datamodel/compbio/data/sequence/Range.java

   1 /* Copyright (c) 2011 Peter Troshin\r
   2  *  \r
   3  *  JAva Bioinformatics Analysis Web Services (JABAWS) @version: 2.0     \r
   4  * \r
   5  *  This library is free software; you can redistribute it and/or modify it under the terms of the\r
   6  *  Apache License version 2 as published by the Apache Software Foundation\r
   7  * \r
   8  *  This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without\r
   9  *  even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the Apache \r
  10  *  License for more details.\r
  11  * \r
  12  *  A copy of the license is in apache_license.txt. It is also available here:\r
  13  * @see: http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0.txt\r
  14  * \r
  15  * Any republication or derived work distributed in source code form\r
  16  * must include this copyright and license notice.\r
  17  */\r
  18 package compbio.data.sequence;\r
  19 \r
  20 public class Range implements Comparable<Range> {\r
  21 \r
  22         public final int from;\r
  23         public final int to;\r
  24 \r
  25         private Range() {\r
  26                 // JAXB default constructor should not be used\r
  27                 from = 0;\r
  28                 to = from;\r
  29         }\r
  30 \r
  31         public Range(int from, int to) {\r
  32                 this.from = from;\r
  33                 this.to = to;\r
  34         }\r
  35 \r
  36         public Range(String[] twoElementAr) {\r
  37                 if (twoElementAr == null || twoElementAr.length != 2) {\r
  38                         throw new IllegalArgumentException();\r
  39                 }\r
  40                 this.from = Integer.parseInt(twoElementAr[0].trim());\r
  41                 this.to = Integer.parseInt(twoElementAr[1].trim());\r
  42         }\r
  43         \r
  44         // Daniel Check these get methods are ok with Jim\r
  45         public int getFrom() { return from; }\r
  46         public int getTo() { return to; }\r
  47         \r
  48         \r
  49         @Override\r
  50         public String toString() {\r
  51                 return from + "-" + to;\r
  52         }\r
  53         \r
  54 \r
  55         @Override\r
  56         public int hashCode() {\r
  57                 final int prime = 31;\r
  58                 int result = 1;\r
  59                 result = prime * result + from;\r
  60                 result = prime * result + to;\r
  61                 return result;\r
  62         }\r
  63         @Override\r
  64         public boolean equals(Object obj) {\r
  65                 if (this == obj)\r
  66                         return true;\r
  67                 if (obj == null)\r
  68                         return false;\r
  69                 if (getClass() != obj.getClass())\r
  70                         return false;\r
  71                 Range other = (Range) obj;\r
  72                 if (from != other.from)\r
  73                         return false;\r
  74                 if (to != other.to)\r
  75                         return false;\r
  76                 return true;\r
  77         }\r
  78 \r
  79         // daniel wants to mess with method. this is how it was\r
  80 //      @Override\r
  81 //      public int compareTo(Range o) {\r
  82 //              if (o == null)\r
  83 //                      return 1;\r
  84 //              return new Integer(this.from).compareTo(new Integer(o.from));\r
  85 //      }\r
  86         \r
  87         @Override\r
  88         public int compareTo(Range o) {\r
  89                 if (o == null)\r
  90                         return 1;\r
  91                 if (new Integer(this.from).compareTo(new Integer(o.from)) != 0) {\r
  92                         return new Integer(this.from).compareTo(new Integer(o.from));\r
  93                 }\r
  94                 else {\r
  95                         return new Integer(this.to).compareTo(new Integer(o.to));\r
  96                 }\r
  97         }\r
  98 \r
  99 }\r