website/quick_start.html

   1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>\r
   2 <!DOCTYPE html PUBLIC "XHTML 1.0 Strict" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-strict.dtd">\r
   3 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">\r
   4 <head>\r
   5 <meta name="Last-modified" content="Mon, 4 Apr 2011 12:00:00 GMT"/>\r
   6 <title>Java Bioinformatics Analyses Web Services (JABAWS) manual - getting started</title>\r
   7 <link href="ws.css" rel="stylesheet" type="text/css" media="screen,  projection, handheld, tv" />\r
   8 <link rel="stylesheet" type="text/css" media="print" href="print.css"/>\r
   9 \r
  10 <script type="text/javascript" src="prototype-1.6.0.3.js"></script>\r
  11 </head>\r
  12 <body>\r
  13 <div id="page">\r
  14 <div id="banner">\r
  15 <table> \r
  16 <tr><td style="width:158px;"><a href="http://www.dundee.ac.uk"><img src="images/uod_lt_long.gif"  alt="University of Dundee" width="158" height="90" class="logo"  title="University of Dundee" longdesc="http://www.dundee.ac.uk"/></a></td>\r
  17 <td class="bg"><img src="images/jabaws2.png" alt="JABAWS-2.0" title="Java Bioinformatics Analysis Web Services version 2.0"/></td>\r
  18 <td class="bg"><img src="images/banner_right.png" alt="Disorder" width="200" height="80"/></td>\r
  19 </tr>\r
  20 </table>\r
  21 </div><!-- banner end-->\r
  22 <div id="wrapper">\r
  23 <div id="panel">\r
  24         <a href="index.html">Home</a>\r
  25     <a class="selected" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
  26     <a href="man_about.html">Manual</a> \r
  27         <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/downloads/jabaws">Download</a>\r
  28     <a href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
  29         <a href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
  30         <a href="contacts.html">Contact Us</a>\r
  31     <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk" title="University of Dundee, The Barton Group" >Barton Group</a></div>\r
  32 \r
  33 <!-- panel end-->\r
  34 <div id="content">\r
  35 \r
  36 <h2 id="headtitle">Getting Started</h2>\r
  37 \r
  38 <h3><a name="whichjaba" id="whichjaba"></a>Choose a JABAWS distribution</h3>\r
  39 \r
  40 <table id="choicematrix">\r
  41 <tr>\r
  42   <th>I want to use JABAWS for...</th>\r
  43   <th>Quick Guide</th>\r
  44 </tr>\r
  45 <tr>\r
  46         <td>Running Muptiple Sequence Alignments through Jalview on my <strong>own</strong> computer</td>\r
  47     <td><a href="manual_qs_va.html#qsc">JABAWS Virtual Appliance (VA)</a></td>\r
  48 </tr>\r
  49 <tr>\r
  50   <td>Running JABAWS  on the <strong>cloud</strong>, for one or many users</td>\r
  51   <td><a href="man_awscloud.html">JABAWS on the Amazon cloud</a></td>\r
  52 </tr>\r
  53 <tr>\r
  54         <td>Running JABAWS for my group, lab, or organization on the <strong>local</strong> infrastructure </td>\r
  55     <td><a href="manual_qs_war.html#qsc">JABAWS Web Application aRchive (WAR)</a></td>\r
  56 </tr>\r
  57 <tr>\r
  58         <td>Accessing a JABAWS server from my own code</td>\r
  59     <td><a href="manual_qs_client.html#qsc">JABAWS Java Client</a></td>\r
  60 </tr>\r
  61 </table>\r
  62 \r
  63 \r
  64 \r
  65 \r
  66 \r
  67 <!-- about end-->\r
  68 </div>\r
  69 <!-- content end--> \r
  70 <div id="copyright">Last update: 16 September 2011<br/>\r
  71 Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
  72 </div><!-- wrapper end-->\r
  73 </div> <!-- page end-->\r
  74 \r
  75 <!-- Google analitics -->\r
  76 <script type="text/javascript">\r
  77 var gaJsHost = (("https:" == document.location.protocol) ? "https://ssl." : "http://www.");\r
  78 document.write(unescape("%3Cscript src='" + gaJsHost + "google-analytics.com/ga.js' type='text/javascript'%3E%3C/script%3E"));\r
  79 </script>\r
  80 <script type="text/javascript">\r
  81 try{\r
  82 var pageTracker = _gat._getTracker("UA-5356328-1");\r
  83 pageTracker._trackPageview();\r
  84 } catch(err) {}\r
  85 </script>\r
  86 </body>\r
  87 </html>\r
  88 \r