JAL-2388 Tidies and unit tests
[jalview.git] / test / jalview / viewmodel / OverviewDimensionsShowHiddenTest.java
@@ -40,10 +40,10 @@ import org.testng.annotations.BeforeMethod;
 import org.testng.annotations.Test;
 
 @Test(singleThreaded = true)
-public class OverviewDimensionsTest
+public class OverviewDimensionsShowHiddenTest
 {
   AlignmentI al;
-  OverviewDimensionsWithHidden od;
+  OverviewDimensionsShowHidden od;
 
   // cached widths and heights
   int boxWidth;
@@ -60,7 +60,7 @@ public class OverviewDimensionsTest
   HiddenColumns hiddenCols = new HiddenColumns();
 
   @BeforeClass(alwaysRun = true)
-  public void setUpJvOptionPane()
+  public void setUpAlignment()
   {
     // create random alignment
     AlignmentGenerator gen = new AlignmentGenerator(false);
@@ -88,7 +88,7 @@ public class OverviewDimensionsTest
 
     HiddenColumns hiddenCols = new HiddenColumns();
 
-    od = new OverviewDimensionsWithHidden(vpranges, true);
+    od = new OverviewDimensionsShowHidden(vpranges, true);
     // Initial box sizing - default path through code
     od.setBoxPosition(al.getHiddenSequences(), hiddenCols);
 
@@ -138,7 +138,7 @@ public class OverviewDimensionsTest
     Alignment al1 = new Alignment(seqs1);
     ViewportRanges props = new ViewportRanges(al1);
 
-    OverviewDimensions od = new OverviewDimensionsWithHidden(props, true);
+    OverviewDimensions od = new OverviewDimensionsShowHidden(props, true);
     int scaledHeight = 267;
     assertEquals(od.getGraphHeight(), defaultGraphHeight);
     assertEquals(od.getSequencesHeight(), scaledHeight);
@@ -150,7 +150,7 @@ public class OverviewDimensionsTest
     Alignment al2 = new Alignment(seqs2);
     props = new ViewportRanges(al2);
 
-    od = new OverviewDimensionsWithHidden(props, true);
+    od = new OverviewDimensionsShowHidden(props, true);
     int scaledWidth = 300;
     assertEquals(od.getGraphHeight(), defaultGraphHeight);
     assertEquals(od.getSequencesHeight(), maxSeqHeight);
@@ -163,7 +163,7 @@ public class OverviewDimensionsTest
     Alignment al3 = new Alignment(seqs3);
     props = new ViewportRanges(al3);
 
-    od = new OverviewDimensionsWithHidden(props, true);
+    od = new OverviewDimensionsShowHidden(props, true);
     assertEquals(od.getGraphHeight(), defaultGraphHeight);
     assertEquals(od.getSequencesHeight(), minSeqHeight);
     assertEquals(od.getWidth(), maxWidth);
@@ -175,7 +175,7 @@ public class OverviewDimensionsTest
     Alignment al4 = new Alignment(seqs4);
     props = new ViewportRanges(al4);
 
-    od = new OverviewDimensionsWithHidden(props, true);
+    od = new OverviewDimensionsShowHidden(props, true);
     assertEquals(od.getGraphHeight(), defaultGraphHeight);
     assertEquals(od.getSequencesHeight(), maxSeqHeight);
     assertEquals(od.getWidth(), minWidth);
@@ -184,7 +184,7 @@ public class OverviewDimensionsTest
     Alignment al5 = new Alignment(seqs4);
     props = new ViewportRanges(al5);
 
-    od = new OverviewDimensionsWithHidden(props, false);
+    od = new OverviewDimensionsShowHidden(props, false);
     assertEquals(od.getGraphHeight(), 0);
     assertEquals(od.getSequencesHeight(), maxSeqHeight);
     assertEquals(od.getWidth(), minWidth);
@@ -616,9 +616,7 @@ public class OverviewDimensionsTest
     assertEquals(od.getBoxX(),
             Math.round((float) 3 * od.getWidth() / alwidth));
     assertEquals(od.getBoxY(), 0);
-    System.out.println(od.getBoxWidth());
     assertEquals(od.getBoxWidth(), boxWidth);
-    System.out.println(od.getBoxWidth());
     assertEquals(od.getBoxHeight(), boxHeight);
 
     // move viewport to left of hidden columns with overlap
@@ -983,7 +981,7 @@ public class OverviewDimensionsTest
   /*
    * Mouse click as position x,y in overview window
    */
-  private void mouseClick(OverviewDimensionsWithHidden od, int x, int y)
+  private void mouseClick(OverviewDimensionsShowHidden od, int x, int y)
   {
     od.updateViewportFromMouse(x, y, al.getHiddenSequences(), hiddenCols);