JAL-1807 still testing
[jalviewjs.git] / unused / com / stevesoft / pat / Regex.java
index 4f49f0c..594c7c9 100644 (file)
-//
-// This software is now distributed according to
-// the Lesser Gnu Public License.  Please see
-// http://www.gnu.org/copyleft/lesser.txt for
-// the details.
-//    -- Happy Computing!
-//
-package com.stevesoft.pat;
-
-import jalview.util.MessageManager;
-
-import java.util.BitSet;
-import java.util.Hashtable;
-
-import com.stevesoft.pat.wrap.StringWrap;
-
-/** Matches a Unicode punctuation character. */
-class UnicodePunct extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && Prop.isPunct(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a Unicode white space character. */
-class UnicodeWhite extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && Prop.isWhite(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-}
-
-/**
- * Matches a character that is not a Unicode punctuation character.
- */
-class NUnicodePunct extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && !Prop.isPunct(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-}
-
-/**
- * Matches a character that is not a Unicode white space character.
- */
-class NUnicodeWhite extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && !Prop.isWhite(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a Unicode word character: an alphanumeric or underscore. */
-class UnicodeW extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    if (from >= s.length())
-    {
-      return -1;
-    }
-    char c = s.charAt(from);
-    return (Prop.isAlphabetic(c) || Prop.isDecimalDigit(c) || c == '_') ? to
-            : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a character that is not a Unicode alphanumeric or underscore. */
-class NUnicodeW extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    if (from >= s.length())
-    {
-      return -1;
-    }
-    char c = s.charAt(from);
-    return !(Prop.isAlphabetic(c) || Prop.isDecimalDigit(c) || c == '_') ? to
-            : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a Unicode decimal digit. */
-class UnicodeDigit extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && Prop.isDecimalDigit(s.charAt(from)) ? to
-            : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a character that is not a Unicode digit. */
-class NUnicodeDigit extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && !Prop.isDecimalDigit(s.charAt(from)) ? to
-            : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a Unicode math character. */
-class UnicodeMath extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && Prop.isMath(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a non-math Unicode character. */
-class NUnicodeMath extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && !Prop.isMath(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a Unicode currency symbol. */
-class UnicodeCurrency extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && Prop.isCurrency(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a non-currency symbol Unicode character. */
-class NUnicodeCurrency extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && !Prop.isCurrency(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a Unicode alphabetic character. */
-class UnicodeAlpha extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && Prop.isAlphabetic(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches a non-alphabetic Unicode character. */
-class NUnicodeAlpha extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && !Prop.isAlphabetic(s.charAt(from)) ? to
-            : -1;
-  }
-}
-
-/** Matches an upper case Unicode character. */
-class UnicodeUpper extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && isUpper(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-
-  final boolean isUpper(char c)
-  {
-    return c == CaseMgr.toUpperCase(c) && c != CaseMgr.toLowerCase(c);
-  }
-}
-
-/** Matches an upper case Unicode character. */
-class UnicodeLower extends UniValidator
-{
-  public int validate(StringLike s, int from, int to)
-  {
-    return from < s.length() && isLower(s.charAt(from)) ? to : -1;
-  }
-
-  final boolean isLower(char c)
-  {
-    return c != CaseMgr.toUpperCase(c) && c == CaseMgr.toLowerCase(c);
-  }
-}
-
-/**
- * Regex provides the parser which constructs the linked list of Pattern classes
- * from a String.
- * <p>
- * For the purpose of this documentation, the fact that java interprets the
- * backslash will be ignored. In practice, however, you will need a double
- * backslash to obtain a string that contains a single backslash character.
- * Thus, the example pattern "\b" should really be typed as "\\b" inside java
- * code.
- * <p>
- * Note that Regex is part of package "com.stevesoft.pat". To use it, simply
- * import com.stevesoft.pat.Regex at the top of your file.
- * <p>
- * Regex is made with a constructor that takes a String that defines the regular
- * expression. Thus, for example
- * 
- * <pre>
- * Regex r = new Regex(&quot;[a-c]*&quot;);
- * </pre>
- * 
- * matches any number of characters so long as the are 'a', 'b', or 'c').
- * <p>
- * To attempt to match the Pattern to a given string, you can use either the
- * search(String) member function, or the matchAt(String,int position) member
- * function. These functions return a boolean which tells you whether or not the
- * thing worked, and sets the methods "charsMatched()" and "matchedFrom()" in
- * the Regex object appropriately.
- * <p>
- * The portion of the string before the match can be obtained by the left()
- * member, and the portion after the match can be obtained by the right()
- * member.
- * <p>
- * Essentially, this package implements a syntax that is very much like the perl
- * 5 regular expression syntax.
- * 
- * Longer example:
- * 
- * <pre>
- * Regex r = new Regex(&quot;x(a|b)y&quot;);
- * r.matchAt(&quot;xay&quot;, 0);
- * System.out.println(&quot;sub = &quot; + r.stringMatched(1));
- * </pre>
- * 
- * The above would print "sub = a".
- * 
- * <pre>
- *  r.left() // would return &quot;x&quot;
- *  r.right() // would return &quot;y&quot;
- * </pre>
- * 
- * <p>
- * Differences between this package and perl5:<br>
- * The extended Pattern for setting flags, is now supported, but the flags are
- * different. "(?i)" tells the pattern to ignore case, "(?Q)" sets the
- * "dontMatchInQuotes" flag, and "(?iQ)" sets them both. You can change the
- * escape character. The pattern
- * 
- * <pre>
- * (?e=#)#d+
- * </pre>
- * 
- * is the same as
- * 
- * <pre>
- * \d+
- * </pre>, but note that the sequence
- * 
- * <pre>
- * (?e=#)
- * </pre>
- * 
- * <b>must</b> occur at the very beginning of the pattern. There may be other
- * small differences as well. I will either make my package conform or note them
- * as I become aware of them.
- * <p>
- * This package supports additional patterns not in perl5: <center> <table
- * border=1>
- * <tr>
- * <td>(?@())</td>
- * <td>Group</td>
- * <td>This matches all characters between the '(' character and the balancing
- * ')' character. Thus, it will match "()" as well as "(())". The balancing
- * characters are arbitrary, thus (?@{}) matches on "{}" and "{{}}".</td>
- * <tr>
- * <td>(?&lt1)</td>
- * <td>Backup</td>
- * <td>Moves the pointer backwards within the text. This allows you to make a
- * "look behind." It fails if it attempts to move to a position before the
- * beginning of the string. "x(?&lt1)" is equivalent to "(?=x)". The number, 1
- * in this example, is the number of characters to move backwards.</td>
- * </table> </center>
- * </dl>
- * 
- * @author Steven R. Brandt
- * @version package com.stevesoft.pat, release 1.5.3
- * @see Pattern
- */
-public class Regex extends RegRes// implements FilenameFilter
-{
-  /**
-   * BackRefOffset gives the identity number of the first pattern. Version 1.0
-   * used zero, version 1.1 uses 1 to be more compatible with perl.
-   */
-  static int BackRefOffset = 1;
-
-  private static Pattern none = new NoPattern();
-
-  Pattern thePattern = none;
-
-  patInt minMatch = new patInt(0);
-
-  static Hashtable validators = new Hashtable();
-  static
-  {
-    define("p", "(?>1)", new UnicodePunct());
-    define("P", "(?>1)", new NUnicodePunct());
-    define("s", "(?>1)", new UnicodeWhite());
-    define("S", "(?>1)", new NUnicodeWhite());
-    define("w", "(?>1)", new UnicodeW());
-    define("W", "(?>1)", new NUnicodeW());
-    define("d", "(?>1)", new UnicodeDigit());
-    define("D", "(?>1)", new NUnicodeDigit());
-    define("m", "(?>1)", new UnicodeMath());
-    define("M", "(?>1)", new NUnicodeMath());
-    define("c", "(?>1)", new UnicodeCurrency());
-    define("C", "(?>1)", new NUnicodeCurrency());
-    define("a", "(?>1)", new UnicodeAlpha());
-    define("A", "(?>1)", new NUnicodeAlpha());
-    define("uc", "(?>1)", new UnicodeUpper());
-    define("lc", "(?>1)", new UnicodeLower());
-  }
-
-  /** Set the dontMatch in quotes flag. */
-  public void setDontMatchInQuotes(boolean b)
-  {
-    dontMatchInQuotes = b;
-  }
-
-  /** Find out if the dontMatchInQuotes flag is enabled. */
-  public boolean getDontMatchInQuotes()
-  {
-    return dontMatchInQuotes;
-  }
-
-  boolean dontMatchInQuotes = false;
-
-  /**
-   * Set the state of the ignoreCase flag. If set to true, then the pattern
-   * matcher will ignore case when searching for a match.
-   */
-  public void setIgnoreCase(boolean b)
-  {
-    ignoreCase = b;
-  }
-
-  /**
-   * Get the state of the ignoreCase flag. Returns true if we are ignoring the
-   * case of the pattern, false otherwise.
-   */
-  public boolean getIgnoreCase()
-  {
-    return ignoreCase;
-  }
-
-  boolean ignoreCase = false;
-
-  static boolean defaultMFlag = false;
-
-  /**
-   * Set the default value of the m flag. If it is set to true, then the MFlag
-   * will be on for any regex search executed.
-   */
-  public static void setDefaultMFlag(boolean mFlag)
-  {
-    defaultMFlag = mFlag;
-  }
-
-  /**
-   * Get the default value of the m flag. If it is set to true, then the MFlag
-   * will be on for any regex search executed.
-   */
-  public static boolean getDefaultMFlag()
-  {
-    return defaultMFlag;
-  }
-
-  /**
-   * Initializes the object without a Pattern. To supply a Pattern use
-   * compile(String s).
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#compile(java.lang.String)
-   */
-  public Regex()
-  {
-  }
-
-  /**
-   * Create and compile a Regex, but do not throw any exceptions. If you wish to
-   * have exceptions thrown for syntax errors, you must use the Regex(void)
-   * constructor to create the Regex object, and then call the compile method.
-   * Therefore, you should only call this method when you know your pattern is
-   * right. I will probably become more like
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search(java.lang.String)
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#compile(java.lang.String)
-   */
-  public Regex(String s)
-  {
-    try
-    {
-      compile(s);
-    } catch (RegSyntax rs)
-    {
-    }
-  }
-
-  ReplaceRule rep = null;
-
-  /**
-   * Create and compile both a Regex and a ReplaceRule.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#compile(java.lang.String)
-   */
-  public Regex(String s, String rp)
-  {
-    this(s);
-    rep = parsePerl.perlCode(rp);
-  }
-
-  /**
-   * Create and compile a Regex, but give it the ReplaceRule specified. This
-   * allows the user finer control of the Replacement process, if that is
-   * desired.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#compile(java.lang.String)
-   */
-  public Regex(String s, ReplaceRule rp)
-  {
-    this(s);
-    rep = rp;
-  }
-
-  /**
-   * Change the ReplaceRule of this Regex by compiling a new one using String
-   * rp.
-   */
-  public void setReplaceRule(String rp)
-  {
-    rep = parsePerl.perlCode(rp);
-    repr = null; // Clear Replacer history
-  }
-
-  /** Change the ReplaceRule of this Regex to rp. */
-  public void setReplaceRule(ReplaceRule rp)
-  {
-    rep = rp;
-  }
-
-  /**
-   * Test to see if a custom defined rule exists.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat#define(java.lang.String,java.lang.String,Validator)
-   */
-  public static boolean isDefined(String nm)
-  {
-    return validators.get(nm) != null;
-  }
-
-  /**
-   * Removes a custom defined rule.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat#define(java.lang.String,java.lang.String,Validator)
-   */
-  public static void undefine(String nm)
-  {
-    validators.remove(nm);
-  }
-
-  /**
-   * Defines a method to create a new rule. See test/deriv2.java and
-   * test/deriv3.java for examples of how to use it.
-   */
-  public static void define(String nm, String pat, Validator v)
-  {
-    v.pattern = pat;
-    validators.put(nm, v);
-  }
-
-  /**
-   * Defines a shorthand for a pattern. The pattern will be invoked by a string
-   * that has the form "(??"+nm+")".
-   */
-  public static void define(String nm, String pat)
-  {
-    validators.put(nm, pat);
-  }
-
-  /** Get the current ReplaceRule. */
-  public ReplaceRule getReplaceRule()
-  {
-    return rep;
-  }
-
-  Replacer repr = null;
-
-  final Replacer _getReplacer()
-  {
-    return repr == null ? repr = new Replacer() : repr;
-  }
-
-  public Replacer getReplacer()
-  {
-    if (repr == null)
-    {
-      repr = new Replacer();
-    }
-    repr.rh.me = this;
-    repr.rh.prev = null;
-    return repr;
-  }
-
-  /**
-   * Replace the first occurence of this pattern in String s according to the
-   * ReplaceRule.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()
-   */
-  public String replaceFirst(String s)
-  {
-    return _getReplacer().replaceFirstRegion(s, this, 0, s.length())
-            .toString();
-  }
-
-  /**
-   * Replace the first occurence of this pattern in String s beginning with
-   * position pos according to the ReplaceRule.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()
-   */
-  public String replaceFirstFrom(String s, int pos)
-  {
-    return _getReplacer().replaceFirstRegion(s, this, pos, s.length())
-            .toString();
-  }
-
-  /**
-   * Replace the first occurence of this pattern in String s beginning with
-   * position start and ending with end according to the ReplaceRule.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()
-   */
-  public String replaceFirstRegion(String s, int start, int end)
-  {
-    return _getReplacer().replaceFirstRegion(s, this, start, end)
-            .toString();
-  }
-
-  /**
-   * Replace all occurences of this pattern in String s according to the
-   * ReplaceRule.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()
-   */
-  public String replaceAll(String s)
-  {
-    return _getReplacer().replaceAllRegion(s, this, 0, s.length())
-            .toString();
-  }
-
-  public StringLike replaceAll(StringLike s)
-  {
-    return _getReplacer().replaceAllRegion(s, this, 0, s.length());
-  }
-
-  /**
-   * Replace all occurences of this pattern in String s beginning with position
-   * pos according to the ReplaceRule.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()
-   */
-  public String replaceAllFrom(String s, int pos)
-  {
-    return _getReplacer().replaceAllRegion(s, this, pos, s.length())
-            .toString();
-  }
-
-  /**
-   * Replace all occurences of this pattern in String s beginning with position
-   * start and ending with end according to the ReplaceRule.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()
-   */
-  public String replaceAllRegion(String s, int start, int end)
-  {
-    return _getReplacer().replaceAllRegion(s, this, start, end).toString();
-  }
-
-  /** Essentially clones the Regex object */
-  public Regex(Regex r)
-  {
-    super((RegRes) r);
-    dontMatchInQuotes = r.dontMatchInQuotes;
-    esc = r.esc;
-    ignoreCase = r.ignoreCase;
-    gFlag = r.gFlag;
-    if (r.rep == null)
-    {
-      rep = null;
-    }
-    else
-    {
-      rep = (ReplaceRule) r.rep.clone();
-    }
-    /*
-     * try { compile(r.toString()); } catch(RegSyntax r_) {}
-     */
-    thePattern = r.thePattern.clone(new Hashtable());
-    minMatch = r.minMatch;
-    skipper = r.skipper;
-  }
-
-  /**
-   * By default, the escape character is the backslash, but you can make it
-   * anything you want by setting this variable.
-   */
-  public char esc = Pattern.ESC;
-
-  /**
-   * This method compiles a regular expression, making it possible to call the
-   * search or matchAt methods.
-   * 
-   * @exception com.stevesoft.pat.RegSyntax
-   *                    is thrown if a syntax error is encountered in the
-   *                    pattern. For example, "x{3,1}" or "*a" are not valid
-   *                    patterns.
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#matchAt
-   */
-  public void compile(String prepat) throws RegSyntax
-  {
-    String postpat = parsePerl.codify(prepat, true);
-    String pat = postpat == null ? prepat : postpat;
-    minMatch = null;
-    ignoreCase = false;
-    dontMatchInQuotes = false;
-    Rthings mk = new Rthings(this);
-    int offset = mk.val;
-    String newpat = pat;
-    thePattern = none;
-    p = null;
-    or = null;
-    minMatch = new patInt(0);
-    StrPos sp = new StrPos(pat, 0);
-    if (sp.incMatch("(?e="))
-    {
-      char newEsc = sp.c;
-      sp.inc();
-      if (sp.match(')'))
-      {
-        newpat = reEscape(pat.substring(6), newEsc, Pattern.ESC);
-      }
-    }
-    else if (esc != Pattern.ESC)
-    {
-      newpat = reEscape(pat, esc, Pattern.ESC);
-    }
-    thePattern = _compile2(newpat, mk);
-    numSubs_ = mk.val - offset;
-    mk.set(this);
-  }
-
-  /*
-   * If a Regex is compared against a Regex, a check is done to see that the
-   * patterns are equal as well as the most recent match. If a Regex is compare
-   * with a RegRes, only the result of the most recent match is compared.
-   */
-  public boolean equals(Object o)
-  {
-    if (o instanceof Regex)
-    {
-      if (toString().equals(o.toString()))
-      {
-        return super.equals(o);
-      }
-      else
-      {
-        return false;
-      }
-    }
-    else
-    {
-      return super.equals(o);
-    }
-  }
-
-  /** A clone by any other name would smell as sweet. */
-  public Object clone()
-  {
-    return new Regex(this);
-  }
-
-  /** Return a clone of the underlying RegRes object. */
-  public RegRes result()
-  {
-    return (RegRes) super.clone();
-  }
-
-  // prep sets global variables of class
-  // Pattern so that it can access them
-  // during an attempt at a match
-  Pthings pt = new Pthings();
-
-  final Pthings prep(StringLike s)
-  {
-    // if(gFlag)
-    pt.lastPos = matchedTo();
-    if (pt.lastPos < 0)
-    {
-      pt.lastPos = 0;
-    }
-    if ((s == null ? null : s.unwrap()) != (src == null ? null : s.unwrap()))
-    {
-      pt.lastPos = 0;
-    }
-    src = s;
-    pt.dotDoesntMatchCR = dotDoesntMatchCR && (!sFlag);
-    pt.mFlag = (mFlag | defaultMFlag);
-    pt.ignoreCase = ignoreCase;
-    pt.no_check = false;
-    if (pt.marks != null)
-    {
-      for (int i = 0; i < pt.marks.length; i++)
-      {
-        pt.marks[i] = -1;
-      }
-    }
-    pt.marks = null;
-    pt.nMarks = numSubs_;
-    pt.src = s;
-    if (dontMatchInQuotes)
-    {
-      setCbits(s, pt);
-    }
-    else
-    {
-      pt.cbits = null;
-    }
-    return pt;
-  }
-
-  /**
-   * Attempt to match a Pattern beginning at a specified location within the
-   * string.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search
-   */
-  public boolean matchAt(String s, int start_pos)
-  {
-    return _search(s, start_pos, start_pos);
-  }
-
-  /**
-   * Attempt to match a Pattern beginning at a specified location within the
-   * StringLike.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search
-   */
-  public boolean matchAt(StringLike s, int start_pos)
-  {
-    return _search(s, start_pos, start_pos);
-  }
-
-  /**
-   * Search through a String for the first occurrence of a match.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#searchFrom
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#matchAt
-   */
-  public boolean search(String s)
-  {
-    if (s == null)
-    {
-      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_given_to_regex_search"));
-    }
-    return _search(s, 0, s.length());
-  }
-
-  public boolean search(StringLike sl)
-  {
-    if (sl == null)
-    {
-      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_search"));
-    }
-    return _search(sl, 0, sl.length());
-  }
-
-  public boolean reverseSearch(String s)
-  {
-    if (s == null)
-    {
-      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_given_to_regex_reverse_search"));
-    }
-    return _reverseSearch(s, 0, s.length());
-  }
-
-  public boolean reverseSearch(StringLike sl)
-  {
-    if (sl == null)
-    {
-      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search"));
-    }
-    return _reverseSearch(sl, 0, sl.length());
-  }
-
-  /**
-   * Search through a String for the first occurence of a match, but start at
-   * position
-   * 
-   * <pre>
-   * start
-   * </pre>
-   */
-  public boolean searchFrom(String s, int start)
-  {
-    if (s == null)
-    {
-      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_search_from"));
-    }
-    return _search(s, start, s.length());
-  }
-
-  public boolean searchFrom(StringLike s, int start)
-  {
-    if (s == null)
-    {
-        throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_search_from"));
-    }
-    return _search(s, start, s.length());
-  }
-
-  /**
-   * Search through a region of a String for the first occurence of a match.
-   */
-  public boolean searchRegion(String s, int start, int end)
-  {
-    if (s == null)
-    {
-      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_search_region"));
-    }
-    return _search(s, start, end);
-  }
-
-  /**
-   * Set this to change the default behavior of the "." pattern. By default it
-   * now matches perl's behavior and fails to match the '\n' character.
-   */
-  public static boolean dotDoesntMatchCR = true;
-
-  StringLike gFlags;
-
-  int gFlagto = 0;
-
-  boolean gFlag = false;
-
-  /** Set the 'g' flag */
-  public void setGFlag(boolean b)
-  {
-    gFlag = b;
-  }
-
-  /** Get the state of the 'g' flag. */
-  public boolean getGFlag()
-  {
-    return gFlag;
-  }
-
-  boolean sFlag = false;
-
-  /** Get the state of the sFlag */
-  public boolean getSFlag()
-  {
-    return sFlag;
-  }
-
-  boolean mFlag = false;
-
-  /** Get the state of the sFlag */
-  public boolean getMFlag()
-  {
-    return mFlag;
-  }
-
-  final boolean _search(String s, int start, int end)
-  {
-    return _search(new StringWrap(s), start, end);
-  }
-
-  final boolean _search(StringLike s, int start, int end)
-  {
-    if (gFlag && gFlagto > 0 && gFlags != null
-            && s.unwrap() == gFlags.unwrap())
-    {
-      start = gFlagto;
-    }
-    gFlags = null;
-
-    Pthings pt = prep(s);
-
-    int up = (minMatch == null ? end : end - minMatch.i);
-
-    if (up < start && end >= start)
-    {
-      up = start;
-    }
-
-    if (skipper == null)
-    {
-      for (int i = start; i <= up; i++)
-      {
-        charsMatched_ = thePattern.matchAt(s, i, pt);
-        if (charsMatched_ >= 0)
-        {
-          matchFrom_ = thePattern.mfrom;
-          marks = pt.marks;
-          gFlagto = matchFrom_ + charsMatched_;
-          gFlags = s;
-          return didMatch_ = true;
-        }
-      }
-    }
-    else
-    {
-      pt.no_check = true;
-      for (int i = start; i <= up; i++)
-      {
-        i = skipper.find(src, i, up);
-        if (i < 0)
-        {
-          charsMatched_ = matchFrom_ = -1;
-          return didMatch_ = false;
-        }
-        charsMatched_ = thePattern.matchAt(s, i, pt);
-        if (charsMatched_ >= 0)
-        {
-          matchFrom_ = thePattern.mfrom;
-          marks = pt.marks;
-          gFlagto = matchFrom_ + charsMatched_;
-          gFlags = s;
-          return didMatch_ = true;
-        }
-      }
-    }
-    return didMatch_ = false;
-  }
-
-  /*
-   * final boolean _search(LongStringLike s,long start,long end) { if(gFlag &&
-   * gFlagto > 0 && s==gFlags) start = gFlagto; gFlags = null;
-   * 
-   * Pthings pt=prep(s);
-   * 
-   * int up = end;//(minMatch == null ? end : end-minMatch.i);
-   * 
-   * if(up < start && end >= start) up = start;
-   * 
-   * if(skipper == null) { for(long i=start;i<=up;i++) { charsMatched_ =
-   * thePattern.matchAt(s,i,pt); if(charsMatched_ >= 0) { matchFrom_ =
-   * thePattern.mfrom; marks = pt.marks; gFlagto = matchFrom_+charsMatched_;
-   * return didMatch_=true; } } } else { pt.no_check = true; for(long i=start;i<=up;i++) {
-   * i = skipper.find(src,i,up); if(i<0) { charsMatched_ = matchFrom_ = -1;
-   * return didMatch_ = false; } charsMatched_ = thePattern.matchAt(s,i,pt);
-   * if(charsMatched_ >= 0) { matchFrom_ = thePattern.mfrom; marks = pt.marks;
-   * gFlagto = matchFrom_+charsMatched_; gFlags = s; return didMatch_=true; }
-   * else { i = s.adjustIndex(i); up = s.adjustEnd(i); } } } return
-   * didMatch_=false; }
-   */
-
-  boolean _reverseSearch(String s, int start, int end)
-  {
-    return _reverseSearch(new StringWrap(s), start, end);
-  }
-
-  boolean _reverseSearch(StringLike s, int start, int end)
-  {
-    if (gFlag && gFlagto > 0 && s.unwrap() == gFlags.unwrap())
-    {
-      end = gFlagto;
-    }
-    gFlags = null;
-    Pthings pt = prep(s);
-    for (int i = end; i >= start; i--)
-    {
-      charsMatched_ = thePattern.matchAt(s, i, pt);
-      if (charsMatched_ >= 0)
-      {
-        matchFrom_ = thePattern.mfrom;
-        marks = pt.marks;
-        gFlagto = matchFrom_ - 1;
-        gFlags = s;
-        return didMatch_ = true;
-      }
-    }
-    return didMatch_ = false;
-  }
-
-  // This routine sets the cbits variable
-  // of class Pattern. Cbits is true for
-  // the bit corresponding to a character inside
-  // a set of quotes.
-  static StringLike lasts = null;
-
-  static BitSet lastbs = null;
-
-  static void setCbits(StringLike s, Pthings pt)
-  {
-    if (s == lasts)
-    {
-      pt.cbits = lastbs;
-      return;
-    }
-    BitSet bs = new BitSet(s.length());
-    char qc = ' ';
-    boolean setBit = false;
-    for (int i = 0; i < s.length(); i++)
-    {
-      if (setBit)
-      {
-        bs.set(i);
-      }
-      char c = s.charAt(i);
-      if (!setBit && c == '"')
-      {
-        qc = c;
-        setBit = true;
-        bs.set(i);
-      }
-      else if (!setBit && c == '\'')
-      {
-        qc = c;
-        setBit = true;
-        bs.set(i);
-      }
-      else if (setBit && c == qc)
-      {
-        setBit = false;
-      }
-      else if (setBit && c == '\\' && i + 1 < s.length())
-      {
-        i++;
-        if (setBit)
-        {
-          bs.set(i);
-        }
-      }
-    }
-    pt.cbits = lastbs = bs;
-    lasts = s;
-  }
-
-  // Wanted user to over-ride this in alpha version,
-  // but it wasn't really necessary because of this trick:
-  Regex newRegex()
-  {
-    try
-    {
-      return (Regex) getClass().newInstance();
-    } catch (InstantiationException ie)
-    {
-      return null;
-    } catch (IllegalAccessException iae)
-    {
-      return null;
-    }
-  }
-
-  /**
-   * Only needed for creating your own extensions of Regex. This method adds the
-   * next Pattern in the chain of patterns or sets the Pattern if it is the
-   * first call.
-   */
-  protected void add(Pattern p2)
-  {
-    if (p == null)
-    {
-      p = p2;
-    }
-    else
-    {
-      p.add(p2);
-      p2 = p;
-    }
-  }
-
-  /**
-   * You only need to use this method if you are creating your own extentions to
-   * Regex. compile1 compiles one Pattern element, it can be over-ridden to
-   * allow the Regex compiler to understand new syntax. See deriv.java for an
-   * example. This routine is the heart of class Regex. Rthings has one integer
-   * member called intValue, it is used to keep track of the number of ()'s in
-   * the Pattern.
-   * 
-   * @exception com.stevesoft.pat.RegSyntax
-   *                    is thrown when a nonsensensical pattern is supplied. For
-   *                    example, a pattern beginning with *.
-   */
-  protected void compile1(StrPos sp, Rthings mk) throws RegSyntax
-  {
-    if (sp.match('['))
-    {
-      sp.inc();
-      add(matchBracket(sp));
-    }
-    else if (sp.match('|'))
-    {
-      if (or == null)
-      {
-        or = new Or();
-      }
-      if (p == null)
-      {
-        p = new NullPattern();
-      }
-      or.addOr(p);
-      p = null;
-    }
-    else if (sp.incMatch("(?<"))
-    {
-      patInt i = sp.getPatInt();
-      if (i == null)
-      {
-        RegSyntaxError.endItAll("No int after (?<");
-      }
-      add(new Backup(i.intValue()));
-      if (!sp.match(')'))
-      {
-        RegSyntaxError.endItAll("No ) after (?<");
-      }
-    }
-    else if (sp.incMatch("(?>"))
-    {
-      patInt i = sp.getPatInt();
-      if (i == null)
-      {
-        RegSyntaxError.endItAll("No int after (?>");
-      }
-      add(new Backup(-i.intValue()));
-      if (!sp.match(')'))
-      {
-        RegSyntaxError.endItAll("No ) after (?<");
-      }
-    }
-    else if (sp.incMatch("(?@"))
-    {
-      char op = sp.c;
-      sp.inc();
-      char cl = sp.c;
-      sp.inc();
-      if (!sp.match(')'))
-      {
-        RegSyntaxError.endItAll("(?@ does not have closing paren");
-      }
-      add(new Group(op, cl));
-    }
-    else if (sp.incMatch("(?#"))
-    {
-      while (!sp.match(')'))
-      {
-        sp.inc();
-      }
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'w')
-    {
-      // Regex r = new Regex();
-      // r._compile("[a-zA-Z0-9_]",mk);
-      // add(new Goop("\\w",r.thePattern));
-      Bracket b = new Bracket(false);
-      b.addOr(new Range('a', 'z'));
-      b.addOr(new Range('A', 'Z'));
-      b.addOr(new Range('0', '9'));
-      b.addOr(new oneChar('_'));
-      add(b);
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'G')
-    {
-      add(new BackG());
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 's')
-    {
-      // Regex r = new Regex();
-      // r._compile("[ \t\n\r\b]",mk);
-      // add(new Goop("\\s",r.thePattern));
-      Bracket b = new Bracket(false);
-      b.addOr(new oneChar((char) 32));
-      b.addOr(new Range((char) 8, (char) 10));
-      b.addOr(new oneChar((char) 13));
-      add(b);
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'd')
-    {
-      // Regex r = new Regex();
-      // r._compile("[0-9]",mk);
-      // add(new Goop("\\d",r.thePattern));
-      Range digit = new Range('0', '9');
-      digit.printBrackets = true;
-      add(digit);
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'W')
-    {
-      // Regex r = new Regex();
-      // r._compile("[^a-zA-Z0-9_]",mk);
-      // add(new Goop("\\W",r.thePattern));
-      Bracket b = new Bracket(true);
-      b.addOr(new Range('a', 'z'));
-      b.addOr(new Range('A', 'Z'));
-      b.addOr(new Range('0', '9'));
-      b.addOr(new oneChar('_'));
-      add(b);
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'S')
-    {
-      // Regex r = new Regex();
-      // r._compile("[^ \t\n\r\b]",mk);
-      // add(new Goop("\\S",r.thePattern));
-      Bracket b = new Bracket(true);
-      b.addOr(new oneChar((char) 32));
-      b.addOr(new Range((char) 8, (char) 10));
-      b.addOr(new oneChar((char) 13));
-      add(b);
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'D')
-    {
-      // Regex r = new Regex();
-      // r._compile("[^0-9]",mk);
-      // add(new Goop("\\D",r.thePattern));
-      Bracket b = new Bracket(true);
-      b.addOr(new Range('0', '9'));
-      add(b);
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'B')
-    {
-      Regex r = new Regex();
-      r._compile2("(?!" + back_slash + "b)", mk);
-      add(r.thePattern);
-    }
-    else if (isOctalString(sp))
-    {
-      int d = sp.c - '0';
-      sp.inc();
-      d = 8 * d + sp.c - '0';
-      StrPos sp2 = new StrPos(sp);
-      sp2.inc();
-      if (isOctalDigit(sp2, false))
-      {
-        sp.inc();
-        d = 8 * d + sp.c - '0';
-      }
-      add(new oneChar((char) d));
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c >= '1' && sp.c <= '9')
-    {
-      int iv = sp.c - '0';
-      StrPos s2 = new StrPos(sp);
-      s2.inc();
-      if (!s2.dontMatch && s2.c >= '0' && s2.c <= '9')
-      {
-        iv = 10 * iv + (s2.c - '0');
-        sp.inc();
-      }
-      add(new BackMatch(iv));
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'b')
-    {
-      add(new Boundary());
-    }
-    else if (sp.match('\b'))
-    {
-      add(new Boundary());
-    }
-    else if (sp.match('$'))
-    {
-      add(new End(true));
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'Z')
-    {
-      add(new End(false));
-    }
-    else if (sp.match('.'))
-    {
-      add(new Any());
-    }
-    else if (sp.incMatch("(??"))
-    {
-      javajs.util.SB sb = new javajs.util.SB();
-      javajs.util.SB sb2 = new javajs.util.SB();
-      while (!sp.match(')') && !sp.match(':'))
-      {
-        sb.appendC(sp.c);
-        sp.inc();
-      }
-      if (sp.incMatch(":"))
-      {
-        while (!sp.match(')'))
-        {
-          sb2.appendC(sp.c);
-          sp.inc();
-        }
-      }
-      String sbs = sb.toString();
-      if (validators.get(sbs) instanceof String)
-      {
-        String pat = (String) validators.get(sbs);
-        Regex r = newRegex();
-        Rthings rth = new Rthings(this);
-        rth.noBackRefs = true;
-        r._compile2(pat, rth);
-        add(r.thePattern);
-      }
-      else
-      {
-        Custom cm = new Custom(sb.toString());
-        if (cm.v != null)
-        {
-          Validator v2 = cm.v.arg(sb2.toString());
-          if (v2 != null)
-          {
-            v2.argsave = sb2.toString();
-            String p = cm.v.pattern;
-            cm.v = v2;
-            v2.pattern = p;
-          }
-          Regex r = newRegex();
-          Rthings rth = new Rthings(this);
-          rth.noBackRefs = true;
-          r._compile2(cm.v.pattern, rth);
-          cm.sub = r.thePattern;
-          cm.sub.add(new CustomEndpoint(cm));
-          cm.sub.setParent(cm);
-          add(cm);
-        }
-      }
-    }
-    else if (sp.match('('))
-    {
-      mk.parenLevel++;
-      Regex r = newRegex();
-      // r.or = new Or();
-      sp.inc();
-      if (sp.incMatch("?:"))
-      {
-        r.or = new Or();
-      }
-      else if (sp.incMatch("?="))
-      {
-        r.or = new lookAhead(false);
-      }
-      else if (sp.incMatch("?!"))
-      {
-        r.or = new lookAhead(true);
-      }
-      else if (sp.match('?'))
-      {
-        sp.inc();
-        do
-        {
-          if (sp.c == 'i')
-          {
-            mk.ignoreCase = true;
-          }
-          if (sp.c == 'Q')
-          {
-            mk.dontMatchInQuotes = true;
-          }
-          if (sp.c == 'o')
-          {
-            mk.optimizeMe = true;
-          }
-          if (sp.c == 'g')
-          {
-            mk.gFlag = true;
-          }
-          if (sp.c == 's')
-          {
-            mk.sFlag = true;
-          }
-          if (sp.c == 'm')
-          {
-            mk.mFlag = true;
-          }
-          sp.inc();
-        } while (!sp.match(')') && !sp.eos);
-        r = null;
-        mk.parenLevel--;
-        if (sp.eos) // throw new RegSyntax
-        {
-          RegSyntaxError.endItAll("Unclosed ()");
-        }
-      }
-      else
-      { // just ordinary parenthesis
-        r.or = mk.noBackRefs ? new Or() : new OrMark(mk.val++);
-      }
-      if (r != null)
-      {
-        add(r._compile1(sp, mk));
-      }
-    }
-    else if (sp.match('^'))
-    {
-      add(new Start(true));
-    }
-    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'A')
-    {
-      add(new Start(false));
-    }
-    else if (sp.match('*'))
-    {
-      addMulti(new patInt(0), new patInf());
-    }
-    else if (sp.match('+'))
-    {
-      addMulti(new patInt(1), new patInf());
-    }
-    else if (sp.match('?'))
-    {
-      addMulti(new patInt(0), new patInt(1));
-    }
-    else if (sp.match('{'))
-    {
-      boolean bad = false;
-      StrPos sp2 = new StrPos(sp);
-      // javajs.util.SB sb = new javajs.util.SB();
-      sp.inc();
-      patInt i1 = sp.getPatInt();
-      patInt i2 = null;
-      if (sp.match('}'))
-      {
-        i2 = i1;
-      }
-      else
-      {
-        if (!sp.match(','))
-        {
-          /*
-           * RegSyntaxError.endItAll( "String \"{"+i2+ "\" should be followed
-           * with , or }");
-           */
-          bad = true;
-        }
-        sp.inc();
-        if (sp.match('}'))
-        {
-          i2 = new patInf();
-        }
-        else
-        {
-          i2 = sp.getPatInt();
-        }
-      }
-      if (i1 == null || i2 == null)
-      {
-        /*
-         * throw new RegSyntax("Badly formatted Multi: " +"{"+i1+","+i2+"}");
-         */
-        bad = true;
-      }
-      if (bad)
-      {
-        sp.dup(sp2);
-        add(new oneChar(sp.c));
-      }
-      else
-      {
-        addMulti(i1, i2);
-      }
-    }
-    else if (sp.escMatch('x') && next2Hex(sp))
-    {
-      sp.inc();
-      int d = getHexDigit(sp);
-      sp.inc();
-      d = 16 * d + getHexDigit(sp);
-      add(new oneChar((char) d));
-    }
-    else if (sp.escMatch('c'))
-    {
-      sp.inc();
-      if (sp.c < Ctrl.cmap.length)
-      {
-        add(new oneChar(Ctrl.cmap[sp.c]));
-      }
-      else
-      {
-        add(new oneChar(sp.c));
-      }
-    }
-    else if (sp.escMatch('f'))
-    {
-      add(new oneChar((char) 12));
-    }
-    else if (sp.escMatch('a'))
-    {
-      add(new oneChar((char) 7));
-    }
-    else if (sp.escMatch('t'))
-    {
-      add(new oneChar('\t'));
-    }
-    else if (sp.escMatch('n'))
-    {
-      add(new oneChar('\n'));
-    }
-    else if (sp.escMatch('r'))
-    {
-      add(new oneChar('\r'));
-    }
-    else if (sp.escMatch('b'))
-    {
-      add(new oneChar('\b'));
-    }
-    else if (sp.escMatch('e'))
-    {
-      add(new oneChar((char) 27));
-    }
-    else
-    {
-      add(new oneChar(sp.c));
-      if (sp.match(')'))
-      {
-        RegSyntaxError.endItAll("Unmatched right paren in pattern");
-      }
-    }
-  }
-
-  // compiles all Pattern elements, internal method
-  private Pattern _compile2(String pat, Rthings mk) throws RegSyntax
-  {
-    minMatch = null;
-    sFlag = mFlag = ignoreCase = gFlag = false;
-    StrPos sp = new StrPos(pat, 0);
-    thePattern = _compile1(sp, mk);
-    pt.marks = null;
-    return thePattern;
-  }
-
-  Pattern p = null;
-
-  Or or = null;
-
-  Pattern _compile1(StrPos sp, Rthings mk) throws RegSyntax
-  {
-    while (!(sp.eos || (or != null && sp.match(')'))))
-    {
-      compile1(sp, mk);
-      sp.inc();
-    }
-    if (sp.match(')'))
-    {
-      mk.parenLevel--;
-    }
-    else if (sp.eos && mk.parenLevel != 0)
-    {
-      RegSyntaxError.endItAll("Unclosed Parenthesis! lvl=" + mk.parenLevel);
-    }
-    if (or != null)
-    {
-      if (p == null)
-      {
-        p = new NullPattern();
-      }
-      or.addOr(p);
-      return or;
-    }
-    return p == null ? new NullPattern() : p;
-  }
-
-  // add a multi object to the end of the chain
-  // which applies to the last object
-  void addMulti(patInt i1, patInt i2) throws RegSyntax
-  {
-    Pattern last, last2;
-    for (last = p; last != null && last.next != null; last = last.next)
-    {
-      ;
-    }
-    if (last == null || last == p)
-    {
-      last2 = null;
-    }
-    else
-    {
-      for (last2 = p; last2.next != last; last2 = last2.next)
-      {
-        ;
-      }
-    }
-    if (last instanceof Multi && i1.intValue() == 0 && i2.intValue() == 1)
-    {
-      ((Multi) last).matchFewest = true;
-    }
-    else if (last instanceof FastMulti && i1.intValue() == 0
-            && i2.intValue() == 1)
-    {
-      ((FastMulti) last).matchFewest = true;
-    }
-    else if (last instanceof DotMulti && i1.intValue() == 0
-            && i2.intValue() == 1)
-    {
-      ((DotMulti) last).matchFewest = true;
-    }
-    else if (last instanceof Multi || last instanceof DotMulti
-            || last instanceof FastMulti)
-    {
-      throw new RegSyntax("Syntax error.");
-    }
-    else if (last2 == null)
-    {
-      p = mkMulti(i1, i2, p);
-    }
-    else
-    {
-      last2.next = mkMulti(i1, i2, last);
-    }
-  }
-
-  final static Pattern mkMulti(patInt lo, patInt hi, Pattern p)
-          throws RegSyntax
-  {
-    if (p instanceof Any && p.next == null)
-    {
-      return (Pattern) new DotMulti(lo, hi);
-    }
-    return RegOpt.safe4fm(p) ? (Pattern) new FastMulti(lo, hi, p)
-            : (Pattern) new Multi(lo, hi, p);
-  }
-
-  // process the bracket operator
-  Pattern matchBracket(StrPos sp) throws RegSyntax
-  {
-    Bracket ret;
-    if (sp.match('^'))
-    {
-      ret = new Bracket(true);
-      sp.inc();
-    }
-    else
-    {
-      ret = new Bracket(false);
-    }
-    if (sp.match(']'))
-    {
-      // throw new RegSyntax
-      RegSyntaxError.endItAll("Unmatched []");
-    }
-
-    while (!sp.eos && !sp.match(']'))
-    {
-      StrPos s1 = new StrPos(sp);
-      s1.inc();
-      StrPos s1_ = new StrPos(s1);
-      s1_.inc();
-      if (s1.match('-') && !s1_.match(']'))
-      {
-        StrPos s2 = new StrPos(s1);
-        s2.inc();
-        if (!s2.eos)
-        {
-          ret.addOr(new Range(sp.c, s2.c));
-        }
-        sp.inc();
-        sp.inc();
-      }
-      else if (sp.escMatch('Q'))
-      {
-        sp.inc();
-        while (!sp.escMatch('E'))
-        {
-          ret.addOr(new oneChar(sp.c));
-          sp.inc();
-        }
-      }
-      else if (sp.escMatch('d'))
-      {
-        ret.addOr(new Range('0', '9'));
-      }
-      else if (sp.escMatch('s'))
-      {
-        ret.addOr(new oneChar((char) 32));
-        ret.addOr(new Range((char) 8, (char) 10));
-        ret.addOr(new oneChar((char) 13));
-      }
-      else if (sp.escMatch('w'))
-      {
-        ret.addOr(new Range('a', 'z'));
-        ret.addOr(new Range('A', 'Z'));
-        ret.addOr(new Range('0', '9'));
-        ret.addOr(new oneChar('_'));
-      }
-      else if (sp.escMatch('D'))
-      {
-        ret.addOr(new Range((char) 0, (char) 47));
-        ret.addOr(new Range((char) 58, (char) 65535));
-      }
-      else if (sp.escMatch('S'))
-      {
-        ret.addOr(new Range((char) 0, (char) 7));
-        ret.addOr(new Range((char) 11, (char) 12));
-        ret.addOr(new Range((char) 14, (char) 31));
-        ret.addOr(new Range((char) 33, (char) 65535));
-      }
-      else if (sp.escMatch('W'))
-      {
-        ret.addOr(new Range((char) 0, (char) 64));
-        ret.addOr(new Range((char) 91, (char) 94));
-        ret.addOr(new oneChar((char) 96));
-        ret.addOr(new Range((char) 123, (char) 65535));
-      }
-      else if (sp.escMatch('x') && next2Hex(sp))
-      {
-        sp.inc();
-        int d = getHexDigit(sp);
-        sp.inc();
-        d = 16 * d + getHexDigit(sp);
-        ret.addOr(new oneChar((char) d));
-      }
-      else if (sp.escMatch('a'))
-      {
-        ret.addOr(new oneChar((char) 7));
-      }
-      else if (sp.escMatch('f'))
-      {
-        ret.addOr(new oneChar((char) 12));
-      }
-      else if (sp.escMatch('e'))
-      {
-        ret.addOr(new oneChar((char) 27));
-      }
-      else if (sp.escMatch('n'))
-      {
-        ret.addOr(new oneChar('\n'));
-      }
-      else if (sp.escMatch('t'))
-      {
-        ret.addOr(new oneChar('\t'));
-      }
-      else if (sp.escMatch('r'))
-      {
-        ret.addOr(new oneChar('\r'));
-      }
-      else if (sp.escMatch('c'))
-      {
-        sp.inc();
-        if (sp.c < Ctrl.cmap.length)
-        {
-          ret.addOr(new oneChar(Ctrl.cmap[sp.c]));
-        }
-        else
-        {
-          ret.addOr(new oneChar(sp.c));
-        }
-      }
-      else if (isOctalString(sp))
-      {
-        int d = sp.c - '0';
-        sp.inc();
-        d = 8 * d + sp.c - '0';
-        StrPos sp2 = new StrPos(sp);
-        sp2.inc();
-        if (isOctalDigit(sp2, false))
-        {
-          sp.inc();
-          d = 8 * d + sp.c - '0';
-        }
-        ret.addOr(new oneChar((char) d));
-      }
-      else
-      {
-        ret.addOr(new oneChar(sp.c));
-      }
-      sp.inc();
-    }
-    return ret;
-  }
-
-  /**
-   * Converts the stored Pattern to a String -- this is a decompile. Note that
-   * \t and \n will really print out here, Not just the two character
-   * representations. Also be prepared to see some strange output if your
-   * characters are not printable.
-   */
-  public String toString()
-  {
-    if (false && thePattern == null)
-    {
-      return "";
-    }
-    else
-    {
-      javajs.util.SB sb = new javajs.util.SB();
-      if (esc != Pattern.ESC)
-      {
-        sb.append("(?e=");
-        sb.appendC(esc);
-        sb.append(")");
-      }
-      if (gFlag || mFlag || !dotDoesntMatchCR || sFlag || ignoreCase
-              || dontMatchInQuotes || optimized())
-      {
-        sb.append("(?");
-        if (ignoreCase)
-        {
-          sb.append("i");
-        }
-        if (mFlag)
-        {
-          sb.append("m");
-        }
-        if (sFlag || !dotDoesntMatchCR)
-        {
-          sb.append("s");
-        }
-        if (dontMatchInQuotes)
-        {
-          sb.append("Q");
-        }
-        if (optimized())
-        {
-          sb.append("o");
-        }
-        if (gFlag)
-        {
-          sb.append("g");
-        }
-        sb.append(")");
-      }
-      String patstr = thePattern.toString();
-      if (esc != Pattern.ESC)
-      {
-        patstr = reEscape(patstr, Pattern.ESC, esc);
-      }
-      sb.append(patstr);
-      return sb.toString();
-    }
-  }
-
-  // Re-escape Pattern, allows us to use a different escape
-  // character.
-  static String reEscape(String s, char oldEsc, char newEsc)
-  {
-    if (oldEsc == newEsc)
-    {
-      return s;
-    }
-    int i;
-    javajs.util.SB sb = new javajs.util.SB();
-    for (i = 0; i < s.length(); i++)
-    {
-      if (s.charAt(i) == oldEsc && i + 1 < s.length())
-      {
-        if (s.charAt(i + 1) == oldEsc)
-        {
-          sb.appendC(oldEsc);
-        }
-        else
-        {
-          sb.appendC(newEsc);
-          sb.appendC(s.charAt(i + 1));
-        }
-        i++;
-      }
-      else if (s.charAt(i) == newEsc)
-      {
-        sb.appendC(newEsc);
-        sb.appendC(newEsc);
-      }
-      else
-      {
-        sb.appendC(s.charAt(i));
-      }
-    }
-    return sb.toString();
-  }
-
-//  /**
-//   * This method implements FilenameFilter, allowing one to use a Regex to
-//   * search through a directory using File.list. There is a FileRegex now that
-//   * does this better.
-//   * 
-//   * @see com.stevesoft.pat.FileRegex
-//   */
-//  public boolean accept(File dir, String s)
-//  {
-//    return search(s);
-//  }
-
-  /** The version of this package */
-  final static public String version()
-  {
-    return "lgpl release 1.5.3";
-  }
-
-  /**
-   * Once this method is called, the state of variables ignoreCase and
-   * dontMatchInQuotes should not be changed as the results will be
-   * unpredictable. However, search and matchAt will run more quickly. Note that
-   * you can check to see if the pattern has been optimized by calling the
-   * optimized() method.
-   * <p>
-   * This method will attempt to rewrite your pattern in a way that makes it
-   * faster (not all patterns execute at the same speed). In general, "(?: ... )"
-   * will be faster than "( ... )" so if you don't need the backreference, you
-   * should group using the former pattern.
-   * <p>
-   * It will also introduce new pattern elements that you can't get to
-   * otherwise, for example if you have a large table of strings, i.e. the
-   * months of the year "(January|February|...)" optimize() will make a
-   * Hashtable that takes it to the next appropriate pattern element --
-   * eliminating the need for a linear search.
-   * 
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#optimized
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#ignoreCase
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#dontMatchInQuotes
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#matchAt
-   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search
-   */
-  public void optimize()
-  {
-    if (optimized() || thePattern == null)
-    {
-      return;
-    }
-    minMatch = new patInt(0); // thePattern.countMinChars();
-    thePattern = RegOpt.opt(thePattern, ignoreCase, dontMatchInQuotes);
-    skipper = Skip.findSkip(this);
-    // RegOpt.setParents(this);
-    return;
-  }
-
-  Skip skipper;
-
-  /**
-   * This function returns true if the optimize method has been called.
-   */
-  public boolean optimized()
-  {
-    return minMatch != null;
-  }
-
-  /**
-   * A bit of syntactic surgar for those who want to make their code look more
-   * perl-like. To use this initialize your Regex object by saying:
-   * 
-   * <pre>
-   *       Regex r1 = Regex.perlCode(&quot;s/hello/goodbye/&quot;);
-   *       Regex r2 = Regex.perlCode(&quot;s'fish'frog'i&quot;);
-   *       Regex r3 = Regex.perlCode(&quot;m'hello');
-   * </pre>
-   * 
-   * The i for ignoreCase is supported in this syntax, as well as m, s, and x.
-   * The g flat is a bit of a special case.
-   * <p>
-   * If you wish to replace all occurences of a pattern, you do not put a 'g' in
-   * the perlCode, but call Regex's replaceAll method.
-   * <p>
-   * If you wish to simply and only do a search for r2's pattern, you can do
-   * this by calling the searchFrom method method repeatedly, or by calling
-   * search repeatedly if the g flag is set.
-   * <p>
-   * Note: Currently perlCode does <em>not</em> support the (?e=#) syntax for
-   * changing the escape character.
-   */
-
-  public static Regex perlCode(String s)
-  {
-    // this file is big enough, see parsePerl.java
-    // for this function.
-    return parsePerl.parse(s);
-  }
-
-  static final char back_slash = '\\';
-
-  /**
-   * Checks to see if there are only literal and no special pattern elements in
-   * this Regex.
-   */
-  public boolean isLiteral()
-  {
-    Pattern x = thePattern;
-    while (x != null)
-    {
-      if (x instanceof oneChar)
-      {
-        ;
-      }
-      else if (x instanceof Skipped)
-      {
-        ;
-      }
-      else
-      {
-        return false;
-      }
-      x = x.next;
-    }
-    return true;
-  }
-
-  /**
-   * You only need to know about this if you are inventing your own pattern
-   * elements.
-   */
-  public patInt countMinChars()
-  {
-    return thePattern.countMinChars();
-  }
-
-  /**
-   * You only need to know about this if you are inventing your own pattern
-   * elements.
-   */
-  public patInt countMaxChars()
-  {
-    return thePattern.countMaxChars();
-  }
-
-  boolean isHexDigit(StrPos sp)
-  {
-    boolean r = !sp.eos
-            && !sp.dontMatch
-            && ((sp.c >= '0' && sp.c <= '9')
-                    || (sp.c >= 'a' && sp.c <= 'f') || (sp.c >= 'A' && sp.c <= 'F'));
-    return r;
-  }
-
-  boolean isOctalDigit(StrPos sp, boolean first)
-  {
-    boolean r = !sp.eos && !(first ^ sp.dontMatch) && sp.c >= '0'
-            && sp.c <= '7';
-    return r;
-  }
-
-  int getHexDigit(StrPos sp)
-  {
-    if (sp.c >= '0' && sp.c <= '9')
-    {
-      return sp.c - '0';
-    }
-    if (sp.c >= 'a' && sp.c <= 'f')
-    {
-      return sp.c - 'a' + 10;
-    }
-    return sp.c - 'A' + 10;
-  }
-
-  boolean next2Hex(StrPos sp)
-  {
-    StrPos sp2 = new StrPos(sp);
-    sp2.inc();
-    if (!isHexDigit(sp2))
-    {
-      return false;
-    }
-    sp2.inc();
-    if (!isHexDigit(sp2))
-    {
-      return false;
-    }
-    return true;
-  }
-
-  boolean isOctalString(StrPos sp)
-  {
-    if (!isOctalDigit(sp, true))
-    {
-      return false;
-    }
-    StrPos sp2 = new StrPos(sp);
-    sp2.inc();
-    if (!isOctalDigit(sp2, false))
-    {
-      return false;
-    }
-    return true;
-  }
-}
+//\r
+// This software is now distributed according to\r
+// the Lesser Gnu Public License.  Please see\r
+// http://www.gnu.org/copyleft/lesser.txt for\r
+// the details.\r
+//    -- Happy Computing!\r
+//\r
+package com.stevesoft.pat;\r
+\r
+import jalview.util.MessageManager;\r
+\r
+import java.util.BitSet;\r
+import java.util.Hashtable;\r
+\r
+import com.stevesoft.pat.wrap.StringWrap;\r
+\r
+/** Matches a Unicode punctuation character. */\r
+class UnicodePunct extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && Prop.isPunct(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a Unicode white space character. */\r
+class UnicodeWhite extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && Prop.isWhite(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/**\r
+ * Matches a character that is not a Unicode punctuation character.\r
+ */\r
+class NUnicodePunct extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && !Prop.isPunct(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/**\r
+ * Matches a character that is not a Unicode white space character.\r
+ */\r
+class NUnicodeWhite extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && !Prop.isWhite(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a Unicode word character: an alphanumeric or underscore. */\r
+class UnicodeW extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    if (from >= s.length())\r
+    {\r
+      return -1;\r
+    }\r
+    char c = s.charAt(from);\r
+    return (Prop.isAlphabetic(c) || Prop.isDecimalDigit(c) || c == '_') ? to\r
+            : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a character that is not a Unicode alphanumeric or underscore. */\r
+class NUnicodeW extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    if (from >= s.length())\r
+    {\r
+      return -1;\r
+    }\r
+    char c = s.charAt(from);\r
+    return !(Prop.isAlphabetic(c) || Prop.isDecimalDigit(c) || c == '_') ? to\r
+            : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a Unicode decimal digit. */\r
+class UnicodeDigit extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && Prop.isDecimalDigit(s.charAt(from)) ? to\r
+            : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a character that is not a Unicode digit. */\r
+class NUnicodeDigit extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && !Prop.isDecimalDigit(s.charAt(from)) ? to\r
+            : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a Unicode math character. */\r
+class UnicodeMath extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && Prop.isMath(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a non-math Unicode character. */\r
+class NUnicodeMath extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && !Prop.isMath(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a Unicode currency symbol. */\r
+class UnicodeCurrency extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && Prop.isCurrency(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a non-currency symbol Unicode character. */\r
+class NUnicodeCurrency extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && !Prop.isCurrency(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a Unicode alphabetic character. */\r
+class UnicodeAlpha extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && Prop.isAlphabetic(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches a non-alphabetic Unicode character. */\r
+class NUnicodeAlpha extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && !Prop.isAlphabetic(s.charAt(from)) ? to\r
+            : -1;\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches an upper case Unicode character. */\r
+class UnicodeUpper extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && isUpper(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+\r
+  final boolean isUpper(char c)\r
+  {\r
+    return c == CaseMgr.toUpperCase(c) && c != CaseMgr.toLowerCase(c);\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/** Matches an upper case Unicode character. */\r
+class UnicodeLower extends UniValidator\r
+{\r
+  public int validate(StringLike s, int from, int to)\r
+  {\r
+    return from < s.length() && isLower(s.charAt(from)) ? to : -1;\r
+  }\r
+\r
+  final boolean isLower(char c)\r
+  {\r
+    return c != CaseMgr.toUpperCase(c) && c == CaseMgr.toLowerCase(c);\r
+  }\r
+}\r
+\r
+/**\r
+ * Regex provides the parser which constructs the linked list of Pattern classes\r
+ * from a String.\r
+ * <p>\r
+ * For the purpose of this documentation, the fact that java interprets the\r
+ * backslash will be ignored. In practice, however, you will need a double\r
+ * backslash to obtain a string that contains a single backslash character.\r
+ * Thus, the example pattern "\b" should really be typed as "\\b" inside java\r
+ * code.\r
+ * <p>\r
+ * Note that Regex is part of package "com.stevesoft.pat". To use it, simply\r
+ * import com.stevesoft.pat.Regex at the top of your file.\r
+ * <p>\r
+ * Regex is made with a constructor that takes a String that defines the regular\r
+ * expression. Thus, for example\r
+ * \r
+ * <pre>\r
+ * Regex r = new Regex(&quot;[a-c]*&quot;);\r
+ * </pre>\r
+ * \r
+ * matches any number of characters so long as the are 'a', 'b', or 'c').\r
+ * <p>\r
+ * To attempt to match the Pattern to a given string, you can use either the\r
+ * search(String) member function, or the matchAt(String,int position) member\r
+ * function. These functions return a boolean which tells you whether or not the\r
+ * thing worked, and sets the methods "charsMatched()" and "matchedFrom()" in\r
+ * the Regex object appropriately.\r
+ * <p>\r
+ * The portion of the string before the match can be obtained by the left()\r
+ * member, and the portion after the match can be obtained by the right()\r
+ * member.\r
+ * <p>\r
+ * Essentially, this package implements a syntax that is very much like the perl\r
+ * 5 regular expression syntax.\r
+ * \r
+ * Longer example:\r
+ * \r
+ * <pre>\r
+ * Regex r = new Regex(&quot;x(a|b)y&quot;);\r
+ * r.matchAt(&quot;xay&quot;, 0);\r
+ * System.out.println(&quot;sub = &quot; + r.stringMatched(1));\r
+ * </pre>\r
+ * \r
+ * The above would print "sub = a".\r
+ * \r
+ * <pre>\r
+ *  r.left() // would return &quot;x&quot;\r
+ *  r.right() // would return &quot;y&quot;\r
+ * </pre>\r
+ * \r
+ * <p>\r
+ * Differences between this package and perl5:<br>\r
+ * The extended Pattern for setting flags, is now supported, but the flags are\r
+ * different. "(?i)" tells the pattern to ignore case, "(?Q)" sets the\r
+ * "dontMatchInQuotes" flag, and "(?iQ)" sets them both. You can change the\r
+ * escape character. The pattern\r
+ * \r
+ * <pre>\r
+ * (?e=#)#d+\r
+ * </pre>\r
+ * \r
+ * is the same as\r
+ * \r
+ * <pre>\r
+ * \d+\r
+ * </pre>, but note that the sequence\r
+ * \r
+ * <pre>\r
+ * (?e=#)\r
+ * </pre>\r
+ * \r
+ * <b>must</b> occur at the very beginning of the pattern. There may be other\r
+ * small differences as well. I will either make my package conform or note them\r
+ * as I become aware of them.\r
+ * <p>\r
+ * This package supports additional patterns not in perl5: <center> <table\r
+ * border=1>\r
+ * <tr>\r
+ * <td>(?@())</td>\r
+ * <td>Group</td>\r
+ * <td>This matches all characters between the '(' character and the balancing\r
+ * ')' character. Thus, it will match "()" as well as "(())". The balancing\r
+ * characters are arbitrary, thus (?@{}) matches on "{}" and "{{}}".</td>\r
+ * <tr>\r
+ * <td>(?&lt1)</td>\r
+ * <td>Backup</td>\r
+ * <td>Moves the pointer backwards within the text. This allows you to make a\r
+ * "look behind." It fails if it attempts to move to a position before the\r
+ * beginning of the string. "x(?&lt1)" is equivalent to "(?=x)". The number, 1\r
+ * in this example, is the number of characters to move backwards.</td>\r
+ * </table> </center>\r
+ * </dl>\r
+ * \r
+ * @author Steven R. Brandt\r
+ * @version package com.stevesoft.pat, release 1.5.3\r
+ * @see Pattern\r
+ */\r
+public class Regex extends RegRes// implements FilenameFilter\r
+{\r
+  /**\r
+   * BackRefOffset gives the identity number of the first pattern. Version 1.0\r
+   * used zero, version 1.1 uses 1 to be more compatible with perl.\r
+   */\r
+  static int BackRefOffset = 1;\r
+\r
+  private static Pattern none = new NoPattern();\r
+\r
+  Pattern thePattern = none;\r
+\r
+  patInt minMatch = new patInt(0);\r
+\r
+  static Hashtable validators = new Hashtable();\r
+  static\r
+  {\r
+    define("p", "(?>1)", new UnicodePunct());\r
+    define("P", "(?>1)", new NUnicodePunct());\r
+    define("s", "(?>1)", new UnicodeWhite());\r
+    define("S", "(?>1)", new NUnicodeWhite());\r
+    define("w", "(?>1)", new UnicodeW());\r
+    define("W", "(?>1)", new NUnicodeW());\r
+    define("d", "(?>1)", new UnicodeDigit());\r
+    define("D", "(?>1)", new NUnicodeDigit());\r
+    define("m", "(?>1)", new UnicodeMath());\r
+    define("M", "(?>1)", new NUnicodeMath());\r
+    define("c", "(?>1)", new UnicodeCurrency());\r
+    define("C", "(?>1)", new NUnicodeCurrency());\r
+    define("a", "(?>1)", new UnicodeAlpha());\r
+    define("A", "(?>1)", new NUnicodeAlpha());\r
+    define("uc", "(?>1)", new UnicodeUpper());\r
+    define("lc", "(?>1)", new UnicodeLower());\r
+  }\r
+\r
+  /** Set the dontMatch in quotes flag. */\r
+  public void setDontMatchInQuotes(boolean b)\r
+  {\r
+    dontMatchInQuotes = b;\r
+  }\r
+\r
+  /** Find out if the dontMatchInQuotes flag is enabled. */\r
+  public boolean getDontMatchInQuotes()\r
+  {\r
+    return dontMatchInQuotes;\r
+  }\r
+\r
+  boolean dontMatchInQuotes = false;\r
+\r
+  /**\r
+   * Set the state of the ignoreCase flag. If set to true, then the pattern\r
+   * matcher will ignore case when searching for a match.\r
+   */\r
+  public void setIgnoreCase(boolean b)\r
+  {\r
+    ignoreCase = b;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Get the state of the ignoreCase flag. Returns true if we are ignoring the\r
+   * case of the pattern, false otherwise.\r
+   */\r
+  public boolean getIgnoreCase()\r
+  {\r
+    return ignoreCase;\r
+  }\r
+\r
+  boolean ignoreCase = false;\r
+\r
+  static boolean defaultMFlag = false;\r
+\r
+  /**\r
+   * Set the default value of the m flag. If it is set to true, then the MFlag\r
+   * will be on for any regex search executed.\r
+   */\r
+  public static void setDefaultMFlag(boolean mFlag)\r
+  {\r
+    defaultMFlag = mFlag;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Get the default value of the m flag. If it is set to true, then the MFlag\r
+   * will be on for any regex search executed.\r
+   */\r
+  public static boolean getDefaultMFlag()\r
+  {\r
+    return defaultMFlag;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Initializes the object without a Pattern. To supply a Pattern use\r
+   * compile(String s).\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#compile(java.lang.String)\r
+   */\r
+  public Regex()\r
+  {\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Create and compile a Regex, but do not throw any exceptions. If you wish to\r
+   * have exceptions thrown for syntax errors, you must use the Regex(void)\r
+   * constructor to create the Regex object, and then call the compile method.\r
+   * Therefore, you should only call this method when you know your pattern is\r
+   * right. I will probably become more like\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search(java.lang.String)\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#compile(java.lang.String)\r
+   */\r
+  public Regex(String s)\r
+  {\r
+    try\r
+    {\r
+      compile(s);\r
+    } catch (RegSyntax rs)\r
+    {\r
+    }\r
+  }\r
+\r
+  ReplaceRule rep = null;\r
+\r
+  /**\r
+   * Create and compile both a Regex and a ReplaceRule.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#compile(java.lang.String)\r
+   */\r
+  public Regex(String s, String rp)\r
+  {\r
+    this(s);\r
+    rep = parsePerl.perlCode(rp);\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Create and compile a Regex, but give it the ReplaceRule specified. This\r
+   * allows the user finer control of the Replacement process, if that is\r
+   * desired.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#compile(java.lang.String)\r
+   */\r
+  public Regex(String s, ReplaceRule rp)\r
+  {\r
+    this(s);\r
+    rep = rp;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Change the ReplaceRule of this Regex by compiling a new one using String\r
+   * rp.\r
+   */\r
+  public void setReplaceRule(String rp)\r
+  {\r
+    rep = parsePerl.perlCode(rp);\r
+    repr = null; // Clear Replacer history\r
+  }\r
+\r
+  /** Change the ReplaceRule of this Regex to rp. */\r
+  public void setReplaceRule(ReplaceRule rp)\r
+  {\r
+    rep = rp;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Test to see if a custom defined rule exists.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat#define(java.lang.String,java.lang.String,Validator)\r
+   */\r
+  public static boolean isDefined(String nm)\r
+  {\r
+    return validators.get(nm) != null;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Removes a custom defined rule.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat#define(java.lang.String,java.lang.String,Validator)\r
+   */\r
+  public static void undefine(String nm)\r
+  {\r
+    validators.remove(nm);\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Defines a method to create a new rule. See test/deriv2.java and\r
+   * test/deriv3.java for examples of how to use it.\r
+   */\r
+  public static void define(String nm, String pat, Validator v)\r
+  {\r
+    v.pattern = pat;\r
+    validators.put(nm, v);\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Defines a shorthand for a pattern. The pattern will be invoked by a string\r
+   * that has the form "(??"+nm+")".\r
+   */\r
+  public static void define(String nm, String pat)\r
+  {\r
+    validators.put(nm, pat);\r
+  }\r
+\r
+  /** Get the current ReplaceRule. */\r
+  public ReplaceRule getReplaceRule()\r
+  {\r
+    return rep;\r
+  }\r
+\r
+  Replacer repr = null;\r
+\r
+  final Replacer _getReplacer()\r
+  {\r
+    return repr == null ? repr = new Replacer() : repr;\r
+  }\r
+\r
+  public Replacer getReplacer()\r
+  {\r
+    if (repr == null)\r
+    {\r
+      repr = new Replacer();\r
+    }\r
+    repr.rh.me = this;\r
+    repr.rh.prev = null;\r
+    return repr;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Replace the first occurence of this pattern in String s according to the\r
+   * ReplaceRule.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()\r
+   */\r
+  public String replaceFirst(String s)\r
+  {\r
+    return _getReplacer().replaceFirstRegion(s, this, 0, s.length())\r
+            .toString();\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Replace the first occurence of this pattern in String s beginning with\r
+   * position pos according to the ReplaceRule.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()\r
+   */\r
+  public String replaceFirstFrom(String s, int pos)\r
+  {\r
+    return _getReplacer().replaceFirstRegion(s, this, pos, s.length())\r
+            .toString();\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Replace the first occurence of this pattern in String s beginning with\r
+   * position start and ending with end according to the ReplaceRule.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()\r
+   */\r
+  public String replaceFirstRegion(String s, int start, int end)\r
+  {\r
+    return _getReplacer().replaceFirstRegion(s, this, start, end)\r
+            .toString();\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Replace all occurences of this pattern in String s according to the\r
+   * ReplaceRule.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()\r
+   */\r
+  public String replaceAll(String s)\r
+  {\r
+    return _getReplacer().replaceAllRegion(s, this, 0, s.length())\r
+            .toString();\r
+  }\r
+\r
+  public StringLike replaceAll(StringLike s)\r
+  {\r
+    return _getReplacer().replaceAllRegion(s, this, 0, s.length());\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Replace all occurences of this pattern in String s beginning with position\r
+   * pos according to the ReplaceRule.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()\r
+   */\r
+  public String replaceAllFrom(String s, int pos)\r
+  {\r
+    return _getReplacer().replaceAllRegion(s, this, pos, s.length())\r
+            .toString();\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Replace all occurences of this pattern in String s beginning with position\r
+   * start and ending with end according to the ReplaceRule.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.ReplaceRule\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#getReplaceRule()\r
+   */\r
+  public String replaceAllRegion(String s, int start, int end)\r
+  {\r
+    return _getReplacer().replaceAllRegion(s, this, start, end).toString();\r
+  }\r
+\r
+  /** Essentially clones the Regex object */\r
+  public Regex(Regex r)\r
+  {\r
+    super((RegRes) r);\r
+    dontMatchInQuotes = r.dontMatchInQuotes;\r
+    esc = r.esc;\r
+    ignoreCase = r.ignoreCase;\r
+    gFlag = r.gFlag;\r
+    if (r.rep == null)\r
+    {\r
+      rep = null;\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      rep = (ReplaceRule) r.rep.clone();\r
+    }\r
+    /*\r
+     * try { compile(r.toString()); } catch(RegSyntax r_) {}\r
+     */\r
+    thePattern = r.thePattern.clone(new Hashtable());\r
+    minMatch = r.minMatch;\r
+    skipper = r.skipper;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * By default, the escape character is the backslash, but you can make it\r
+   * anything you want by setting this variable.\r
+   */\r
+  public char esc = Pattern.ESC;\r
+\r
+  /**\r
+   * This method compiles a regular expression, making it possible to call the\r
+   * search or matchAt methods.\r
+   * \r
+   * @exception com.stevesoft.pat.RegSyntax\r
+   *                    is thrown if a syntax error is encountered in the\r
+   *                    pattern. For example, "x{3,1}" or "*a" are not valid\r
+   *                    patterns.\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#matchAt\r
+   */\r
+  public void compile(String prepat) throws RegSyntax\r
+  {\r
+    String postpat = parsePerl.codify(prepat, true);\r
+    String pat = postpat == null ? prepat : postpat;\r
+    minMatch = null;\r
+    ignoreCase = false;\r
+    dontMatchInQuotes = false;\r
+    Rthings mk = new Rthings(this);\r
+    int offset = mk.val;\r
+    String newpat = pat;\r
+    thePattern = none;\r
+    p = null;\r
+    or = null;\r
+    minMatch = new patInt(0);\r
+    StrPos sp = new StrPos(pat, 0);\r
+    if (sp.incMatch("(?e="))\r
+    {\r
+      char newEsc = sp.c;\r
+      sp.inc();\r
+      if (sp.match(')'))\r
+      {\r
+        newpat = reEscape(pat.substring(6), newEsc, Pattern.ESC);\r
+      }\r
+    }\r
+    else if (esc != Pattern.ESC)\r
+    {\r
+      newpat = reEscape(pat, esc, Pattern.ESC);\r
+    }\r
+    thePattern = _compile2(newpat, mk);\r
+    numSubs_ = mk.val - offset;\r
+    mk.set(this);\r
+  }\r
+\r
+  /*\r
+   * If a Regex is compared against a Regex, a check is done to see that the\r
+   * patterns are equal as well as the most recent match. If a Regex is compare\r
+   * with a RegRes, only the result of the most recent match is compared.\r
+   */\r
+  public boolean equals(Object o)\r
+  {\r
+    if (o instanceof Regex)\r
+    {\r
+      if (toString().equals(o.toString()))\r
+      {\r
+        return super.equals(o);\r
+      }\r
+      else\r
+      {\r
+        return false;\r
+      }\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      return super.equals(o);\r
+    }\r
+  }\r
+\r
+  /** A clone by any other name would smell as sweet. */\r
+  public Object clone()\r
+  {\r
+    return new Regex(this);\r
+  }\r
+\r
+  /** Return a clone of the underlying RegRes object. */\r
+  public RegRes result()\r
+  {\r
+    return (RegRes) super.clone();\r
+  }\r
+\r
+  // prep sets global variables of class\r
+  // Pattern so that it can access them\r
+  // during an attempt at a match\r
+  Pthings pt = new Pthings();\r
+\r
+  final Pthings prep(StringLike s)\r
+  {\r
+    // if(gFlag)\r
+    pt.lastPos = matchedTo();\r
+    if (pt.lastPos < 0)\r
+    {\r
+      pt.lastPos = 0;\r
+    }\r
+    if ((s == null ? null : s.unwrap()) != (src == null ? null : s.unwrap()))\r
+    {\r
+      pt.lastPos = 0;\r
+    }\r
+    src = s;\r
+    pt.dotDoesntMatchCR = dotDoesntMatchCR && (!sFlag);\r
+    pt.mFlag = (mFlag | defaultMFlag);\r
+    pt.ignoreCase = ignoreCase;\r
+    pt.no_check = false;\r
+    if (pt.marks != null)\r
+    {\r
+      for (int i = 0; i < pt.marks.length; i++)\r
+      {\r
+        pt.marks[i] = -1;\r
+      }\r
+    }\r
+    pt.marks = null;\r
+    pt.nMarks = numSubs_;\r
+    pt.src = s;\r
+    if (dontMatchInQuotes)\r
+    {\r
+      setCbits(s, pt);\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      pt.cbits = null;\r
+    }\r
+    return pt;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Attempt to match a Pattern beginning at a specified location within the\r
+   * string.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search\r
+   */\r
+  public boolean matchAt(String s, int start_pos)\r
+  {\r
+    return _search(s, start_pos, start_pos);\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Attempt to match a Pattern beginning at a specified location within the\r
+   * StringLike.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search\r
+   */\r
+  public boolean matchAt(StringLike s, int start_pos)\r
+  {\r
+    return _search(s, start_pos, start_pos);\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Search through a String for the first occurrence of a match.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#searchFrom\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#matchAt\r
+   */\r
+  public boolean search(String s)\r
+  {\r
+    if (s == null)\r
+    {\r
+      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_given_to_regex_search"));\r
+    }\r
+    return _search(s, 0, s.length());\r
+  }\r
+\r
+  public boolean search(StringLike sl)\r
+  {\r
+    if (sl == null)\r
+    {\r
+      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_search"));\r
+    }\r
+    return _search(sl, 0, sl.length());\r
+  }\r
+\r
+  public boolean reverseSearch(String s)\r
+  {\r
+    if (s == null)\r
+    {\r
+      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_given_to_regex_reverse_search"));\r
+    }\r
+    return _reverseSearch(s, 0, s.length());\r
+  }\r
+\r
+  public boolean reverseSearch(StringLike sl)\r
+  {\r
+    if (sl == null)\r
+    {\r
+      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search"));\r
+    }\r
+    return _reverseSearch(sl, 0, sl.length());\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Search through a String for the first occurence of a match, but start at\r
+   * position\r
+   * \r
+   * <pre>\r
+   * start\r
+   * </pre>\r
+   */\r
+  public boolean searchFrom(String s, int start)\r
+  {\r
+    if (s == null)\r
+    {\r
+      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_search_from"));\r
+    }\r
+    return _search(s, start, s.length());\r
+  }\r
+\r
+  public boolean searchFrom(StringLike s, int start)\r
+  {\r
+    if (s == null)\r
+    {\r
+        throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_search_from"));\r
+    }\r
+    return _search(s, start, s.length());\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Search through a region of a String for the first occurence of a match.\r
+   */\r
+  public boolean searchRegion(String s, int start, int end)\r
+  {\r
+    if (s == null)\r
+    {\r
+      throw new NullPointerException(MessageManager.getString("exception.null_string_like_given_to_regex_search_region"));\r
+    }\r
+    return _search(s, start, end);\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Set this to change the default behavior of the "." pattern. By default it\r
+   * now matches perl's behavior and fails to match the '\n' character.\r
+   */\r
+  public static boolean dotDoesntMatchCR = true;\r
+\r
+  StringLike gFlags;\r
+\r
+  int gFlagto = 0;\r
+\r
+  boolean gFlag = false;\r
+\r
+  /** Set the 'g' flag */\r
+  public void setGFlag(boolean b)\r
+  {\r
+    gFlag = b;\r
+  }\r
+\r
+  /** Get the state of the 'g' flag. */\r
+  public boolean getGFlag()\r
+  {\r
+    return gFlag;\r
+  }\r
+\r
+  boolean sFlag = false;\r
+\r
+  /** Get the state of the sFlag */\r
+  public boolean getSFlag()\r
+  {\r
+    return sFlag;\r
+  }\r
+\r
+  boolean mFlag = false;\r
+\r
+  /** Get the state of the sFlag */\r
+  public boolean getMFlag()\r
+  {\r
+    return mFlag;\r
+  }\r
+\r
+  final boolean _search(String s, int start, int end)\r
+  {\r
+    return _search(new StringWrap(s), start, end);\r
+  }\r
+\r
+  final boolean _search(StringLike s, int start, int end)\r
+  {\r
+    if (gFlag && gFlagto > 0 && gFlags != null\r
+            && s.unwrap() == gFlags.unwrap())\r
+    {\r
+      start = gFlagto;\r
+    }\r
+    gFlags = null;\r
+\r
+    Pthings pt = prep(s);\r
+\r
+    int up = (minMatch == null ? end : end - minMatch.i);\r
+\r
+    if (up < start && end >= start)\r
+    {\r
+      up = start;\r
+    }\r
+\r
+    if (skipper == null)\r
+    {\r
+      for (int i = start; i <= up; i++)\r
+      {\r
+        charsMatched_ = thePattern.matchAt(s, i, pt);\r
+        if (charsMatched_ >= 0)\r
+        {\r
+          matchFrom_ = thePattern.mfrom;\r
+          marks = pt.marks;\r
+          gFlagto = matchFrom_ + charsMatched_;\r
+          gFlags = s;\r
+          return didMatch_ = true;\r
+        }\r
+      }\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      pt.no_check = true;\r
+      for (int i = start; i <= up; i++)\r
+      {\r
+        i = skipper.find(src, i, up);\r
+        if (i < 0)\r
+        {\r
+          charsMatched_ = matchFrom_ = -1;\r
+          return didMatch_ = false;\r
+        }\r
+        charsMatched_ = thePattern.matchAt(s, i, pt);\r
+        if (charsMatched_ >= 0)\r
+        {\r
+          matchFrom_ = thePattern.mfrom;\r
+          marks = pt.marks;\r
+          gFlagto = matchFrom_ + charsMatched_;\r
+          gFlags = s;\r
+          return didMatch_ = true;\r
+        }\r
+      }\r
+    }\r
+    return didMatch_ = false;\r
+  }\r
+\r
+  /*\r
+   * final boolean _search(LongStringLike s,long start,long end) { if(gFlag &&\r
+   * gFlagto > 0 && s==gFlags) start = gFlagto; gFlags = null;\r
+   * \r
+   * Pthings pt=prep(s);\r
+   * \r
+   * int up = end;//(minMatch == null ? end : end-minMatch.i);\r
+   * \r
+   * if(up < start && end >= start) up = start;\r
+   * \r
+   * if(skipper == null) { for(long i=start;i<=up;i++) { charsMatched_ =\r
+   * thePattern.matchAt(s,i,pt); if(charsMatched_ >= 0) { matchFrom_ =\r
+   * thePattern.mfrom; marks = pt.marks; gFlagto = matchFrom_+charsMatched_;\r
+   * return didMatch_=true; } } } else { pt.no_check = true; for(long i=start;i<=up;i++) {\r
+   * i = skipper.find(src,i,up); if(i<0) { charsMatched_ = matchFrom_ = -1;\r
+   * return didMatch_ = false; } charsMatched_ = thePattern.matchAt(s,i,pt);\r
+   * if(charsMatched_ >= 0) { matchFrom_ = thePattern.mfrom; marks = pt.marks;\r
+   * gFlagto = matchFrom_+charsMatched_; gFlags = s; return didMatch_=true; }\r
+   * else { i = s.adjustIndex(i); up = s.adjustEnd(i); } } } return\r
+   * didMatch_=false; }\r
+   */\r
+\r
+  boolean _reverseSearch(String s, int start, int end)\r
+  {\r
+    return _reverseSearch(new StringWrap(s), start, end);\r
+  }\r
+\r
+  boolean _reverseSearch(StringLike s, int start, int end)\r
+  {\r
+    if (gFlag && gFlagto > 0 && s.unwrap() == gFlags.unwrap())\r
+    {\r
+      end = gFlagto;\r
+    }\r
+    gFlags = null;\r
+    Pthings pt = prep(s);\r
+    for (int i = end; i >= start; i--)\r
+    {\r
+      charsMatched_ = thePattern.matchAt(s, i, pt);\r
+      if (charsMatched_ >= 0)\r
+      {\r
+        matchFrom_ = thePattern.mfrom;\r
+        marks = pt.marks;\r
+        gFlagto = matchFrom_ - 1;\r
+        gFlags = s;\r
+        return didMatch_ = true;\r
+      }\r
+    }\r
+    return didMatch_ = false;\r
+  }\r
+\r
+  // This routine sets the cbits variable\r
+  // of class Pattern. Cbits is true for\r
+  // the bit corresponding to a character inside\r
+  // a set of quotes.\r
+  static StringLike lasts = null;\r
+\r
+  static BitSet lastbs = null;\r
+\r
+  static void setCbits(StringLike s, Pthings pt)\r
+  {\r
+    if (s == lasts)\r
+    {\r
+      pt.cbits = lastbs;\r
+      return;\r
+    }\r
+    BitSet bs = new BitSet(s.length());\r
+    char qc = ' ';\r
+    boolean setBit = false;\r
+    for (int i = 0; i < s.length(); i++)\r
+    {\r
+      if (setBit)\r
+      {\r
+        bs.set(i);\r
+      }\r
+      char c = s.charAt(i);\r
+      if (!setBit && c == '"')\r
+      {\r
+        qc = c;\r
+        setBit = true;\r
+        bs.set(i);\r
+      }\r
+      else if (!setBit && c == '\'')\r
+      {\r
+        qc = c;\r
+        setBit = true;\r
+        bs.set(i);\r
+      }\r
+      else if (setBit && c == qc)\r
+      {\r
+        setBit = false;\r
+      }\r
+      else if (setBit && c == '\\' && i + 1 < s.length())\r
+      {\r
+        i++;\r
+        if (setBit)\r
+        {\r
+          bs.set(i);\r
+        }\r
+      }\r
+    }\r
+    pt.cbits = lastbs = bs;\r
+    lasts = s;\r
+  }\r
+\r
+  // Wanted user to over-ride this in alpha version,\r
+  // but it wasn't really necessary because of this trick:\r
+  Regex newRegex()\r
+  {\r
+    try\r
+    {\r
+      return (Regex) getClass().newInstance();\r
+    } catch (InstantiationException ie)\r
+    {\r
+      return null;\r
+    } catch (IllegalAccessException iae)\r
+    {\r
+      return null;\r
+    }\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Only needed for creating your own extensions of Regex. This method adds the\r
+   * next Pattern in the chain of patterns or sets the Pattern if it is the\r
+   * first call.\r
+   */\r
+  protected void add(Pattern p2)\r
+  {\r
+    if (p == null)\r
+    {\r
+      p = p2;\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      p.add(p2);\r
+      p2 = p;\r
+    }\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * You only need to use this method if you are creating your own extentions to\r
+   * Regex. compile1 compiles one Pattern element, it can be over-ridden to\r
+   * allow the Regex compiler to understand new syntax. See deriv.java for an\r
+   * example. This routine is the heart of class Regex. Rthings has one integer\r
+   * member called intValue, it is used to keep track of the number of ()'s in\r
+   * the Pattern.\r
+   * \r
+   * @exception com.stevesoft.pat.RegSyntax\r
+   *                    is thrown when a nonsensensical pattern is supplied. For\r
+   *                    example, a pattern beginning with *.\r
+   */\r
+  protected void compile1(StrPos sp, Rthings mk) throws RegSyntax\r
+  {\r
+    if (sp.match('['))\r
+    {\r
+      sp.inc();\r
+      add(matchBracket(sp));\r
+    }\r
+    else if (sp.match('|'))\r
+    {\r
+      if (or == null)\r
+      {\r
+        or = new Or();\r
+      }\r
+      if (p == null)\r
+      {\r
+        p = new NullPattern();\r
+      }\r
+      or.addOr(p);\r
+      p = null;\r
+    }\r
+    else if (sp.incMatch("(?<"))\r
+    {\r
+      patInt i = sp.getPatInt();\r
+      if (i == null)\r
+      {\r
+        RegSyntaxError.endItAll("No int after (?<");\r
+      }\r
+      add(new Backup(i.intValue()));\r
+      if (!sp.match(')'))\r
+      {\r
+        RegSyntaxError.endItAll("No ) after (?<");\r
+      }\r
+    }\r
+    else if (sp.incMatch("(?>"))\r
+    {\r
+      patInt i = sp.getPatInt();\r
+      if (i == null)\r
+      {\r
+        RegSyntaxError.endItAll("No int after (?>");\r
+      }\r
+      add(new Backup(-i.intValue()));\r
+      if (!sp.match(')'))\r
+      {\r
+        RegSyntaxError.endItAll("No ) after (?<");\r
+      }\r
+    }\r
+    else if (sp.incMatch("(?@"))\r
+    {\r
+      char op = sp.c;\r
+      sp.inc();\r
+      char cl = sp.c;\r
+      sp.inc();\r
+      if (!sp.match(')'))\r
+      {\r
+        RegSyntaxError.endItAll("(?@ does not have closing paren");\r
+      }\r
+      add(new Group(op, cl));\r
+    }\r
+    else if (sp.incMatch("(?#"))\r
+    {\r
+      while (!sp.match(')'))\r
+      {\r
+        sp.inc();\r
+      }\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'w')\r
+    {\r
+      // Regex r = new Regex();\r
+      // r._compile("[a-zA-Z0-9_]",mk);\r
+      // add(new Goop("\\w",r.thePattern));\r
+      Bracket b = new Bracket(false);\r
+      b.addOr(new Range('a', 'z'));\r
+      b.addOr(new Range('A', 'Z'));\r
+      b.addOr(new Range('0', '9'));\r
+      b.addOr(new oneChar('_'));\r
+      add(b);\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'G')\r
+    {\r
+      add(new BackG());\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 's')\r
+    {\r
+      // Regex r = new Regex();\r
+      // r._compile("[ \t\n\r\b]",mk);\r
+      // add(new Goop("\\s",r.thePattern));\r
+      Bracket b = new Bracket(false);\r
+      b.addOr(new oneChar((char) 32));\r
+      b.addOr(new Range((char) 8, (char) 10));\r
+      b.addOr(new oneChar((char) 13));\r
+      add(b);\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'd')\r
+    {\r
+      // Regex r = new Regex();\r
+      // r._compile("[0-9]",mk);\r
+      // add(new Goop("\\d",r.thePattern));\r
+      Range digit = new Range('0', '9');\r
+      digit.printBrackets = true;\r
+      add(digit);\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'W')\r
+    {\r
+      // Regex r = new Regex();\r
+      // r._compile("[^a-zA-Z0-9_]",mk);\r
+      // add(new Goop("\\W",r.thePattern));\r
+      Bracket b = new Bracket(true);\r
+      b.addOr(new Range('a', 'z'));\r
+      b.addOr(new Range('A', 'Z'));\r
+      b.addOr(new Range('0', '9'));\r
+      b.addOr(new oneChar('_'));\r
+      add(b);\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'S')\r
+    {\r
+      // Regex r = new Regex();\r
+      // r._compile("[^ \t\n\r\b]",mk);\r
+      // add(new Goop("\\S",r.thePattern));\r
+      Bracket b = new Bracket(true);\r
+      b.addOr(new oneChar((char) 32));\r
+      b.addOr(new Range((char) 8, (char) 10));\r
+      b.addOr(new oneChar((char) 13));\r
+      add(b);\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'D')\r
+    {\r
+      // Regex r = new Regex();\r
+      // r._compile("[^0-9]",mk);\r
+      // add(new Goop("\\D",r.thePattern));\r
+      Bracket b = new Bracket(true);\r
+      b.addOr(new Range('0', '9'));\r
+      add(b);\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'B')\r
+    {\r
+      Regex r = new Regex();\r
+      r._compile2("(?!" + back_slash + "b)", mk);\r
+      add(r.thePattern);\r
+    }\r
+    else if (isOctalString(sp))\r
+    {\r
+      int d = sp.c - '0';\r
+      sp.inc();\r
+      d = 8 * d + sp.c - '0';\r
+      StrPos sp2 = new StrPos(sp);\r
+      sp2.inc();\r
+      if (isOctalDigit(sp2, false))\r
+      {\r
+        sp.inc();\r
+        d = 8 * d + sp.c - '0';\r
+      }\r
+      add(new oneChar((char) d));\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c >= '1' && sp.c <= '9')\r
+    {\r
+      int iv = sp.c - '0';\r
+      StrPos s2 = new StrPos(sp);\r
+      s2.inc();\r
+      if (!s2.dontMatch && s2.c >= '0' && s2.c <= '9')\r
+      {\r
+        iv = 10 * iv + (s2.c - '0');\r
+        sp.inc();\r
+      }\r
+      add(new BackMatch(iv));\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'b')\r
+    {\r
+      add(new Boundary());\r
+    }\r
+    else if (sp.match('\b'))\r
+    {\r
+      add(new Boundary());\r
+    }\r
+    else if (sp.match('$'))\r
+    {\r
+      add(new End(true));\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'Z')\r
+    {\r
+      add(new End(false));\r
+    }\r
+    else if (sp.match('.'))\r
+    {\r
+      add(new Any());\r
+    }\r
+    else if (sp.incMatch("(??"))\r
+    {\r
+      javajs.util.SB sb = new javajs.util.SB();\r
+      javajs.util.SB sb2 = new javajs.util.SB();\r
+      while (!sp.match(')') && !sp.match(':'))\r
+      {\r
+        sb.appendC(sp.c);\r
+        sp.inc();\r
+      }\r
+      if (sp.incMatch(":"))\r
+      {\r
+        while (!sp.match(')'))\r
+        {\r
+          sb2.appendC(sp.c);\r
+          sp.inc();\r
+        }\r
+      }\r
+      String sbs = sb.toString();\r
+      if (validators.get(sbs) instanceof String)\r
+      {\r
+        String pat = (String) validators.get(sbs);\r
+        Regex r = newRegex();\r
+        Rthings rth = new Rthings(this);\r
+        rth.noBackRefs = true;\r
+        r._compile2(pat, rth);\r
+        add(r.thePattern);\r
+      }\r
+      else\r
+      {\r
+        Custom cm = new Custom(sb.toString());\r
+        if (cm.v != null)\r
+        {\r
+          Validator v2 = cm.v.arg(sb2.toString());\r
+          if (v2 != null)\r
+          {\r
+            v2.argsave = sb2.toString();\r
+            String p = cm.v.pattern;\r
+            cm.v = v2;\r
+            v2.pattern = p;\r
+          }\r
+          Regex r = newRegex();\r
+          Rthings rth = new Rthings(this);\r
+          rth.noBackRefs = true;\r
+          r._compile2(cm.v.pattern, rth);\r
+          cm.sub = r.thePattern;\r
+          cm.sub.add(new CustomEndpoint(cm));\r
+          cm.sub.setParent(cm);\r
+          add(cm);\r
+        }\r
+      }\r
+    }\r
+    else if (sp.match('('))\r
+    {\r
+      mk.parenLevel++;\r
+      Regex r = newRegex();\r
+      // r.or = new Or();\r
+      sp.inc();\r
+      if (sp.incMatch("?:"))\r
+      {\r
+        r.or = new Or();\r
+      }\r
+      else if (sp.incMatch("?="))\r
+      {\r
+        r.or = new lookAhead(false);\r
+      }\r
+      else if (sp.incMatch("?!"))\r
+      {\r
+        r.or = new lookAhead(true);\r
+      }\r
+      else if (sp.match('?'))\r
+      {\r
+        sp.inc();\r
+        do\r
+        {\r
+          if (sp.c == 'i')\r
+          {\r
+            mk.ignoreCase = true;\r
+          }\r
+          if (sp.c == 'Q')\r
+          {\r
+            mk.dontMatchInQuotes = true;\r
+          }\r
+          if (sp.c == 'o')\r
+          {\r
+            mk.optimizeMe = true;\r
+          }\r
+          if (sp.c == 'g')\r
+          {\r
+            mk.gFlag = true;\r
+          }\r
+          if (sp.c == 's')\r
+          {\r
+            mk.sFlag = true;\r
+          }\r
+          if (sp.c == 'm')\r
+          {\r
+            mk.mFlag = true;\r
+          }\r
+          sp.inc();\r
+        } while (!sp.match(')') && !sp.eos);\r
+        r = null;\r
+        mk.parenLevel--;\r
+        if (sp.eos) // throw new RegSyntax\r
+        {\r
+          RegSyntaxError.endItAll("Unclosed ()");\r
+        }\r
+      }\r
+      else\r
+      { // just ordinary parenthesis\r
+        r.or = mk.noBackRefs ? new Or() : new OrMark(mk.val++);\r
+      }\r
+      if (r != null)\r
+      {\r
+        add(r._compile1(sp, mk));\r
+      }\r
+    }\r
+    else if (sp.match('^'))\r
+    {\r
+      add(new Start(true));\r
+    }\r
+    else if (sp.dontMatch && sp.c == 'A')\r
+    {\r
+      add(new Start(false));\r
+    }\r
+    else if (sp.match('*'))\r
+    {\r
+      addMulti(new patInt(0), new patInf());\r
+    }\r
+    else if (sp.match('+'))\r
+    {\r
+      addMulti(new patInt(1), new patInf());\r
+    }\r
+    else if (sp.match('?'))\r
+    {\r
+      addMulti(new patInt(0), new patInt(1));\r
+    }\r
+    else if (sp.match('{'))\r
+    {\r
+      boolean bad = false;\r
+      StrPos sp2 = new StrPos(sp);\r
+      // javajs.util.SB sb = new javajs.util.SB();\r
+      sp.inc();\r
+      patInt i1 = sp.getPatInt();\r
+      patInt i2 = null;\r
+      if (sp.match('}'))\r
+      {\r
+        i2 = i1;\r
+      }\r
+      else\r
+      {\r
+        if (!sp.match(','))\r
+        {\r
+          /*\r
+           * RegSyntaxError.endItAll( "String \"{"+i2+ "\" should be followed\r
+           * with , or }");\r
+           */\r
+          bad = true;\r
+        }\r
+        sp.inc();\r
+        if (sp.match('}'))\r
+        {\r
+          i2 = new patInf();\r
+        }\r
+        else\r
+        {\r
+          i2 = sp.getPatInt();\r
+        }\r
+      }\r
+      if (i1 == null || i2 == null)\r
+      {\r
+        /*\r
+         * throw new RegSyntax("Badly formatted Multi: " +"{"+i1+","+i2+"}");\r
+         */\r
+        bad = true;\r
+      }\r
+      if (bad)\r
+      {\r
+        sp.dup(sp2);\r
+        add(new oneChar(sp.c));\r
+      }\r
+      else\r
+      {\r
+        addMulti(i1, i2);\r
+      }\r
+    }\r
+    else if (sp.escMatch('x') && next2Hex(sp))\r
+    {\r
+      sp.inc();\r
+      int d = getHexDigit(sp);\r
+      sp.inc();\r
+      d = 16 * d + getHexDigit(sp);\r
+      add(new oneChar((char) d));\r
+    }\r
+    else if (sp.escMatch('c'))\r
+    {\r
+      sp.inc();\r
+      if (sp.c < Ctrl.cmap.length)\r
+      {\r
+        add(new oneChar(Ctrl.cmap[sp.c]));\r
+      }\r
+      else\r
+      {\r
+        add(new oneChar(sp.c));\r
+      }\r
+    }\r
+    else if (sp.escMatch('f'))\r
+    {\r
+      add(new oneChar((char) 12));\r
+    }\r
+    else if (sp.escMatch('a'))\r
+    {\r
+      add(new oneChar((char) 7));\r
+    }\r
+    else if (sp.escMatch('t'))\r
+    {\r
+      add(new oneChar('\t'));\r
+    }\r
+    else if (sp.escMatch('n'))\r
+    {\r
+      add(new oneChar('\n'));\r
+    }\r
+    else if (sp.escMatch('r'))\r
+    {\r
+      add(new oneChar('\r'));\r
+    }\r
+    else if (sp.escMatch('b'))\r
+    {\r
+      add(new oneChar('\b'));\r
+    }\r
+    else if (sp.escMatch('e'))\r
+    {\r
+      add(new oneChar((char) 27));\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      add(new oneChar(sp.c));\r
+      if (sp.match(')'))\r
+      {\r
+        RegSyntaxError.endItAll("Unmatched right paren in pattern");\r
+      }\r
+    }\r
+  }\r
+\r
+  // compiles all Pattern elements, internal method\r
+  private Pattern _compile2(String pat, Rthings mk) throws RegSyntax\r
+  {\r
+    minMatch = null;\r
+    sFlag = mFlag = ignoreCase = gFlag = false;\r
+    StrPos sp = new StrPos(pat, 0);\r
+    thePattern = _compile1(sp, mk);\r
+    pt.marks = null;\r
+    return thePattern;\r
+  }\r
+\r
+  Pattern p = null;\r
+\r
+  Or or = null;\r
+\r
+  Pattern _compile1(StrPos sp, Rthings mk) throws RegSyntax\r
+  {\r
+    while (!(sp.eos || (or != null && sp.match(')'))))\r
+    {\r
+      compile1(sp, mk);\r
+      sp.inc();\r
+    }\r
+    if (sp.match(')'))\r
+    {\r
+      mk.parenLevel--;\r
+    }\r
+    else if (sp.eos && mk.parenLevel != 0)\r
+    {\r
+      RegSyntaxError.endItAll("Unclosed Parenthesis! lvl=" + mk.parenLevel);\r
+    }\r
+    if (or != null)\r
+    {\r
+      if (p == null)\r
+      {\r
+        p = new NullPattern();\r
+      }\r
+      or.addOr(p);\r
+      return or;\r
+    }\r
+    return p == null ? new NullPattern() : p;\r
+  }\r
+\r
+  // add a multi object to the end of the chain\r
+  // which applies to the last object\r
+  void addMulti(patInt i1, patInt i2) throws RegSyntax\r
+  {\r
+    Pattern last, last2;\r
+    for (last = p; last != null && last.next != null; last = last.next)\r
+    {\r
+      ;\r
+    }\r
+    if (last == null || last == p)\r
+    {\r
+      last2 = null;\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      for (last2 = p; last2.next != last; last2 = last2.next)\r
+      {\r
+        ;\r
+      }\r
+    }\r
+    if (last instanceof Multi && i1.intValue() == 0 && i2.intValue() == 1)\r
+    {\r
+      ((Multi) last).matchFewest = true;\r
+    }\r
+    else if (last instanceof FastMulti && i1.intValue() == 0\r
+            && i2.intValue() == 1)\r
+    {\r
+      ((FastMulti) last).matchFewest = true;\r
+    }\r
+    else if (last instanceof DotMulti && i1.intValue() == 0\r
+            && i2.intValue() == 1)\r
+    {\r
+      ((DotMulti) last).matchFewest = true;\r
+    }\r
+    else if (last instanceof Multi || last instanceof DotMulti\r
+            || last instanceof FastMulti)\r
+    {\r
+      throw new RegSyntax("Syntax error.");\r
+    }\r
+    else if (last2 == null)\r
+    {\r
+      p = mkMulti(i1, i2, p);\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      last2.next = mkMulti(i1, i2, last);\r
+    }\r
+  }\r
+\r
+  final static Pattern mkMulti(patInt lo, patInt hi, Pattern p)\r
+          throws RegSyntax\r
+  {\r
+    if (p instanceof Any && p.next == null)\r
+    {\r
+      return (Pattern) new DotMulti(lo, hi);\r
+    }\r
+    return RegOpt.safe4fm(p) ? (Pattern) new FastMulti(lo, hi, p)\r
+            : (Pattern) new Multi(lo, hi, p);\r
+  }\r
+\r
+  // process the bracket operator\r
+  Pattern matchBracket(StrPos sp) throws RegSyntax\r
+  {\r
+    Bracket ret;\r
+    if (sp.match('^'))\r
+    {\r
+      ret = new Bracket(true);\r
+      sp.inc();\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      ret = new Bracket(false);\r
+    }\r
+    if (sp.match(']'))\r
+    {\r
+      // throw new RegSyntax\r
+      RegSyntaxError.endItAll("Unmatched []");\r
+    }\r
+\r
+    while (!sp.eos && !sp.match(']'))\r
+    {\r
+      StrPos s1 = new StrPos(sp);\r
+      s1.inc();\r
+      StrPos s1_ = new StrPos(s1);\r
+      s1_.inc();\r
+      if (s1.match('-') && !s1_.match(']'))\r
+      {\r
+        StrPos s2 = new StrPos(s1);\r
+        s2.inc();\r
+        if (!s2.eos)\r
+        {\r
+          ret.addOr(new Range(sp.c, s2.c));\r
+        }\r
+        sp.inc();\r
+        sp.inc();\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('Q'))\r
+      {\r
+        sp.inc();\r
+        while (!sp.escMatch('E'))\r
+        {\r
+          ret.addOr(new oneChar(sp.c));\r
+          sp.inc();\r
+        }\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('d'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new Range('0', '9'));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('s'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new oneChar((char) 32));\r
+        ret.addOr(new Range((char) 8, (char) 10));\r
+        ret.addOr(new oneChar((char) 13));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('w'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new Range('a', 'z'));\r
+        ret.addOr(new Range('A', 'Z'));\r
+        ret.addOr(new Range('0', '9'));\r
+        ret.addOr(new oneChar('_'));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('D'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new Range((char) 0, (char) 47));\r
+        ret.addOr(new Range((char) 58, (char) 65535));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('S'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new Range((char) 0, (char) 7));\r
+        ret.addOr(new Range((char) 11, (char) 12));\r
+        ret.addOr(new Range((char) 14, (char) 31));\r
+        ret.addOr(new Range((char) 33, (char) 65535));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('W'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new Range((char) 0, (char) 64));\r
+        ret.addOr(new Range((char) 91, (char) 94));\r
+        ret.addOr(new oneChar((char) 96));\r
+        ret.addOr(new Range((char) 123, (char) 65535));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('x') && next2Hex(sp))\r
+      {\r
+        sp.inc();\r
+        int d = getHexDigit(sp);\r
+        sp.inc();\r
+        d = 16 * d + getHexDigit(sp);\r
+        ret.addOr(new oneChar((char) d));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('a'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new oneChar((char) 7));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('f'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new oneChar((char) 12));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('e'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new oneChar((char) 27));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('n'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new oneChar('\n'));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('t'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new oneChar('\t'));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('r'))\r
+      {\r
+        ret.addOr(new oneChar('\r'));\r
+      }\r
+      else if (sp.escMatch('c'))\r
+      {\r
+        sp.inc();\r
+        if (sp.c < Ctrl.cmap.length)\r
+        {\r
+          ret.addOr(new oneChar(Ctrl.cmap[sp.c]));\r
+        }\r
+        else\r
+        {\r
+          ret.addOr(new oneChar(sp.c));\r
+        }\r
+      }\r
+      else if (isOctalString(sp))\r
+      {\r
+        int d = sp.c - '0';\r
+        sp.inc();\r
+        d = 8 * d + sp.c - '0';\r
+        StrPos sp2 = new StrPos(sp);\r
+        sp2.inc();\r
+        if (isOctalDigit(sp2, false))\r
+        {\r
+          sp.inc();\r
+          d = 8 * d + sp.c - '0';\r
+        }\r
+        ret.addOr(new oneChar((char) d));\r
+      }\r
+      else\r
+      {\r
+        ret.addOr(new oneChar(sp.c));\r
+      }\r
+      sp.inc();\r
+    }\r
+    return ret;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Converts the stored Pattern to a String -- this is a decompile. Note that\r
+   * \t and \n will really print out here, Not just the two character\r
+   * representations. Also be prepared to see some strange output if your\r
+   * characters are not printable.\r
+   */\r
+  public String toString()\r
+  {\r
+    if (false && thePattern == null)\r
+    {\r
+      return "";\r
+    }\r
+    else\r
+    {\r
+      javajs.util.SB sb = new javajs.util.SB();\r
+      if (esc != Pattern.ESC)\r
+      {\r
+        sb.append("(?e=");\r
+        sb.appendC(esc);\r
+        sb.append(")");\r
+      }\r
+      if (gFlag || mFlag || !dotDoesntMatchCR || sFlag || ignoreCase\r
+              || dontMatchInQuotes || optimized())\r
+      {\r
+        sb.append("(?");\r
+        if (ignoreCase)\r
+        {\r
+          sb.append("i");\r
+        }\r
+        if (mFlag)\r
+        {\r
+          sb.append("m");\r
+        }\r
+        if (sFlag || !dotDoesntMatchCR)\r
+        {\r
+          sb.append("s");\r
+        }\r
+        if (dontMatchInQuotes)\r
+        {\r
+          sb.append("Q");\r
+        }\r
+        if (optimized())\r
+        {\r
+          sb.append("o");\r
+        }\r
+        if (gFlag)\r
+        {\r
+          sb.append("g");\r
+        }\r
+        sb.append(")");\r
+      }\r
+      String patstr = thePattern.toString();\r
+      if (esc != Pattern.ESC)\r
+      {\r
+        patstr = reEscape(patstr, Pattern.ESC, esc);\r
+      }\r
+      sb.append(patstr);\r
+      return sb.toString();\r
+    }\r
+  }\r
+\r
+  // Re-escape Pattern, allows us to use a different escape\r
+  // character.\r
+  static String reEscape(String s, char oldEsc, char newEsc)\r
+  {\r
+    if (oldEsc == newEsc)\r
+    {\r
+      return s;\r
+    }\r
+    int i;\r
+    javajs.util.SB sb = new javajs.util.SB();\r
+    for (i = 0; i < s.length(); i++)\r
+    {\r
+      if (s.charAt(i) == oldEsc && i + 1 < s.length())\r
+      {\r
+        if (s.charAt(i + 1) == oldEsc)\r
+        {\r
+          sb.appendC(oldEsc);\r
+        }\r
+        else\r
+        {\r
+          sb.appendC(newEsc);\r
+          sb.appendC(s.charAt(i + 1));\r
+        }\r
+        i++;\r
+      }\r
+      else if (s.charAt(i) == newEsc)\r
+      {\r
+        sb.appendC(newEsc);\r
+        sb.appendC(newEsc);\r
+      }\r
+      else\r
+      {\r
+        sb.appendC(s.charAt(i));\r
+      }\r
+    }\r
+    return sb.toString();\r
+  }\r
+\r
+//  /**\r
+//   * This method implements FilenameFilter, allowing one to use a Regex to\r
+//   * search through a directory using File.list. There is a FileRegex now that\r
+//   * does this better.\r
+//   * \r
+//   * @see com.stevesoft.pat.FileRegex\r
+//   */\r
+//  public boolean accept(File dir, String s)\r
+//  {\r
+//    return search(s);\r
+//  }\r
+\r
+  /** The version of this package */\r
+  final static public String version()\r
+  {\r
+    return "lgpl release 1.5.3";\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * Once this method is called, the state of variables ignoreCase and\r
+   * dontMatchInQuotes should not be changed as the results will be\r
+   * unpredictable. However, search and matchAt will run more quickly. Note that\r
+   * you can check to see if the pattern has been optimized by calling the\r
+   * optimized() method.\r
+   * <p>\r
+   * This method will attempt to rewrite your pattern in a way that makes it\r
+   * faster (not all patterns execute at the same speed). In general, "(?: ... )"\r
+   * will be faster than "( ... )" so if you don't need the backreference, you\r
+   * should group using the former pattern.\r
+   * <p>\r
+   * It will also introduce new pattern elements that you can't get to\r
+   * otherwise, for example if you have a large table of strings, i.e. the\r
+   * months of the year "(January|February|...)" optimize() will make a\r
+   * Hashtable that takes it to the next appropriate pattern element --\r
+   * eliminating the need for a linear search.\r
+   * \r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#optimized\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#ignoreCase\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#dontMatchInQuotes\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#matchAt\r
+   * @see com.stevesoft.pat.Regex#search\r
+   */\r
+  public void optimize()\r
+  {\r
+    if (optimized() || thePattern == null)\r
+    {\r
+      return;\r
+    }\r
+    minMatch = new patInt(0); // thePattern.countMinChars();\r
+    thePattern = RegOpt.opt(thePattern, ignoreCase, dontMatchInQuotes);\r
+    skipper = Skip.findSkip(this);\r
+    // RegOpt.setParents(this);\r
+    return;\r
+  }\r
+\r
+  Skip skipper;\r
+\r
+  /**\r
+   * This function returns true if the optimize method has been called.\r
+   */\r
+  public boolean optimized()\r
+  {\r
+    return minMatch != null;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * A bit of syntactic surgar for those who want to make their code look more\r
+   * perl-like. To use this initialize your Regex object by saying:\r
+   * \r
+   * <pre>\r
+   *       Regex r1 = Regex.perlCode(&quot;s/hello/goodbye/&quot;);\r
+   *       Regex r2 = Regex.perlCode(&quot;s'fish'frog'i&quot;);\r
+   *       Regex r3 = Regex.perlCode(&quot;m'hello');\r
+   * </pre>\r
+   * \r
+   * The i for ignoreCase is supported in this syntax, as well as m, s, and x.\r
+   * The g flat is a bit of a special case.\r
+   * <p>\r
+   * If you wish to replace all occurences of a pattern, you do not put a 'g' in\r
+   * the perlCode, but call Regex's replaceAll method.\r
+   * <p>\r
+   * If you wish to simply and only do a search for r2's pattern, you can do\r
+   * this by calling the searchFrom method method repeatedly, or by calling\r
+   * search repeatedly if the g flag is set.\r
+   * <p>\r
+   * Note: Currently perlCode does <em>not</em> support the (?e=#) syntax for\r
+   * changing the escape character.\r
+   */\r
+\r
+  public static Regex perlCode(String s)\r
+  {\r
+    // this file is big enough, see parsePerl.java\r
+    // for this function.\r
+    return parsePerl.parse(s);\r
+  }\r
+\r
+  static final char back_slash = '\\';\r
+\r
+  /**\r
+   * Checks to see if there are only literal and no special pattern elements in\r
+   * this Regex.\r
+   */\r
+  public boolean isLiteral()\r
+  {\r
+    Pattern x = thePattern;\r
+    while (x != null)\r
+    {\r
+      if (x instanceof oneChar)\r
+      {\r
+        ;\r
+      }\r
+      else if (x instanceof Skipped)\r
+      {\r
+        ;\r
+      }\r
+      else\r
+      {\r
+        return false;\r
+      }\r
+      x = x.next;\r
+    }\r
+    return true;\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * You only need to know about this if you are inventing your own pattern\r
+   * elements.\r
+   */\r
+  public patInt countMinChars()\r
+  {\r
+    return thePattern.countMinChars();\r
+  }\r
+\r
+  /**\r
+   * You only need to know about this if you are inventing your own pattern\r
+   * elements.\r
+   */\r
+  public patInt countMaxChars()\r
+  {\r
+    return thePattern.countMaxChars();\r
+  }\r
+\r
+  boolean isHexDigit(StrPos sp)\r
+  {\r
+    boolean r = !sp.eos\r
+            && !sp.dontMatch\r
+            && ((sp.c >= '0' && sp.c <= '9')\r
+                    || (sp.c >= 'a' && sp.c <= 'f') || (sp.c >= 'A' && sp.c <= 'F'));\r
+    return r;\r
+  }\r
+\r
+  boolean isOctalDigit(StrPos sp, boolean first)\r
+  {\r
+    boolean r = !sp.eos && !(first ^ sp.dontMatch) && sp.c >= '0'\r
+            && sp.c <= '7';\r
+    return r;\r
+  }\r
+\r
+  int getHexDigit(StrPos sp)\r
+  {\r
+    if (sp.c >= '0' && sp.c <= '9')\r
+    {\r
+      return sp.c - '0';\r
+    }\r
+    if (sp.c >= 'a' && sp.c <= 'f')\r
+    {\r
+      return sp.c - 'a' + 10;\r
+    }\r
+    return sp.c - 'A' + 10;\r
+  }\r
+\r
+  boolean next2Hex(StrPos sp)\r
+  {\r
+    StrPos sp2 = new StrPos(sp);\r
+    sp2.inc();\r
+    if (!isHexDigit(sp2))\r
+    {\r
+      return false;\r
+    }\r
+    sp2.inc();\r
+    if (!isHexDigit(sp2))\r
+    {\r
+      return false;\r
+    }\r
+    return true;\r
+  }\r
+\r
+  boolean isOctalString(StrPos sp)\r
+  {\r
+    if (!isOctalDigit(sp, true))\r
+    {\r
+      return false;\r
+    }\r
+    StrPos sp2 = new StrPos(sp);\r
+    sp2.inc();\r
+    if (!isOctalDigit(sp2, false))\r
+    {\r
+      return false;\r
+    }\r
+    return true;\r
+  }\r
+}\r