webservices/compbio/ws/client/Services.java

   1 /* Copyright (c) 2009 Peter Troshin\r
   2  *  \r
   3  *  JAva Bioinformatics Analysis Web Services (JABAWS) @version: 1.0     \r
   4  * \r
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  10  *  License for more details.\r
  11  * \r
  12  *  A copy of the license is in apache_license.txt. It is also available here:\r
  13  * @see: http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0.txt\r
  14  * \r
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  16  * must include this copyright and license notice.\r
  17  */\r
  18 \r
  19 package compbio.ws.client;\r
  20 \r
  21 import java.net.URL;\r
  22 \r
  23 import javax.xml.namespace.QName;\r
  24 import javax.xml.ws.Service;\r
  25 \r
  26 import compbio.data.msa.Annotation;\r
  27 import compbio.data.msa.JABAService;\r
  28 import compbio.data.msa.MsaWS;\r
  29 \r
  30 /**\r
  31  * List of web services currently supported by JABAWS version 2\r
  32  * \r
  33  */\r
  34 public enum Services {\r
  35         MafftWS, MuscleWS, ClustalWS, TcoffeeWS, ProbconsWS, AAConWS;\r
  36 \r
  37         public static Services getService(String servName) {\r
  38                 servName = servName.trim().toLowerCase();\r
  39                 if (servName.equalsIgnoreCase(MafftWS.toString())) {\r
  40                         return MafftWS;\r
  41                 }\r
  42                 if (servName.equalsIgnoreCase(ClustalWS.toString())) {\r
  43                         return ClustalWS;\r
  44                 }\r
  45                 if (servName.equalsIgnoreCase(TcoffeeWS.toString())) {\r
  46                         return TcoffeeWS;\r
  47                 }\r
  48                 if (servName.equalsIgnoreCase(MuscleWS.toString())) {\r
  49                         return MuscleWS;\r
  50                 }\r
  51                 if (servName.equalsIgnoreCase(ProbconsWS.toString())) {\r
  52                         return ProbconsWS;\r
  53                 }\r
  54                 if (servName.equalsIgnoreCase(AAConWS.toString())) {\r
  55                         return AAConWS;\r
  56                 }\r
  57                 return null;\r
  58         }\r
  59 \r
  60         Service getService(URL url, String sqname) {\r
  61                 QName qname = new QName(sqname, this.toString());\r
  62                 return Service.create(url, qname);\r
  63         }\r
  64 \r
  65         JABAService getInterface(Service service) {\r
  66                 assert service != null;\r
  67 \r
  68                 QName portName = new QName(service.getServiceName().getNamespaceURI(),\r
  69                                 this.toString() + "Port");\r
  70 \r
  71                 switch (this) {\r
  72                         case AAConWS :\r
  73 \r
  74                                 return service.getPort(portName, Annotation.class);\r
  75 \r
  76                                 // deliberate leaking\r
  77                         case ClustalWS :\r
  78                         case MafftWS :\r
  79                         case MuscleWS :\r
  80                         case ProbconsWS :\r
  81                         case TcoffeeWS :\r
  82                                 // TODO remove\r
  83                                 System.out.println("Qname from serv: " + portName);\r
  84 \r
  85                                 return service.getPort(portName, MsaWS.class);\r
  86 \r
  87                         default :\r
  88                                 throw new RuntimeException("Should never happened!");\r
  89                 }\r
  90         }\r
  91 }