JAL-2446 merged to spike branch
[jalview.git] / test / jalview / gui / SequenceRendererTest.java
index 81289b0..c80b830 100644 (file)
@@ -53,11 +53,29 @@ public class SequenceRendererTest
     av.setGlobalColourScheme(new ZappoColourScheme());
 
     // @see ResidueProperties.zappo
-    assertEquals(Color.pink, sr.getResidueColour(seq, 0, null)); // M
-    assertEquals(Color.green, sr.getResidueColour(seq, 2, null)); // T
-    assertEquals(Color.magenta, sr.getResidueColour(seq, 5, null)); // G
-    assertEquals(Color.orange, sr.getResidueColour(seq, 12, null)); // F
+    assertEquals(Color.pink, sr.getResidueBoxColour(seq, 0)); // M
+    assertEquals(Color.green, sr.getResidueBoxColour(seq, 2)); // T
+    assertEquals(Color.magenta, sr.getResidueBoxColour(seq, 5)); // G
+    assertEquals(Color.orange, sr.getResidueBoxColour(seq, 12)); // F
   }
+
+  @Test(groups = { "Functional" })
+  public void testGetResidueBoxColour_none()
+  {
+    SequenceI seq = new Sequence("name", "MA--TVLGSPRAPAFF");
+    AlignmentI al = new Alignment(new SequenceI[] { seq });
+    final AlignViewport av = new AlignViewport(al);
+    SequenceRenderer sr = new SequenceRenderer(av);
+
+    assertEquals(Color.white, sr.getResidueBoxColour(seq, 0));
+    assertEquals(Color.white, sr.getResidueBoxColour(seq, 2));
+
+    // set for overview
+    sr.forOverview = true;
+    assertEquals(Color.lightGray, sr.getResidueBoxColour(seq, 0));
+    assertEquals(Color.white, sr.getResidueBoxColour(seq, 2));
+  }
+
   // TODO more tests for getResidueBoxColour covering groups, feature rendering,
   // gaps, overview...