JAL-3210 Barebones gradle/buildship/eclipse. See README
[jalview.git] / test / jalview / urls / CustomUrlProviderTest.java
diff --git a/test/jalview/urls/CustomUrlProviderTest.java b/test/jalview/urls/CustomUrlProviderTest.java
deleted file mode 100644 (file)
index f9ed893..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,163 +0,0 @@
-/*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
- * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
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- * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
- * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
- */
-package jalview.urls;
-
-import static org.testng.AssertJUnit.assertEquals;
-import static org.testng.AssertJUnit.assertFalse;
-import static org.testng.AssertJUnit.assertTrue;
-
-import jalview.urls.api.UrlProviderI;
-import jalview.util.UrlConstants;
-
-import java.util.Arrays;
-import java.util.HashMap;
-import java.util.Vector;
-
-import org.testng.annotations.Test;
-
-public class CustomUrlProviderTest
-{
-
-  private static final String cachedList = "TEST|http://someurl.blah/$DB_ACCESSION$|"
-          + "ANOTHER|http://test/t$SEQUENCE_ID$|"
-          + "TEST2|http://address/$SEQUENCE_ID$|SRS|"
-          + "http://theSRSlink/$SEQUENCE_ID$";
-
-  private static final String unselectedList = "NON1|http://x/y/$DB_ACCESSION$|"
-          + "NON2|http://a/b/c/$DB_ACCESSION";
-
-  private static final HashMap<String, String> urlMap = new HashMap<String, String>()
-  {
-    {
-      put("TEST","http://someurl.blah/$DB_ACCESSION$");
-      put("ANOTHER","http://test/t$SEQUENCE_ID$");
-      put("TEST2", "http://address/$SEQUENCE_ID$");
-      put("SRS", "http://theSRSlink/$SEQUENCE_ID$");
-    }
-  };
-  
-  private static final HashMap<String, String> unselUrlMap = new HashMap<String, String>()
-  {
-    {
-      put("NON1", "http://x/y/$DB_ACCESSION$");
-      put("NON2", "http://a/b/c/$DB_ACCESSION");
-    }
-  };
-
-  private static final String[] dlinks = {
-      "TEST|http://someurl.blah/$DB_ACCESSION$",
-      "ANOTHER|http://test/t$SEQUENCE_ID$",
-      "TEST2|http://address/$SEQUENCE_ID$",
- UrlConstants.DEFAULT_STRING };
-
-  private static final String[] unselDlinks = {
-      "NON1|http://x/y/$DB_ACCESSION$", "NON2|http://a/b/c/$DB_ACCESSION" };
-
-  private static final Vector<String> displayLinks = new Vector<String>(
-          Arrays.asList(dlinks));
-
-  private static final Vector<String> unselDisplayLinks = new Vector<String>(
-          Arrays.asList(unselDlinks));
-
-  private static final String[] dlinks2 = { "a|http://x.y.z/$SEQUENCE_ID$" };
-
-  private static final Vector<String> displayLinks2 = new Vector<String>(
-          Arrays.asList(dlinks2));
-
-  private static final String[] list1 = { "a" };
-
-  private static final String[] list2 = { "http://x.y.z/$SEQUENCE_ID$" };
-
-  private static final Vector<String> names = new Vector<String>(
-          Arrays.asList(list1));
-
-  private static final Vector<String> urls = new Vector<String>(
-          Arrays.asList(list2));
-
-  /*
-   * Test default url is set and returned correctly
-   */
-  @Test(groups = { "Functional" })
-  public void testDefaultUrl()
-  {
-    UrlProviderI customProv = new CustomUrlProvider(cachedList,
-            unselectedList);
-    
-    // default url can be set
-    assertTrue(customProv.setPrimaryUrl("ANOTHER"));
-
-    // supplied replacement id must be more than 4 chars
-    String result = customProv.getPrimaryUrl("123");
-    assertEquals(null, result);
-
-    // default url can be retrieved given a sequence id
-    result = customProv.getPrimaryUrl("seqid");
-    assertEquals("http://test/tseqid", result);
-
-    // if there is no default url it sets the default to null
-    assertFalse(customProv.setPrimaryUrl("No default"));
-    result = customProv.getPrimaryUrl("testid");
-    assertEquals(null, result);
-    
-    // choosing the default picks the DEFAULT_STRING option
-    customProv.choosePrimaryUrl();
-    result = customProv.getPrimaryUrl("seqid");
-    assertEquals(
-            UrlConstants.DEFAULT_STRING.split("\\|")[1].split("\\$")[0]
-            + "seqid",
-            result);
-  }
-
-  /*
-   * Test urls are set and returned correctly
-   */
-  @Test(groups = { "Functional" })
-  public void testUrlLinks()
-  {
-    // creation from cached url list works + old links upgraded
-    UrlProviderI customProv = new CustomUrlProvider(cachedList,
-            unselectedList);
-    assertTrue(displayLinks.containsAll(customProv.getLinksForMenu()));
-
-    // creation from map works + old links upgraded
-    UrlProviderI customProv2 = new CustomUrlProvider(urlMap, unselUrlMap);
-    assertTrue(displayLinks.containsAll(customProv2.getLinksForMenu()));
-
-    // writing url links as a string works
-    // because UrlProvider does not guarantee order of links, we can't just
-    // compare the output of writeUrlsAsString to a string, hence the hoops here
-    String result = customProv.writeUrlsAsString(true);
-    UrlProviderI up = new CustomUrlProvider(result, "");
-    assertTrue(displayLinks.containsAll(up.getLinksForMenu()));
-
-    result = customProv.writeUrlsAsString(false);
-    up = new CustomUrlProvider("", result);
-    assertTrue(unselDisplayLinks.containsAll(up.getLinksForMenu()));
-
-    result = customProv2.writeUrlsAsString(true);
-    UrlProviderI up2 = new CustomUrlProvider(result, "");
-    assertTrue(displayLinks.containsAll(up2.getLinksForMenu()));
-
-    result = customProv2.writeUrlsAsString(false);
-    up2 = new CustomUrlProvider("", result);
-    assertTrue(displayLinks.containsAll(up2.getLinksForMenu()));
-  }
-}