Merge branch 'Jalview-JS/develop' into merge_js_develop
[jalview.git] / test / jalview / renderer / seqfeatures / FeatureColourFinderTest.java
index d8b905e..fd90999 100644 (file)
@@ -6,24 +6,24 @@ import static org.testng.Assert.assertNotEquals;
 import static org.testng.Assert.assertNull;
 import static org.testng.Assert.assertTrue;
 
+import java.awt.Color;
+import java.util.List;
+
+import org.testng.annotations.BeforeClass;
+import org.testng.annotations.BeforeMethod;
+import org.testng.annotations.Test;
+
 import jalview.api.FeatureColourI;
 import jalview.datamodel.SequenceFeature;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
 import jalview.gui.AlignFrame;
-import jalview.gui.AlignViewport;
-import jalview.gui.FeatureRenderer;
+import jalview.api.AlignViewportI;
 import jalview.io.DataSourceType;
 import jalview.io.FileLoader;
 import jalview.schemes.FeatureColour;
+import jalview.viewmodel.seqfeatures.FeatureRendererModel;
 import jalview.viewmodel.seqfeatures.FeatureRendererModel.FeatureSettingsBean;
 
-import java.awt.Color;
-import java.util.List;
-
-import org.testng.annotations.BeforeMethod;
-import org.testng.annotations.BeforeTest;
-import org.testng.annotations.Test;
-
 /**
  * Unit tests for feature colour determination, including but not limited to
  * <ul>
@@ -43,7 +43,7 @@ import org.testng.annotations.Test;
  */
 public class FeatureColourFinderTest
 {
-  private AlignViewport av;
+  private AlignViewportI av;
 
   private SequenceI seq;
 
@@ -51,9 +51,9 @@ public class FeatureColourFinderTest
 
   private AlignFrame af;
 
-  private FeatureRenderer fr;
+  private FeatureRendererModel fr;
 
-  @BeforeTest(alwaysRun = true)
+  @BeforeClass(alwaysRun = true)
   public void setUp()
   {
     // aligned column 8 is sequence position 6
@@ -323,7 +323,7 @@ public class FeatureColourFinderTest
      */
     Color min = new Color(100, 50, 150);
     Color max = new Color(200, 0, 100);
-    FeatureColourI fc = new FeatureColour(min, max, 0, 10);
+    FeatureColourI fc = new FeatureColour(null, min, max, null, 0, 10);
     fr.setColour("kd", fc);
     fr.featuresAdded();
     av.setShowSequenceFeatures(true);
@@ -493,7 +493,7 @@ public class FeatureColourFinderTest
      */
     Color min = new Color(100, 50, 150);
     Color max = new Color(200, 0, 100);
-    FeatureColourI fc = new FeatureColour(min, max, 0, 10);
+    FeatureColourI fc = new FeatureColour(null, min, max, null, 0, 10);
     fc.setAboveThreshold(true);
     fc.setThreshold(5f);
     fr.setColour(kdFeature, fc);