JAL-3253 jalview.bin.Instance streamlining
[jalview.git] / src / jalview / ws / sifts / SiftsClient.java
index eb7bd99..bf4d970 100644 (file)
@@ -82,6 +82,22 @@ public class SiftsClient implements SiftsClientI
    */
   private static File mockSiftsFile;
 
+  private static final int BUFFER_SIZE = 4096;
+
+  public static final int UNASSIGNED = Integer.MIN_VALUE;
+
+  private static final int PDB_RES_POS = 0;
+
+  private static final int PDB_ATOM_POS = 1;
+
+  private static final int PDBE_POS = 2;
+
+  private static final String NOT_OBSERVED = "Not_Observed";
+
+  protected static final String SIFTS_FTP_BASE_URL = "http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/msd/sifts/xml/";
+
+  protected final static String NEWLINE = System.lineSeparator();
+
   private Entry siftsEntry;
 
   private StructureFile pdb;
@@ -100,22 +116,6 @@ public class SiftsClient implements SiftsClientI
    */
   private jalview.datamodel.Mapping seqFromPdbMapping;
 
-  private static final int BUFFER_SIZE = 4096;
-
-  public static final int UNASSIGNED = Integer.MIN_VALUE;
-
-  private static final int PDB_RES_POS = 0;
-
-  private static final int PDB_ATOM_POS = 1;
-
-  private static final int PDBE_POS = 2;
-
-  private static final String NOT_OBSERVED = "Not_Observed";
-
-  protected static final String SIFTS_FTP_BASE_URL = "http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/msd/sifts/xml/";
-
-  protected final static String NEWLINE = System.lineSeparator();
-
   private String curSourceDBRef;
 
   private HashSet<String> curDBRefAccessionIdsString;