JAL-2189 apply license
[jalview.git] / test / jalview / io / Jalview2xmlBase.java
index d774f87..7f38dec 100644 (file)
@@ -1,11 +1,31 @@
+/*
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ */
 package jalview.io;
 
 import jalview.bin.Cache;
+import jalview.bin.Jalview;
 import jalview.datamodel.AlignmentAnnotation;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
 import jalview.gui.Desktop;
 
-import java.time.Instant;
 import java.util.Date;
 
 import org.testng.annotations.AfterClass;
@@ -21,12 +41,19 @@ public class Jalview2xmlBase
   @BeforeClass(alwaysRun = true)
   public static void setUpBeforeClass() throws Exception
   {
-    jalview.bin.Jalview.main(new String[] { "-props",
-        "test/jalview/io/testProps.jvprops" });
-    jalview.bin.Cache.setProperty(
-            "JALVIEW_NEWS_RSS_LASTMODIFIED",
-            Cache.date_format.format(Date.from(Instant.now().plusSeconds(
-                    3600))));
+    /*
+     * use read-only test properties file
+     */
+    Cache.loadProperties("test/jalview/io/testProps.jvprops");
+
+    /*
+     * set news feed last read to a future time to ensure no
+     * 'unread' news item is displayed
+     */
+    Date oneHourFromNow = new Date(System.currentTimeMillis() + 3600 * 1000);
+    Cache.setDateProperty("JALVIEW_NEWS_RSS_LASTMODIFIED", oneHourFromNow);
+
+    Jalview.main(new String[] {});
   }
 
   /**
@@ -41,7 +68,10 @@ public class Jalview2xmlBase
   @BeforeTest(alwaysRun = true)
   public static void clearDesktop()
   {
-    Desktop.instance.closeAll_actionPerformed(null);
+    if (Desktop.instance != null && Desktop.getAlignFrames() != null)
+    {
+      Desktop.instance.closeAll_actionPerformed(null);
+    }
   }
 
   public int countDsAnn(jalview.viewmodel.AlignmentViewport avp)