formatting
[jalview.git] / src / jalview / ws / seqfetcher / DbSourceProxy.java
index 3dacb12..9fa904a 100644 (file)
@@ -30,8 +30,7 @@ import com.stevesoft.pat.Regex;
  * add/define mechanism for retrieval of Trees and distance matrices from a\r
  * database (unify with io)\r
  * \r
- * @author JimP\r
- * TODO: promote to API\r
+ * @author JimP TODO: promote to API\r
  */\r
 public interface DbSourceProxy\r
 {\r
@@ -102,10 +101,14 @@ public interface DbSourceProxy
   /**\r
    * make one or more queries to the database and attempt to parse the response\r
    * into an alignment\r
-   * @param queries - one or more queries for database in expected form\r
+   * \r
+   * @param queries\r
+   *          - one or more queries for database in expected form\r
    * @return null if queries were successful but result was not parsable\r
-   * @throws Exception - propagated from underlying transport to database (note - exceptions are not raised if query not found in database)\r
-   *           \r
+   * @throws Exception\r
+   *           - propagated from underlying transport to database (note -\r
+   *           exceptions are not raised if query not found in database)\r
+   * \r
    */\r
   public AlignmentI getSequenceRecords(String queries) throws Exception;\r
 \r
@@ -122,10 +125,12 @@ public interface DbSourceProxy
    */\r
   public StringBuffer getRawRecords();\r
 \r
-  \r
   /**\r
    * Find out more info about the source.\r
-   * @param dbsourceproperty - one of the database reference source properties in jalview.datamodel.DBRefSource\r
+   * \r
+   * @param dbsourceproperty\r
+   *          - one of the database reference source properties in\r
+   *          jalview.datamodel.DBRefSource\r
    * @return true if the source has this property\r
    */\r
   public boolean isA(Object dbsourceproperty);\r