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JAL-1713 update from Jalview 2.11.3 develop
[jalview.git] / src / jalview / xml / binding / uniprot / OrganismType.java
diff --git a/src/jalview/xml/binding/uniprot/OrganismType.java b/src/jalview/xml/binding/uniprot/OrganismType.java
index de53629..ca8ad97 100644 (file)
--- a/src/jalview/xml/binding/uniprot/OrganismType.java
+++ b/src/jalview/xml/binding/uniprot/OrganismType.java
@@ -1,8 +1,8 @@
 //
-// This file was generated by the Eclipse Implementation of JAXB, v2.3.3 
-// See https://eclipse-ee4j.github.io/jaxb-ri 
+// This file was generated by the JavaTM Architecture for XML Binding(JAXB) Reference Implementation, v2.2.8-b130911.1802 
+// See <a href="http://java.sun.com/xml/jaxb">http://java.sun.com/xml/jaxb</a> 
 // Any modifications to this file will be lost upon recompilation of the source schema. 
-// Generated on: 2022.02.07 at 04:44:21 PM GMT 
+// Generated on: 2023.01.31 at 04:07:10 PM GMT 
 //
 
 
@@ -20,34 +20,34 @@ import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
 /**
  * Describes the source organism.
  * 
- * &lt;p&gt;Java class for organismType complex type.
+ * <p>Java class for organismType complex type.
  * 
- * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
+ * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  * 
- * &lt;pre&gt;
- * &amp;lt;complexType name="organismType"&amp;gt;
- *   &amp;lt;complexContent&amp;gt;
- *     &amp;lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
- *       &amp;lt;sequence&amp;gt;
- *         &amp;lt;element name="name" type="{http://uniprot.org/uniprot}organismNameType" maxOccurs="unbounded"/&amp;gt;
- *         &amp;lt;element name="dbReference" type="{http://uniprot.org/uniprot}dbReferenceType" maxOccurs="unbounded"/&amp;gt;
- *         &amp;lt;element name="lineage" minOccurs="0"&amp;gt;
- *           &amp;lt;complexType&amp;gt;
- *             &amp;lt;complexContent&amp;gt;
- *               &amp;lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
- *                 &amp;lt;sequence&amp;gt;
- *                   &amp;lt;element name="taxon" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded"/&amp;gt;
- *                 &amp;lt;/sequence&amp;gt;
- *               &amp;lt;/restriction&amp;gt;
- *             &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
- *           &amp;lt;/complexType&amp;gt;
- *         &amp;lt;/element&amp;gt;
- *       &amp;lt;/sequence&amp;gt;
- *       &amp;lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" /&amp;gt;
- *     &amp;lt;/restriction&amp;gt;
- *   &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
- * &amp;lt;/complexType&amp;gt;
- * &lt;/pre&gt;
+ * <pre>
+ * &lt;complexType name="organismType">
+ *   &lt;complexContent>
+ *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
+ *       &lt;sequence>
+ *         &lt;element name="name" type="{http://uniprot.org/uniprot}organismNameType" maxOccurs="unbounded"/>
+ *         &lt;element name="dbReference" type="{http://uniprot.org/uniprot}dbReferenceType" maxOccurs="unbounded"/>
+ *         &lt;element name="lineage" minOccurs="0">
+ *           &lt;complexType>
+ *             &lt;complexContent>
+ *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
+ *                 &lt;sequence>
+ *                   &lt;element name="taxon" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded"/>
+ *                 &lt;/sequence>
+ *               &lt;/restriction>
+ *             &lt;/complexContent>
+ *           &lt;/complexType>
+ *         &lt;/element>
+ *       &lt;/sequence>
+ *       &lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" />
+ *     &lt;/restriction>
+ *   &lt;/complexContent>
+ * &lt;/complexType>
+ * </pre>
  * 
  * 
  */
@@ -70,20 +70,20 @@ public class OrganismType {
     /**
      * Gets the value of the name property.
      * 
-     * &lt;p&gt;
+     * <p>
      * This accessor method returns a reference to the live list,
      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
      * returned list will be present inside the JAXB object.
-     * This is why there is not a &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the name property.
+     * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the name property.
      * 
-     * &lt;p&gt;
+     * <p>
      * For example, to add a new item, do as follows:
-     * &lt;pre&gt;
+     * <pre>
      *    getName().add(newItem);
-     * &lt;/pre&gt;
+     * </pre>
      * 
      * 
-     * &lt;p&gt;
+     * <p>
      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
      * {@link OrganismNameType }
      * 
@@ -99,20 +99,20 @@ public class OrganismType {
     /**
      * Gets the value of the dbReference property.
      * 
-     * &lt;p&gt;
+     * <p>
      * This accessor method returns a reference to the live list,
      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
      * returned list will be present inside the JAXB object.
-     * This is why there is not a &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the dbReference property.
+     * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the dbReference property.
      * 
-     * &lt;p&gt;
+     * <p>
      * For example, to add a new item, do as follows:
-     * &lt;pre&gt;
+     * <pre>
      *    getDbReference().add(newItem);
-     * &lt;/pre&gt;
+     * </pre>
      * 
      * 
-     * &lt;p&gt;
+     * <p>
      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
      * {@link DbReferenceType }
      * 
@@ -152,20 +152,20 @@ public class OrganismType {
     /**
      * Gets the value of the evidence property.
      * 
-     * &lt;p&gt;
+     * <p>
      * This accessor method returns a reference to the live list,
      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
      * returned list will be present inside the JAXB object.
-     * This is why there is not a &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the evidence property.
+     * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the evidence property.
      * 
-     * &lt;p&gt;
+     * <p>
      * For example, to add a new item, do as follows:
-     * &lt;pre&gt;
+     * <pre>
      *    getEvidence().add(newItem);
-     * &lt;/pre&gt;
+     * </pre>
      * 
      * 
-     * &lt;p&gt;
+     * <p>
      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
      * {@link Integer }
      * 
@@ -180,21 +180,21 @@ public class OrganismType {
 
 
     /**
-     * &lt;p&gt;Java class for anonymous complex type.
+     * <p>Java class for anonymous complex type.
      * 
-     * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
+     * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
      * 
-     * &lt;pre&gt;
-     * &amp;lt;complexType&amp;gt;
-     *   &amp;lt;complexContent&amp;gt;
-     *     &amp;lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
-     *       &amp;lt;sequence&amp;gt;
-     *         &amp;lt;element name="taxon" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded"/&amp;gt;
-     *       &amp;lt;/sequence&amp;gt;
-     *     &amp;lt;/restriction&amp;gt;
-     *   &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
-     * &amp;lt;/complexType&amp;gt;
-     * &lt;/pre&gt;
+     * <pre>
+     * &lt;complexType>
+     *   &lt;complexContent>
+     *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
+     *       &lt;sequence>
+     *         &lt;element name="taxon" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded"/>
+     *       &lt;/sequence>
+     *     &lt;/restriction>
+     *   &lt;/complexContent>
+     * &lt;/complexType>
+     * </pre>
      * 
      * 
      */
@@ -210,20 +210,20 @@ public class OrganismType {
         /**
          * Gets the value of the taxon property.
          * 
-         * &lt;p&gt;
+         * <p>
          * This accessor method returns a reference to the live list,
          * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
          * returned list will be present inside the JAXB object.
-         * This is why there is not a &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the taxon property.
+         * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the taxon property.
          * 
-         * &lt;p&gt;
+         * <p>
          * For example, to add a new item, do as follows:
-         * &lt;pre&gt;
+         * <pre>
          *    getTaxon().add(newItem);
-         * &lt;/pre&gt;
+         * </pre>
          * 
          * 
-         * &lt;p&gt;
+         * <p>
          * Objects of the following type(s) are allowed in the list
          * {@link String }
          *