Merge branch 'develop' into feature/r2_11_2/JAL-3808_gff2_exonerate
[jalview.git] / test / jalview / analysis / AlignmentGenerator.java
index 9d3877c..d01b23e 100644 (file)
@@ -20,6 +20,8 @@
  */
 package jalview.analysis;
 
+import java.util.Locale;
+
 import jalview.datamodel.Alignment;
 import jalview.datamodel.AlignmentI;
 import jalview.datamodel.Sequence;
@@ -91,7 +93,7 @@ public class AlignmentGenerator
       ps = new PrintStream(new File(args[6]));
     }
 
-    boolean nucleotide = args[0].toLowerCase().startsWith("n");
+    boolean nucleotide = args[0].toLowerCase(Locale.ROOT).startsWith("n");
     int width = Integer.parseInt(args[1]);
     int height = Integer.parseInt(args[2]);
     long randomSeed = Long.valueOf(args[3]);