Merge branch 'Jalview-JS/develop' into merge_js_develop
[jalview.git] / test / jalview / io / FileFormatsTest.java
index 724bae0..faf05d3 100644 (file)
@@ -37,7 +37,7 @@ public class FileFormatsTest
             .getName())));
     assertTrue(formats.isIdentifiable(formats.forName(FileFormat.Jnet
             .getName())));
-    assertFalse(formats.isIdentifiable(formats.forName(FileFormat.Jalview
+    assertTrue(formats.isIdentifiable(formats.forName(FileFormat.Jalview
             .getName())));
     assertFalse(formats.isIdentifiable(null));
 
@@ -55,7 +55,7 @@ public class FileFormatsTest
   @Test(groups = "Functional")
   public void testGetReadableFormats()
   {
-    String expected = "[Fasta, PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, HTML, RNAML, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, GFF or Jalview features, PDB, mmCIF, Jalview, HMMER3]";
+    String expected = "[Fasta, PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, HTML, RNAML, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, GFF or Jalview features, PDB, mmCIF, Jalview, HMMER3, BSML]";
     FileFormats formats = FileFormats.getInstance();
     assertEquals(formats.getReadableFormats().toString(), expected);
   }
@@ -74,14 +74,15 @@ public class FileFormatsTest
   public void testDeregisterFileFormat()
   {
     String writable = "[Fasta, PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, HMMER3]";
-    String readable = "[Fasta, PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, HTML, RNAML, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, GFF or Jalview features, PDB, mmCIF, Jalview, HMMER3]";
+    String readable = "[Fasta, PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, HTML, RNAML, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, GFF or Jalview features, PDB, mmCIF, Jalview, HMMER3, BSML]";
     FileFormats formats = FileFormats.getInstance();
+    System.out.println(formats.getReadableFormats().toString());
     assertEquals(formats.getWritableFormats(true).toString(), writable);
     assertEquals(formats.getReadableFormats().toString(), readable);
 
     formats.deregisterFileFormat(FileFormat.Fasta.getName());
     writable = "[PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, HMMER3]";
-    readable = "[PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, HTML, RNAML, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, GFF or Jalview features, PDB, mmCIF, Jalview, HMMER3]";
+    readable = "[PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, HTML, RNAML, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, GFF or Jalview features, PDB, mmCIF, Jalview, HMMER3, BSML]";
     assertEquals(formats.getWritableFormats(true).toString(), writable);
     assertEquals(formats.getReadableFormats().toString(), readable);
 
@@ -90,7 +91,7 @@ public class FileFormatsTest
      */
     formats.registerFileFormat(FileFormat.Fasta);
     writable = "[PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, HMMER3, Fasta]";
-    readable = "[PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, HTML, RNAML, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, GFF or Jalview features, PDB, mmCIF, Jalview, HMMER3, Fasta]";
+    readable = "[PFAM, Stockholm, PIR, BLC, AMSA, HTML, RNAML, JSON, PileUp, MSF, Clustal, PHYLIP, GFF or Jalview features, PDB, mmCIF, Jalview, HMMER3, BSML, Fasta]";
     assertEquals(formats.getWritableFormats(true).toString(), writable);
     assertEquals(formats.getReadableFormats().toString(), readable);
   }