JAL-1713 update from Jalview 2.11.3 develop
[jalview.git] / test / jalview / util / MappingUtilsTest.java
index feaa948..8cb1208 100644 (file)
@@ -38,7 +38,7 @@ import org.testng.annotations.BeforeClass;
 import org.testng.annotations.Test;
 
 import jalview.api.AlignViewportI;
-import jalview.bin.Cache;
+import jalview.bin.Console;
 import jalview.commands.EditCommand;
 import jalview.commands.EditCommand.Action;
 import jalview.commands.EditCommand.Edit;
@@ -64,7 +64,7 @@ public class MappingUtilsTest
   @BeforeClass(alwaysRun = true)
   public void setUp()
   {
-    Cache.initLogger();
+    Console.initLogger();
   }
 
   @BeforeClass(alwaysRun = true)
@@ -1347,12 +1347,14 @@ public class MappingUtilsTest
     overlap = MappingUtils.findOverlap(ranges, 13, 15);
     assertNull(overlap);
   }
-  
+
   /**
    * Test mapping a sequence group where sequences in and outside the group
    * share a dataset sequence (e.g. alternative CDS for the same gene)
    * <p>
-   * This scenario doesn't arise after JAL-3763 changes, but test left as still valid
+   * This scenario doesn't arise after JAL-3763 changes, but test left as still
+   * valid
+   * 
    * @throws IOException
    */
   @Test(groups = { "Functional" })