new
[jalview.git] / website / version2 / examples / glut.msf
diff --git a/website/version2/examples/glut.msf b/website/version2/examples/glut.msf
new file mode 100755 (executable)
index 0000000..0c9c83c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,299 @@
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+\r
+\r
+   MSF:  439  Type: P    Check:  2277   .. \r
+\r
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+//\r
+\r
+\r
+\r
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+\r
+\r
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+AJPMQ1          .......... .....MSLSD LINLDLSGTT EKIIAEYIWI GGS..GLDLR \r
+AJFBQ           .......... ....MSSISD LVNLNLSDST ERVIAEYIWV GGS..GMDMR \r
+AJYLNB          .......... ....MSLLSD LINLNLSDTT EKIIAEYIWV GGS..GVDLR \r
+AJRZQG          .......... ....MASLTD LVNLNLSDTT EKIIAEYIWI GGS..GMDLR \r
+AJLCQB          .......... ....MALLSD LVNLDLSSIN DKIIAEYIWI GGS..GMDLR \r
+AJRZQB          .......... ....MANLTD LVNLNLSDCS DKIIAEYIWV GGS..GIDLR \r
+AJFBQD          SSFRVLAVKS DGSTINRLEG LLNLDITPFT DKIIAEYIWI GGT..GIDVR \r
+AJPMQ2          HSFRVMAVNS ENGTINRVED LLNLDITPFT DSIIAEYIWI GGT..GIDVR \r
+AJRZQD          TSRVMAVSTE TTGVVTRMEQ LLNMDTTPFT DKIIAEYIWV GGT..GIDLR \r
+AJBHQ           TSKVLALGPE TTGVIQRMQQ LLDMDTTPFT DKIIAEYIWV GGS..GIDLR \r
+AJDHQ           .......... .......... .......... .......... .......... \r
+AJMSQ           ......MATS ASSHLNKGIK QMYMSLPQGE .KVQAMYIWV DGT..GEGLR \r
+AJMSQ3          ......MATS ASSHVNKGIK QMYMSLPQGE .KIQAMYIWV NGT..GEPLR \r
+AJHYQ           ......MATS ASSHLNKNIK QMYLCLPQGE .KVQAMYIWV DGT..GEGLR \r
+AJRTQ           ......MATS ASSHLNKGIK QMYMNLPQGE .KIQLMYIWV DGT..GEGLR \r
+AJHUQ           ......MTTS ASSHLNKGIK QVYMSLPQGE .KVQAMYIWI DGT..GEGLR \r
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+AJFF2C          ..SARILEDS PNARINKTIL DRYLSLPLQE NIVQATYVWI DGT..GEDLR \r
+AJFF1M          GNRSQFLANS PNTALDKSIL QRYRNLETPA NRVQATYLWI DGT..GENIR \r
+AJSM2V          .......... .......... .......... MTFKAEYIWI DGTEPTAKLR \r
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+AJKXQ           .......... .......... .......... MSYQAEYIWI DGTEPEPLMR \r
+AJZJQ2          .......... .......... .........M TKYKLEYIWL DGYTPTPNLR \r
+\r
+\r
+AJPMQA          AR.TLPGPVS DPAKLPKWNY DGSSTNQAPG KDSEVILYPQ AIFKDPFR.N \r
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+AJMSQ3          TCRTLDCEPK CVEELPEWNF DGSSTFQSEG SNSNMYLHPV AMFRDPFR.. \r
+AJHYQ           TR.TLDCEPK CVEELPEWNF DGSSTFQSEG SNSDMYLSPV AMFRDPFR.P \r
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+\r
+\r
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+AJYLNB          NILVICDTYT PSGKP.IPTN KRHAAAKIFS HPDVAAEEPW FGIEQELLQK \r
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+AJLCQB          HILVMCDAYT PAGEP.IPTN KRAAAAKIFS NPEVEKEVTW YGIEQELLQK \r
+AJRZQB          NILVMCDCYT PQGEP.IPTN KRHSAAKIFS HPDVVAEVPW YGIEQELLQK \r
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+AJRZQD          NILVMCDTYT PAGEP.IPTN KRNRAAQVFS DPKVVSQVPW FGIEQELLQR \r
+AJBHQ           NILVICDTYT PQGEP.IPTN KRHMAAQIFS DPKVTSQVQW FGIEQELMQR \r
+AJDHQ           .......... .......... .......... ....KAQEPW FGIEQELLNS \r
+AJMSQ           NKLVLCEVFK YNRKP.AETN LRH..ICKRI MDMVSNQHPW FGMEQELMGT \r
+AJMSQ3          NKLVLCEVFK YNRKP.AETN LRH..ICKRI MDMVSNQHPW FGMEQELMGT \r
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+AJZJQ2          GVLVMCEVMM PDGKTPHASN KRATILDDAG ........AW FGFEQEFYKD \r
+\r
+\r
+AJPMQA          DINWPLGWPI GG..YPGKQG PYYCGIGADK AY..GRDIVD AHYKAFAGIN \r
+AJFBQA          DVNWPLGWPL GG..YPGPQG PYYCGVGADK AY..GRDIVD AHYKAYAGIN \r
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+AJFBQ           DVQWPVGWPL GG..FPGPQG PYYCGIGANK AF..GRDIVD SHYKAYAGIN \r
+AJYLNB          DIHWPIGMAL GG..FPGPQG PYYCGTGAEK AF..GRDIVD SHYKAYAGIN \r
+AJRZQG          DINWPLGWPV GG..FPGPQG PYYCGIGADK SF..GRDIVD SHYKAYAGIN \r
+AJLCQB          DTNWPLGWPL GG..FPGPQG PYYCGIGADK AF..GRDIVH AHYKAYAGVN \r
+AJRZQB          DVNWPLGWPV GG..FPGPQG PYYCAAGAEK AF..GRDIVD AHYKAYAGIN \r
+AJFBQD          NVNWPLGWPV GG..YPGPQG PYYCSAGADK SF..GRDISD AHYKAFAGIN \r
+AJPMQ2          NVKWPLGWPV GG..YPGPQG PYYCAAGADK SF..GRDISD AHYKAYAGIN \r
+AJRZQD          DVNWPLGWPV GG..YPGPQG PYYCAVGSDK SF..GRDISD AHYKAYAGIN \r
+AJBHQ           DVNWPLGWPV GG..YPGPQG PYYCAVGSDK SF..GRDISD AHYKAYAGIE \r
+AJDHQ           VTKWPLGWPK GG..YPAGQG PYYCSVGAGR SI..GRDIPE VHYRCHAGIQ \r
+AJMSQ           DG.HPFGWPS NG..FPGPQG PYYCGVGADK AY..GRDIVE AHYRAYAGVK \r
+AJMSQ3          DG.HPFGWPF NG..FPGPQG PYYCGVGADK AY..GRDIVE AHYRAYAGVK \r
+AJHYQ           DG.HPFGWPS NG..FPGPQG PYYCGVGADK AY..GRDIVE AHYRAYAGVK \r
+AJRTQ           DG.HPFGWPS NG..FPGPQG PYYCGVGADK AY..GRDIVE AHYRAYAGIK \r
+AJHUQ           DG.HPFGWPS NG..FPGPQG PYYCGVGADR AY..GRDIVE AHYRAYAGVK \r
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+AJFF2C          G....HHWAG QEW.FPDP.G PYYCGVGANK SS..PR.HKD AHYAPYAGTQ \r
+AJFF1M          GR.TSFGWPE NG..FPAPQG PYYCGVGADR VY..ARDLVE AHVVAYAGID \r
+AJSM2V          GY..PLGFPK GG..FPAPQG GYYCGVGADE IF..GRDVVE AHLDNKAGLA \r
+AJSM2H          DR..PLGFPE GGG.YPAPQA DYYCGVGADA IF..GREIVE KHLDLAAGLG \r
+AJKXQ           GR..PYGWPE VG..YPAPQG PYYCGVGGSK MP..GRQIVE RHTQADAGLA \r
+AJZJQ2          GR..PLGFPT SG..YPAPQG PYYTGVGFSN VGDVARKIVE EHLDLAAGIN \r
+\r
+\r
+AJPMQA          ISGINGEVMP GQWEFQVGPS VGISAGDEIW AARYILERIT EIAVVSFDPK \r
+AJFBQA          ISGINGEVMP GQWEFQVGPS VGISAGDEVW AARYILERIT ELAVVSFDPK \r
+AJAAQ           ISGINGEVMP GQWEFQVGPS VGISAGDEIW VARYILERIT EVAVLSFDPK \r
+AJFBQB          ISGINGEVMP GQWEFQVGPA VGISAGDELW VARYILERIT EVAVLSFDPK \r
+AJPMQ1          ISGINGEVMP GQWEFQVGPS VGISAGDEIW VARYILERIT EVAVLTFDPK \r
+AJFBQ           ISGINGEVMP GQWEFQVGPS VGISAADELW VARYILERIT EIAVLSFDPK \r
+AJYLNB          ISGINAEVMP GQWEFQVGPS IGISAGDELW VARYILERIT EIAVLSLDPK \r
+AJRZQG          ISGINGEVMP GQWEFQVGPS VGISAGDQVW VARYILERIT EIAVVSFDPK \r
+AJLCQB          ISGINGEVMP GQWEFQVGPS VGIAAADQIW VARYILERIT EIYVVSFDPK \r
+AJRZQB          ISGINGEVMP GQWEFQVGPS VGIAAADQVW VARYILERVT EVAVLSLDPK \r
+AJFBQD          ISGTNGEVMP GQWEYQVGPS VGIEAGDHIW ASRYILERIT EQAVLSLDPK \r
+AJPMQ2          ISGTNGEVMP GQWEYQVGPS VGIEAGDHIW ASRYILERIT EQAVLTLDPK \r
+AJRZQD          ISGTNGEVMP GQWEYQVGPS VGIEAGDHIW ISRYILERIT EQAVLTLDPK \r
+AJBHQ           ISGTNGEVMP GQWEYQVGPS VGIDAGDHIW ASRYILERIT EQAVLTLDPK \r
+AJDHQ           ISGVNGEVLP SQWEYQVGPV EGIAMGDQMW MSRYLMYRVA ELFEVTFDPK \r
+AJMSQ           ITGTNAEVMP AQWEFQIGPC EGIRMGDHLW IARFILHRVC EDFIATFDPK \r
+AJMSQ3          ITGTNAEVMP AQW....... .......... .......... .......... \r
+AJHYQ           ITGTNAEVMP AQWEFQIGPC EGIRMGDHLW VARFILHRVC EDFIATFDPK \r
+AJRTQ           ITGTNAEVMP AQWEFQIGPC EGIRMGDHLW VARFILHRVC EDFIATFDPK \r
+AJHUQ           IAGTNAEVMP AQWEFQIGPC EGISMGDHLW VARFILHRVC EDFIATFDPK \r
+AJCHQ           IGGTNAEVMP AQWEFQVGPC EGIEMGDHLW IARFILHRVC EDFIVSFDPK \r
+AJFF2C          GVPTNAEVMP AQWEFQVGPC EGISIGDDLW MARFLLHRIS EEFVSTLDPK \r
+AJFF1M          FAGTNAEVMP AQWEFQIGPA G.IKACDDLW VSRYILQRIA EEYVVTFDPK \r
+AJSM2V          ISGINAEVMP GQWEFQVGPV SPLEVSDHLW VARWLLYRTA EDFAATLDPK \r
+AJSM2H          LSGINAEVMP GQWEFQVGAL PPLEVSDHMW VARWLLHRVA EEFTASLDAK \r
+AJKXQ           IEGTNAEVMM GQWEFQIGVL PAPAIGDQIW LGRWLLHRIA EDYEVSFAAK \r
+AJZJQ2          HEGINAEVAK GQWEFQIFGK GSKKAADEMW MARYLMLRLT EKYDIEFHCK \r
+\r
+\r
+AJPMQA          PIPG.DWNGA GAHANFSTKS MRENGGYEVI KKAIEKLGLR HHIAAYGE.. \r
+AJFBQA          PIPG.DWNGA GAHSNYSTKS MREEGGYEVI KKAIEKLGLR HHIAAYGK.. \r
+AJAAQ           PIKG.DWNGA GAHTNYSTKS MREDGGYEVI LKAIEKLGKK HHIAAYGE.. \r
+AJFBQB          PIKG.DWNGA GAHTNYSTKT MRNDGGYEEI KSAIQKLGKR HHIAAYGE.. \r
+AJPMQ1          PIKG.DWNGA GAHTNYSTKS MREDGGYEII KKAIEKLGKR LHISAYGE.. \r
+AJFBQ           PIQG.DWNGA GAHTNYSTKS MRNDGGYEVI KKAITKLEKR HHIAAYGE.. \r
+AJYLNB          PIPG.DWNGA GAHTNYSTKS MRNDGGYEVI KQAIEKLEKR HHIAAYGE.. \r
+AJRZQG          PIPG.DWNGA GAHTNYSTKS MRNDGGYEII KSAIEKLKLR HHISAYGE.. \r
+AJLCQB          PIPG.DWNGA GAHTNYSTKT MREEGGYEVI KKAIEKLGLR HHIAAYGE.. \r
+AJRZQB          PIPG.DWNGA GAHTNFSTKS MREPGGYEVI KKAIDKLALR HHIAAYGE.. \r
+AJFBQD          PIEG.DWNGA GCHTNYSTKS MREDGGFEVI KKAILNLSLR HHISAYGE.. \r
+AJPMQ2          PIEG.DWNGA GCHTNYSTKS MREDGGFEVI KKAILNLSLR HHIEAYGE.. \r
+AJRZQD          PIQG.DWNGA GCHTNYSTKS MREDGGFEVI KKAILNLSLR HHISAYGE.. \r
+AJBHQ           PIQG.DWNGA GCHTNYSTLS MREDGGFDVI KKAILNLSLR HHIAAYGE.. \r
+AJDHQ           PIPG.DWNGS GGHVNFSNRQ PESPPAGKQS RSSAKKLGKR HHIAAYGE.. \r
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