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[jalview.git] / src / jalview / ws / jws2 / dm / AAConSettings.java
index f226ce1..7d9f9d9 100644 (file)
@@ -21,7 +21,7 @@ import jalview.ws.params.WsParamSetI;
  * @author jprocter TODO: refactor to a generic 'last job and service run'
  *         container ?
  */
-public class AAConSettings extends jalview.ws.params.AutoCalcSetting 
+public class AAConSettings extends jalview.ws.params.AutoCalcSetting
 {
   Jws2Instance service;
 
@@ -80,35 +80,40 @@ public class AAConSettings extends jalview.ws.params.AutoCalcSetting
 
   public List<Argument> getJobArgset()
   {
-    return jobArgset==null ? null : JabaParamStore.getJabafromJwsArgs(jobArgset);
+    return jobArgset == null ? null : JabaParamStore
+            .getJabafromJwsArgs(jobArgset);
   }
 
   public void setJobArgset(List<Argument> jobArgset)
   {
     // TODO: test if parameters valid for service
-    this.jobArgset = jobArgset==null ? null : JabaParamStore.getJwsArgsfromJaba(jobArgset);
+    this.jobArgset = jobArgset == null ? null : JabaParamStore
+            .getJwsArgsfromJaba(jobArgset);
   }
 
   public String getWsParamFile()
   {
-    List<Option> opts=null;
-    if (jobArgset!=null)
+    List<Option> opts = null;
+    if (jobArgset != null)
     {
       opts = JabaParamStore.getJabafromJwsArgs(jobArgset);
-    } else {
-      if (preset!=null)
+    }
+    else
+    {
+      if (preset != null)
       {
         opts = JabaParamStore.getJabafromJwsArgs(preset.getArguments());
       }
     }
-    if (opts==null  || opts.size()==0)
+    if (opts == null || opts.size() == 0)
     {
       return "";
     }
-    StringBuffer pset=new StringBuffer();
-    for (String ps:ParameterUtils.writeParameterSet(opts, " "))
+    StringBuffer pset = new StringBuffer();
+    for (String ps : ParameterUtils.writeParameterSet(opts, " "))
     {
-      pset.append(ps); pset.append("\n");
+      pset.append(ps);
+      pset.append("\n");
     }
     return pset.toString();
   }
@@ -118,9 +123,11 @@ public class AAConSettings extends jalview.ws.params.AutoCalcSetting
   {
     return service.getServiceTypeURI();
   }
+
   @Override
   public String[] getServiceURLs()
   {
-    return new String[] { service.getUri() };
+    return new String[]
+    { service.getUri() };
   }
 }