..
[jalview.git] / src / jalview / ws / dbsources / EBIAlfaFold.java
index fd10c79..5ab05e0 100644 (file)
@@ -448,7 +448,6 @@ public class EBIAlfaFold extends EbiFileRetrievedProxy
     }
     ContactMatrixI matrix = new PAEContactMatrix(sequence,
             (Map<String, Object>) paeDict);
-    matrix.setGroupSet(GroupSet.makeGroups(matrix, 5f, true));
 
     AlignmentAnnotation cmannot = sequence.addContactList(matrix);
     if (label != null)
@@ -506,7 +505,6 @@ public class EBIAlfaFold extends EbiFileRetrievedProxy
     SequenceI seq = sm.getSequence();
     ContactMatrixI matrix = new PAEContactMatrix(seq,
             (Map<String, Object>) pae_obj);
-    matrix.setGroupSet(GroupSet.makeGroups(matrix, 5f, true));
     AlignmentAnnotation cmannot = sm.getSequence().addContactList(matrix);
     /* this already happens in Sequence.addContactList()
      seq.addAlignmentAnnotation(cmannot);