JAL-1645 source formatting and organise imports
[jalview.git] / test / MCview / PDBfileTest.java
index 3e24f52..9d7009f 100644 (file)
@@ -21,7 +21,7 @@ import org.testng.annotations.Test;
 
 public class PDBfileTest
 {
-  @Test(groups ={ "Functional" })
+  @Test(groups = { "Functional" })
   public void testIsRna()
   {
     SequenceI seq = new Sequence("Seq1", "CGAU");
@@ -43,7 +43,7 @@ public class PDBfileTest
    * 
    * @throws IOException
    */
-  @Test(groups ={ "Functional" })
+  @Test(groups = { "Functional" })
   public void testParse() throws IOException
   {
     /*
@@ -120,7 +120,7 @@ public class PDBfileTest
    * 
    * @throws IOException
    */
-  @Test(groups ={ "Functional" })
+  @Test(groups = { "Functional" })
   public void testParse_withAnnotations_noSS() throws IOException
   {
     PDBfile pf = new PDBfile(true, false, false, "examples/3W5V.pdb",
@@ -178,7 +178,7 @@ public class PDBfileTest
    * 
    * @throws IOException
    */
-  @Test(groups ={ "Functional" })
+  @Test(groups = { "Functional" })
   public void testParse_withJmol_noAnnotations() throws IOException
   {
     PDBfile pf = new PDBfile(false, true, false, "examples/3W5V.pdb",
@@ -207,7 +207,7 @@ public class PDBfileTest
    * 
    * @throws IOException
    */
-  @Test(groups ={ "Functional" })
+  @Test(groups = { "Functional" })
   public void testParse_withJmolAddAlignmentAnnotations()
           throws IOException
   {
@@ -264,8 +264,7 @@ public class PDBfileTest
    * @throws IOException
    */
 
-  @Test(groups =
-  { "Functional" }, enabled = false)
+  @Test(groups = { "Functional" }, enabled = false)
   public void testParse_withAnnotate3D() throws IOException
   {
     // TODO requires a mock for Annotate3D processing
@@ -273,6 +272,7 @@ public class PDBfileTest
     PDBfile pf = new PDBfile(true, true, true, "examples/2GIS.pdb",
             AppletFormatAdapter.FILE);
   }
+
   /**
    * Helper method to extract parsed annotations from the PDBfile
    * 
@@ -285,4 +285,4 @@ public class PDBfileTest
     pf.addAnnotations(al);
     return al.getAlignmentAnnotation();
   }
-  }
+}