runner/compbio/data/_structure/JpredResult.java

   1 /* Copyright (c) 2011 Peter Troshin\r
   2  *  \r
   3  *  JAva Bioinformatics Analysis Web Services (JABAWS) @version: 2.0     \r
   4  * \r
   5  *  This library is free software; you can redistribute it and/or modify it under the terms of the\r
   6  *  Apache License version 2 as published by the Apache Software Foundation\r
   7  * \r
   8  *  This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without\r
   9  *  even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the Apache \r
  10  *  License for more details.\r
  11  * \r
  12  *  A copy of the license is in apache_license.txt. It is also available here:\r
  13  * @see: http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0.txt\r
  14  * \r
  15  * Any republication or derived work distributed in source code form\r
  16  * must include this copyright and license notice.\r
  17  */\r
  18 package compbio.data._structure;\r
  19 \r
  20 import java.util.Map;\r
  21 \r
  22 /**\r
  23  * Jnet result\r
  24  * \r
  25  * jnetpred:-,H,H,H,H,H,H,H,H,H,H,H,-,-,-,-,-,-,-,-,E,E,E,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,\r
  26  * -,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,H,H,H,H,H,H,H,H,H,H\r
  27  * ,H,H,-,-,H,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,H,H,H,H,H,-,-,-,-,H,H,H,H,\r
  28  * -,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,H,H,H,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-\r
  29  * , JNETCONF:7,3,7,9,9,9,9,9,9,9,7,5,2,6,6,3,6,7,5,1,0,5,3,3,6,4,6,6,7,7,7,7,7,\r
  30  * 7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,6,3,6,8,9,9,9,9,9,9,9\r
  31  * 7,3,7,7,6,2,4,4,1,5,7,8,7,7,7,7,7,7,7,6,5,3,5,6,6,6,4,0,0,2,1,3,5,7,7,7,7,7,7\r
  32  * , JNETSOL25:B,B,-,-,-,B,-,B,-,B,B,B,-,-,-,B,-,B,-,-,-,-,-,B,-,B,-,-,-,-,-,-,\r
  33  * -,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,B,-,-,-,B,-,B,-\r
  34  * , B,B,B,-,-,-,B,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,B,-,-,B,B,-,-,-,-,B,-,-,B,B,-,-\r
  35  * ,B,\r
  36  * JNETSOL5:-,-,-,-,-,-,B,-,-,-,-,-,-,-,-,-,B,B,B,B,-,-,-,B,-,-,-,-,-,-,-,-,-\r
  37  * ,-,-\r
  38  * JNETSOL0:-,-,-,-,-,-,B,-,-,B,-,B,-,-,-,-,-,-,-,-,B,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,\r
  39  * -,-,- ,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,B,-,-,B,-,B,-,-,\r
  40  * JNETHMM:-,H,H,H,H,H,H,H,H,H,H,\r
  41  * H,-,-,-,-,-,-,-,-,E,E,E,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,\r
  42  * -,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-\r
  43  * ,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,H,H,H,H,H,H,H,H,H,H,H,\r
  44  * JNETPROPH:0.0110,0.1125,0.8552,0.0107\r
  45  * ,0.6245,0.3614,0.0120,0.8702,0.1238,0.0120\r
  46  * ,0.0193,0.9284,0.0708,0.0278,0.8703,0.1244\r
  47  * ,0.1591,0.7399,0.1456,0.2488,0.5824,0.1017,\r
  48  * JNETPROPE:0.0107,0.6245,0.3614,0.0120\r
  49  * ,0.8702,0.1238,0.0120,0.9335,0.0656,0.0102\r
  50  * ,0.9586,0.0465,0.0094,0.9662,0.0433,\r
  51  * ,0.1525,0.7103,0.1088,0.1181,0.7425,0.1784,\r
  52  * \r
  53  * \r
  54  * @author pvtroshin\r
  55  * \r
  56  */\r
  57 public class JpredResult {\r
  58 \r
  59         Map<JnetAnnotation, String> annotations;\r
  60 \r
  61 }\r