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[jalview.git] / srcjar / javajs / util / T3.java
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+++ /dev/null
@@ -1,337 +0,0 @@
-/*
-   Copyright (C) 1997,1998,1999
-   Kenji Hiranabe, Eiwa System Management, Inc.
-
-   This program is free software.
-   Implemented by Kenji Hiranabe(hiranabe@esm.co.jp),
-   conforming to the Java(TM) 3D API specification by Sun Microsystems.
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-   Permission to use, copy, modify, distribute and sell this software
-   and its documentation for any purpose is hereby granted without fee,
-   provided that the above copyright notice appear in all copies and
-   that both that copyright notice and this permission notice appear
-   in supporting documentation. Kenji Hiranabe and Eiwa System Management,Inc.
-   makes no representations about the suitability of this software for any
-   purpose.  It is provided "AS IS" with NO WARRANTY.
-*/
-package javajs.util;
-
-import java.io.Serializable;
-
-import javajs.api.JSONEncodable;
-
-/**
- * A generic 3 element tuple that is represented by single precision floating
- * point x,y and z coordinates.
- * 
- * @version specification 1.1, implementation $Revision: 1.10 $, $Date:
- *          2006/09/08 20:20:20 $
- * @author Kenji hiranabe
- * 
- * additions by Bob Hanson hansonr@stolaf.edu 9/30/2012
- * for unique constructor and method names
- * for the optimization of compiled JavaScript using Java2Script
- */
-public abstract class T3 implements JSONEncodable, Serializable {
-
-  public float x, y, z;
-
-  public T3() {
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of this tuple to the specified xyz coordinates.
-   * 
-   * @param x
-   *        the x coordinate
-   * @param y
-   *        the y coordinate
-   * @param z
-   *        the z coordinate
-   */
-  public final void set(float x, float y, float z) {
-    this.x = x;
-    this.y = y;
-    this.z = z;
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of this tuple from the 3 values specified in the array.
-   * 
-   * @param t
-   *        the array of length 3 containing xyz in order
-   */
-  public final void setA(float t[]) {
-    // ArrayIndexOutOfBounds is thrown if t.length < 3
-    x = t[0];
-    y = t[1];
-    z = t[2];
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of this tuple to the value of the Tuple3f argument.
-   * 
-   * @param t1
-   *        the tuple to be copied
-   */
-  public final void setT(T3 t1) {
-    x = t1.x;
-    y = t1.y;
-    z = t1.z;
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of this tuple to the vector sum of tuples t1 and t2.
-   * 
-   * @param t1
-   *        the first tuple
-   * @param t2
-   *        the second tuple
-   */
-  public final void add2(T3 t1, T3 t2) {
-    x = t1.x + t2.x;
-    y = t1.y + t2.y;
-    z = t1.z + t2.z;
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of this tuple to the vector sum of itself and tuple t1.
-   * 
-   * @param t1
-   *        the other tuple
-   */
-  public final void add(T3 t1) {
-    x += t1.x;
-    y += t1.y;
-    z += t1.z;
-  }
-
-  /**
-   * Computes the square of the distance between this point and point p1.
-   * 
-   * @param p1
-   *        the other point
-   * @return the square of distance between these two points as a float
-   */
-  public final float distanceSquared(T3 p1) {
-    double dx = x - p1.x;
-    double dy = y - p1.y;
-    double dz = z - p1.z;
-    return (float) (dx * dx + dy * dy + dz * dz);
-  }
-
-  /**
-   * Returns the distance between this point and point p1.
-   * 
-   * @param p1
-   *        the other point
-   * @return the distance between these two points
-   */
-  public final float distance(T3 p1) {
-    return (float) Math.sqrt(distanceSquared(p1));
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of this tuple to the vector difference of tuple t1 and t2
-   * (this = t1 - t2).
-   * 
-   * @param t1
-   *        the first tuple
-   * @param t2
-   *        the second tuple
-   */
-  public final void sub2(T3 t1, T3 t2) {
-    x = t1.x - t2.x;
-    y = t1.y - t2.y;
-    z = t1.z - t2.z;
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of this tuple to the vector difference of itself and tuple
-   * t1 (this = this - t1).
-   * 
-   * @param t1
-   *        the other tuple
-   */
-  public final void sub(T3 t1) {
-    x -= t1.x;
-    y -= t1.y;
-    z -= t1.z;
-  }
-
-  /**
-   * Sets the value of this tuple to the scalar multiplication of itself.
-   * 
-   * @param s
-   *        the scalar value
-   */
-  public final void scale(float s) {
-    x *= s;
-    y *= s;
-    z *= s;
-  }
-
-  /**
-   * Add {a b c}
-   * 
-   * @param a
-   * @param b
-   * @param c
-   */
-  public final void add3(float a, float b, float c) {
-    x += a;
-    y += b;
-    z += c;
-  }
-
-  
-  /**
-   * {x*p.x, y*p.y, z*p.z)  used for three-way scaling
-   * 
-   * @param p
-   */
-  public final void scaleT(T3 p) {
-    x *= p.x;
-    y *= p.y;
-    z *= p.z;
-  }
-
-  
-  /**
-   * Sets the value of this tuple to the scalar multiplication of tuple t1 and
-   * then adds tuple t2 (this = s*t1 + t2).
-   * 
-   * @param s
-   *        the scalar value
-   * @param t1
-   *        the tuple to be multipled
-   * @param t2
-   *        the tuple to be added
-   */
-  public final void scaleAdd2(float s, T3 t1, T3 t2) {
-    x = s * t1.x + t2.x;
-    y = s * t1.y + t2.y;
-    z = s * t1.z + t2.z;
-  }
-
-  
-  /**
-   * average of two tuples
-   * 
-   * @param a
-   * @param b
-   */
-  public void ave(T3 a, T3 b) {
-    x = (a.x + b.x) / 2f;
-    y = (a.y + b.y) / 2f;
-    z = (a.z + b.z) / 2f; 
-  }
-
-  /**
-   * Vector dot product. Was in Vector3f; more useful here, though.
-   * 
-   * @param v
-   *        the other vector
-   * @return this.dot.v
-   */
-  public final float dot(T3 v) {
-    return x * v.x + y * v.y + z * v.z;
-  }
-
-  /**
-   * Returns the squared length of this vector.
-   * Was in Vector3f; more useful here, though.
-   * 
-   * @return the squared length of this vector
-   */
-  public final float lengthSquared() {
-    return x * x + y * y + z * z;
-  }
-
-  /**
-   * Returns the length of this vector.
-   * Was in Vector3f; more useful here, though.
-   * 
-   * @return the length of this vector
-   */
-  public final float length() {
-    return (float) Math.sqrt(lengthSquared());
-  }
-
-  /**
-   * Normalizes this vector in place.
-   * Was in Vector3f; more useful here, though.
-   */
-  public final void normalize() {
-    double d = length();
-
-    // zero-div may occur.
-    x /= d;
-    y /= d;
-    z /= d;
-  }
-
-  /**
-   * Sets this tuple to be the vector cross product of vectors v1 and v2.
-   * 
-   * @param v1
-   *        the first vector
-   * @param v2
-   *        the second vector
-   */
-  public final void cross(T3 v1, T3 v2) {
-    set(v1.y * v2.z - v1.z * v2.y, v1.z * v2.x - v1.x * v2.z, v1.x * v2.y
-        - v1.y * v2.x);
-  }
-
-  /**
-   * Returns a hash number based on the data values in this object. Two
-   * different Tuple3f objects with identical data values (ie, returns true for
-   * equals(Tuple3f) ) will return the same hash number. Two vectors with
-   * different data members may return the same hash value, although this is not
-   * likely.
-   */
-  @Override
-  public int hashCode() {
-    long bits = 1L;
-    bits = 31L * bits + floatToIntBits(x);
-    bits = 31L * bits + floatToIntBits(y);
-    bits = 31L * bits + floatToIntBits(z);
-    return (int) (bits ^ (bits >> 32));
-  }
-
-  public static int floatToIntBits(float x) {
-    return (x == 0 ? 0 : Float.floatToIntBits(x));
-  }
-
-  /**
-   * Returns true if all of the data members of Tuple3f t1 are equal to the
-   * corresponding data members in this
-   * 
-   * @param t1
-   *        the vector with which the comparison is made.
-   */
-  @Override
-  public boolean equals(Object t1) {
-    if (!(t1 instanceof T3))
-      return false;
-    T3 t2 = (T3) t1;
-    return (x == t2.x && y == t2.y && z == t2.z);
-  }
-
-  /**
-   * Returns a string that contains the values of this Tuple3f. The form is
-   * (x,y,z).
-   * 
-   * @return the String representation
-   */
-  @Override
-  public String toString() {
-    return "{" + x + ", " + y + ", " + z + "}";
-  }
-  
-  @Override
-  public String toJSON() {
-    return "[" + x + "," + y + "," + z + "]";
-  }
-}