runner/compbio/runner/_impl/Environment.java

   1 /* Copyright (c) 2011 Peter Troshin\r
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  11  * \r
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  13  * @see: http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0.txt\r
  14  * \r
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  16  * must include this copyright and license notice.\r
  17  */\r
  18 package compbio.runner._impl;\r
  19 \r
  20 /**\r
  21  * This is utility class to encapsulate environmental variables like directory paths \r
  22  * @author pvtroshin\r
  23   */\r
  24 public final class Environment {\r
  25 \r
  26         private Environment() { } // prevent instantiation\r
  27         \r
  28         public static String getBlastBinDir() { \r
  29                 return  "/fc_gpfs/gjb_lab/www-refine/bin/blast_32bit/blast-2.2.17/bin/";\r
  30         }\r
  31         \r
  32         public static final String getBlastDatabasesDir() { \r
  33                 return "/db/blastdb/"; \r
  34         }\r
  35         public static final String getRPSBlastDatabasesDir() { \r
  36                 return "/db/CDD/"; \r
  37         }\r
  38 }\r