JAL-1780 JAL-653 Format/AppletFormat import and export pipeline regularised, uses...
[jalview.git] / test / jalview / util / MappingUtilsTest.java
index 2d197be..8fc4507 100644 (file)
@@ -5,7 +5,6 @@ import static org.junit.Assert.assertSame;
 import static org.junit.Assert.assertTrue;
 import jalview.api.AlignViewportI;
 import jalview.datamodel.AlignedCodonFrame;
-import jalview.datamodel.Alignment;
 import jalview.datamodel.AlignmentI;
 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
 import jalview.datamodel.SearchResults;
@@ -16,6 +15,7 @@ import jalview.datamodel.SequenceI;
 import jalview.gui.AlignViewport;
 import jalview.io.AppletFormatAdapter;
 import jalview.io.FormatAdapter;
+
 import java.awt.Color;
 import java.io.IOException;
 import java.util.Arrays;
@@ -26,7 +26,6 @@ import java.util.Set;
 
 import org.junit.Test;
 
-
 public class MappingUtilsTest
 {
   private AlignViewportI dnaView;
@@ -247,7 +246,7 @@ public class MappingUtilsTest
   protected AlignmentI loadAlignment(final String data, String format)
           throws IOException
   {
-    Alignment a = new FormatAdapter().readFile(data,
+    AlignmentI a = new FormatAdapter().readFile(data,
             AppletFormatAdapter.PASTE, format);
     a.setDataset(null);
     return a;