JAL-1807 explicit imports (jalview.ws.*)
[jalview.git] / src / jalview / ws / dbsources / das / datamodel / DasSequenceSource.java
index dd3d901..c020497 100644 (file)
  */
 package jalview.ws.dbsources.das.datamodel;
 
+import jalview.bin.Cache;
+import jalview.datamodel.Alignment;
+import jalview.datamodel.AlignmentI;
+import jalview.datamodel.DBRefEntry;
+import jalview.datamodel.Sequence;
+import jalview.datamodel.SequenceI;
+import jalview.util.MessageManager;
+import jalview.ws.DasSequenceFeatureFetcher;
+import jalview.ws.dbsources.das.api.jalviewSourceI;
+import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy;
+import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxyImpl;
+
 import java.util.ArrayList;
 import java.util.Arrays;
 import java.util.HashMap;
@@ -39,16 +51,6 @@ import org.biodas.jdas.schema.sources.VERSION;
 
 import com.stevesoft.pat.Regex;
 
-import jalview.util.MessageManager;
-import jalview.ws.dbsources.das.api.jalviewSourceI;
-import jalview.ws.seqfetcher.*;
-import jalview.bin.Cache;
-import jalview.datamodel.Alignment;
-import jalview.datamodel.AlignmentI;
-import jalview.datamodel.DBRefEntry;
-import jalview.datamodel.Sequence;
-import jalview.datamodel.SequenceI;
-
 /**
  * an instance of this class is created for each unique DAS Sequence source (ie
  * one capable of handling the 'sequence' for a particular MapMaster)
@@ -278,11 +280,13 @@ public class DasSequenceSource extends DbSourceProxyImpl implements
       }
 
       if (seqs == null || seqs.size() == 0)
+      {
         return null;
+      }
       SequenceI[] sqs = new SequenceI[seqs.size()];
       for (int i = 0, iSize = seqs.size(); i < iSize; i++)
       {
-        sqs[i] = (SequenceI) seqs.elementAt(i);
+        sqs[i] = seqs.elementAt(i);
       }
       Alignment al = new Alignment(sqs);
       if (jsrc.isFeatureSource())
@@ -291,7 +295,7 @@ public class DasSequenceSource extends DbSourceProxyImpl implements
         srcs.addElement(jsrc);
         try
         {
-          jalview.ws.DasSequenceFeatureFetcher dssf = new jalview.ws.DasSequenceFeatureFetcher(
+          DasSequenceFeatureFetcher dssf = new DasSequenceFeatureFetcher(
                   sqs, null, srcs, false, false, multiple);
           while (dssf.isRunning())
           {