dundee executable conf
authorpvtroshin <pvtroshin@e3abac25-378b-4346-85de-24260fe3988d>
Thu, 4 Aug 2011 14:44:32 +0000 (14:44 +0000)
committerpvtroshin <pvtroshin@e3abac25-378b-4346-85de-24260fe3988d>
Thu, 4 Aug 2011 14:44:32 +0000 (14:44 +0000)
git-svn-id: link to svn.lifesci.dundee.ac.uk/svn/barton/ptroshin/JABA2@4476 e3abac25-378b-4346-85de-24260fe3988d

dundee-conf/Executable.properties

index 5d388db..a895f64 100644 (file)
@@ -24,7 +24,7 @@ clustalo.limits.file=conf/settings/ClustaloLimits.xml
 ## This parameter specifies the number of CPUs to use\r
 clustalo.cluster.cpunum=4\r
 ## This reserves a slot with CPUNUM on the cluster for the task\r
-clustalo.cluster.settings=-q 64bit-pri.q -pe smp 4 -l ram=1700M -l h_cpu=24:00:00  \r
+clustalo.cluster.settings=-q 64bit-pri.q -pe smp 4 -l ram=6000M -l h_cpu=24:00:00  \r
 \r
 \r
 ### Muscle configuration ###\r
@@ -86,7 +86,7 @@ jronn.jar.file=binaries/windows/jronn3.1.jar
 jronn.limits.file=conf/settings/JronnLimits.xml\r
 #TODO jronn.jvm.options=-Xms32M -Xmx512M\r
 jronn.cluster.cpunum=4\r
-jronn.cluster.settings=-q 64bit-pri.q -pe smp 4 -l ram=4000M -l h_cpu=24:00:00\r
+jronn.cluster.settings=-q 64bit-pri.q -pe smp 4 -l ram=6000M -l h_cpu=24:00:00\r
 \r
 \r
 ### Disembl configuration Tisean - Disembl dependancy ### \r
@@ -130,4 +130,4 @@ aacon.parameters.file=conf/settings/AAConParameters.xml
 aacon.presets.file=conf/settings/AAConPresets.xml\r
 aacon.limits.file=conf/settings/AAConLimits.xml\r
 aacon.cluster.cpunum=4\r
-aacon.cluster.settings=-q 64bit-pri.q -pe smp 4 -l ram=4000M -l h_cpu=24:00:00\r
+aacon.cluster.settings=-q 64bit-pri.q -pe smp 4 -l ram=6000M -l h_cpu=24:00:00\r