1a772edb53dbdca7e48aa3fb3dbb57717b65ab9c
[jabaws.git] / binaries / windows / clustalo / ChangeLog.txt
1 2010-06-17 Release 0.0.1 (Dubliniensis)\r
2                 \r
3                 First "release" as program has been able for a while to perform\r
4                 all basic tasks without problems.\r
5 \r
6                 Non-standard features already built-in include:\r
7                 HMM-iteration (using HMMER for building an HMM) and guide-tree\r
8                 iteration. On top of that HMM input works fine and\r
9                 background-frequencies are added to the HHalign process.\r
10                 \r
11                 Known issues: RNA/DNA alignment is considered buggy. Aligned\r
12                 sequences have to be dealigned for HHalign to work properly.\r
13                 \r
14                 The HMMER version message can be ignored if no HMM-iteration\r
15                 was used.\r