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authorSasha Sherstnev <a.sherstnev@dundee.ac.uk>
Mon, 28 Apr 2014 21:53:34 +0000 (22:53 +0100)
committerSasha Sherstnev <a.sherstnev@dundee.ac.uk>
Mon, 28 Apr 2014 21:53:34 +0000 (22:53 +0100)
19 files changed:
website/contacts.html
website/index.html
website/jabaws_funding.html
website/man_about.html
website/man_awscloud.html
website/man_awscloud_bs.html
website/man_awscloud_ec2.html
website/man_client.html
website/man_configuration.html
website/man_dev.html
website/man_server_dev.html
website/man_servervm.html
website/man_serverwar.html
website/man_stats.html
website/manual_qs_amazon.html
website/manual_qs_client.html
website/manual_qs_va.html
website/manual_qs_war.html
website/quick_start.html

index 8dcf5f8..7cf944a 100644 (file)
@@ -29,7 +29,7 @@
        <a class="newa" href="index.html">Home</a> \r
        <a class="newa" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
        <a class="newa" href="man_about.html">Manual</a> \r
-       <a class="newa" href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">Download</a> \r
+       <a class="newa" href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">Download</a> \r
        <a class="newa" href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
        <a class="newa" href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
        <a class="newpressed" href="contacts.html">Contact Us</a>\r
@@ -55,7 +55,7 @@
 <br/><br/>\r
 </div>\r
 \r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div> <!-- wrapper end-->\r
 \r
 \r
index 5acf856..86d5f94 100644 (file)
@@ -28,7 +28,7 @@
        <a class="newpressed" href="index.html">Home</a> \r
        <a class="newa" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
        <a class="newa" href="man_about.html">Manual</a> \r
-       <a class="newa" href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">Download</a> \r
+       <a class="newa" href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">Download</a> \r
        <a class="newa" href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
        <a class="newa" href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
        <a class="newa" href="contacts.html">Contact Us</a>\r
@@ -79,7 +79,7 @@ computing resources.<br />
   <div class="brick">\r
   <div class="brick_header"><h2>For Users</h2></div>\r
     <div class="brick_content">\r
-        <strong>The Server: </strong><a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/jabaws-dev/get?id=JABAWS201.pack.tar.gz">JABAWS Virtual Appliance:</a> (440M)\r
+        <strong>The Server: </strong><a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev/get?id=JABAWS201.pack.tar.gz">JABAWS Virtual Appliance:</a> (440M)\r
         or <a href="man_awscloud.html">JABAWS on Amazon Webservices Cloud</a><br/>\r
         <strong>The Main Client: </strong><a href="http://www.jalview.org/download.html">Jalview</a> (18M)\r
         <p>To use JABAWS web services on most operating systems, just download and <a href="manual_qs_va.html#qsc">install</a> \r
@@ -94,7 +94,7 @@ computing resources.<br />
       <div class="brick_header"><h2>For System Administrators</h2></div>\r
         <div class="brick_content">\r
           <p>\r
-          <strong>The Server: </strong><a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/jabaws-dev/get?id=jabaws.war">JABAWS Web \r
+          <strong>The Server: </strong><a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev/get?id=jabaws.war">JABAWS Web \r
           Application aRchive</a> (55M)\r
           </p>\r
           <p>JABAWS requires a Servlet 2.4 compatible servlet container like <a href="http://tomcat.apache.org">Apache Tomcat</a>\r
@@ -107,11 +107,11 @@ computing resources.<br />
     <td><div class="brick">\r
      <div class="brick_header"><h2>For Bioinformaticians/Developers</h2></div>\r
      <div class="brick_content">\r
-<strong>The Server: </strong><a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/jabaws-dev/get?id=jabaws.war">JABAWS Web Application aRchive</a>  (55M)\r
+<strong>The Server: </strong><a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev/get?id=jabaws.war">JABAWS Web Application aRchive</a>  (55M)\r
   <br/>\r
   <strong>The Client: </strong>\r
-      Command Line Client <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/jabaws-dev/get?id=min-jaba-client-2.1.jar">binary</a> | <a href=\r
-"http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/jabaws-dev/get?id=jaba-client-src-2.1.jar">source</a> \r
+      Command Line Client <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev/get?id=min-jaba-client-2.1.jar">binary</a> | <a href=\r
+"http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev/get?id=jaba-client-src-2.1.jar">source</a> \r
 \r
 <p>\r
 You can either use the JABAWS Virtual Appliance or the JABAWS Web Application aRchive (WAR) from your own computer or a lab server. \r
@@ -126,7 +126,7 @@ Check out the <a href="manual_qs_client.html#qsc">quick start guide</a> for furt
 </div>\r
 \r
 <h3 style="margin:0;">Public JABAWS Server</h3>\r
-<p> You can access our public JABAWS web services with our <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/jabaws-dev/get?id=min-jaba-client-2.1.jar">command line client</a>, \r
+<p> You can access our public JABAWS web services with our <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev/get?id=min-jaba-client-2.1.jar">command line client</a>, \r
     <a href="http://www.jalview.org/download.html">Jalview</a>, or with your own program. Jalview version 2.8 or later is fully compatible with JABAWS 2.1.\r
     The latest versions of Jalview are configured to use public JABAWS server by default.</p>\r
 <ul>\r
@@ -137,7 +137,7 @@ title="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws/ClustalWS?" rel=
 </ul>\r
 <p>These web services accept submissions of <strong>less than one thousand sequences</strong>.  Should you find this to be insufficient for your needs, \r
    or if you are concerned about privacy or on an unreliable network connection, then you can \r
-   <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">download</a> and run the JABAWS Server on your own hardware.</p>\r
+   <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">download</a> and run the JABAWS Server on your own hardware.</p>\r
 \r
 \r
 \r
@@ -161,7 +161,7 @@ Multiple Sequence Alignment - JABAWS:MSA&quot; <span class="i">Bioinformatics</s
 <a href="http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/early/2011/05/18/bioinformatics.btr304.abstract?keytype=ref&amp;ijkey=gd0DwuYBzFRhe4T">\r
 doi: 10.1093/bioinformatics/btr304</a>.</p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br /> This site is best viewed in Firefox 3.6, Google Chrome 10, Internet Explorer 8 or above </div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br /> This site is best viewed in Firefox 3.6, Google Chrome 10, Internet Explorer 8 or above </div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index f01d75b..dd850b9 100644 (file)
@@ -28,7 +28,7 @@
        <a class="newa" href="index.html">Home</a> \r
        <a class="newa" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
        <a class="newa" href="man_about.html">Manual</a> \r
-       <a class="newa" href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">Download</a> \r
+       <a class="newa" href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">Download</a> \r
        <a class="newa" href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
        <a class="newa" href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
        <a class="newa" href="contacts.html">Contact Us</a>\r
@@ -63,7 +63,7 @@ Further support comes from Wellcome Trust Strategic Grant: 100476.
 <br></br>\r
 <br></br>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index 084288d..4965ffb 100644 (file)
   <li><span style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;">RNAalifold from <a href="http://www.tbi.univie.ac.at/RNA">ViennaRNA</a></span> (2.0) </li>\r
 </ul>\r
 \r
-All these codes including Jronn and AAcon are available at the <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">Download</a> \r
+All these codes including Jronn and AAcon are available at the <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">Download</a> \r
 section (registration is required).\r
 \r
 \r
@@ -214,13 +214,13 @@ section (registration is required).
   JABAWS web services are WS-I basic profile compliant, which means they can be accessed using any programming language \r
   or system that can utilize standard SOAP web services. The WSDL for each service is published on the JABAWS home \r
   page, and you can use this to automatically generate service bindings for your program. If you use Java \r
-  you may wish to use our <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/jabaws-dev">client package</a> to access JABAWS. \r
+  you may wish to use our <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev">client package</a> to access JABAWS. \r
   This package is based on the autogenerated source code produced by <span class="hightlight">wsimport</span>, which \r
   is the Java tool for creating web service bindings. In addition, this offers some additional methods that simplify \r
   working with JABAWS. For more information please refer to the <a href="dm_javadoc/index.html">data model javadoc</a>.\r
 </p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index c2e7d1d..5f8bacd 100644 (file)
@@ -68,7 +68,7 @@
 <br/><br/><br/><br/><br/><br/><br/><br/><br/><br/>\r
 </div><!-- content end-->\r
 \r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index b58b419..8f0143b 100644 (file)
@@ -78,7 +78,7 @@
 <p>&nbsp;</p>\r
 </div><!-- end of jabaws_on_cloud div -->\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index a53cb98..384278e 100644 (file)
@@ -96,7 +96,7 @@
 <p>&nbsp;</p>\r
 </div><!-- end of jabaws_on_cloud div -->\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index cf6b766..585cb17 100644 (file)
@@ -53,7 +53,7 @@
 \r
 <h2><a name="usingcclient" id="usingcclient"></a>JABAWS Command Line Client Usage </h2>\r
 <p>\r
-The command line client comes as a part of <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download"> client package</a> which you are welcome to download. \r
+The command line client comes as a part of <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download"> client package</a> which you are welcome to download. \r
 The command line client can be used to align sequences using any of JABAWS supported web services. The client is OS independent and supports most of \r
 the functions which can be accessed programmatically via <a href="dm_javadoc/index.html">JABAWS API</a>. Using this client you could align sequences \r
 using presets or custom parameters, please see examples of this below. Here is the list of options supported by the command line client.\r
@@ -94,7 +94,7 @@ Please note that -r and -f options cannot be used together. Alignment is done wi
     <span class="code"> java -jar jabaws-min-client.jar -h=http://myhost.compbio.ac.uk:8080/jabaws -s=MafftWS -parameters</span></p>\r
 <p>The same client can be used to access JABAWS on different hosts. Just point the client to the host you want to use by changing the value of -h key. For example you used <span class="hightlight">-h=http://myhost.compbio.ac.uk:8080/jabaws</span> server, now you want to use another server to <span class="hightlight">-h=http://mylabserver.myuni.edu.</span> This comes handy if your favorite server is off and you need to do the job yesterday. </p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index 8e0bb14..6070e76 100644 (file)
@@ -455,7 +455,7 @@ class="hightlight">log4j.properties</span> and uncomment section of
 <p> Google Analytics can be disabled or adjusted by removing/editing <span class="hightlight">conf/GA.properties</span> Google Analytics (GA) settings file. We would appreciate it greatly if you could leave it on!</p>\r
 <p>All calls to GA are very lightweight, completed asynchronously, create very little overhead and do not influence the server response time or performance.</p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index a602a7b..de5c544 100644 (file)
 <h3><a name="connectto" id="connectto"></a>Connecting to JABAWS</h3>\r
 <p class="attention">\r
 For a complete working example of JABAWS command line client please see compbio.ws.client.Jws2Client class. JABAWS command line client \r
-source code is available from the <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/jabaws-dev">download page</a>. Please note that for now all \r
+<<<<<<< HEAD\r
+source code is available from the <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev">download page</a>. Please note that for now all \r
+the examples are in Java other languages will follow given a sufficient demand. </p>\r
+=======\r
+source code is available from the <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev">download page</a>. Please note that for now all \r
 the examples are in Java, other languages will follow if there is sufficient demand. </p>\r
+>>>>>>> 42a3637e24a7a65b5a1e6048e581df998b4a4f95\r
 <p>\r
 Download a binary JABAWS client. Add the client to the class path. The following code excerpt will connect your program to Clustal \r
 web service deployed in the University of Dundee. </p>\r
@@ -267,7 +272,7 @@ one of the  Clustal web service presets. There is also a <a href="Example_templa
 this example with syntax highlighted. The text comments are commented by block style comments e.g. /* comment */, \r
 the alternatives given in the code are line commented // comment. You may want to remove line style comments to \r
 test alternatives of the functions. All you need for this to work is a \r
-<a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/jabaws-dev/get?id=min-jaba-client-2.0.jar">JABAWS binary client</a>. \r
+<a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/jabaws-dev/get?id=min-jaba-client-2.0.jar">JABAWS binary client</a>. \r
 Please make sure that the client is in the Java class path before running this example.</p>\r
 <pre class="code" style="line-height:1em;">\r
 import java.io.ByteArrayInputStream;\r
@@ -409,7 +414,7 @@ generate portable artifacts to work with JABAWS from Java. However if programmin
 it provides a handful of useful methods in addition to plain data types. </p>\r
 <p class="code">wsimport -keep http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws/ClustalWS?wsdl</p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index 791709e..17e2cbb 100644 (file)
@@ -250,7 +250,7 @@ those that depends on the cluster.</p>
 </ol>\r
 <p>&nbsp;</p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div> <!-- page end-->\r
 \r
index 0563d99..4b35ca4 100644 (file)
@@ -154,7 +154,7 @@ in such case. If you want to be able to connect to your VM and let VM connect to
 a Bridged network. In such a case you would have to configure the VM IP address manually (unless of course your network has a DHCP \r
 server to do that)</p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index c4bcf80..c0168cb 100644 (file)
@@ -233,7 +233,7 @@ modify the paths in <span class=
   <li>If Tomcat still refuses to unpack the war file, unpack it manually into web application folder (the war file is just a zip archive). Restart the Tomcat.</li>\r
 </ul>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index 1f322d8..c12b591 100644 (file)
@@ -147,7 +147,7 @@ Each table contains the following information for each web service:
 <p><br/>\r
 </p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index 2b40520..ea250a7 100644 (file)
@@ -28,7 +28,7 @@
        <a class="newa" href="index.html">Home</a> \r
        <a class="newpressed" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
        <a class="newa" href="man_about.html">Manual</a> \r
-       <a class="newa" href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">Download</a> \r
+       <a class="newa" href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">Download</a> \r
        <a class="newa" href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
        <a class="newa" href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
        <a class="newa" href="contacts.html">Contact Us</a>\r
@@ -72,7 +72,7 @@
   <li>Configure JABAWS either on the <a href="man_awscloud_ec2.html">Amazon EC2 cloud</a> or on <a href="man_awscloud_bs.html">Amazon Elastic Beanstalk</a></li>\r
 </ol>\r
 </div><!-- content end--> \r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div> <!-- page end-->\r
 \r
index b67437c..8f496ed 100644 (file)
@@ -28,7 +28,7 @@
        <a class="newa" href="index.html">Home</a> \r
        <a class="newpressed" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
        <a class="newa" href="man_about.html">Manual</a> \r
-       <a class="newa" href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">Download</a> \r
+       <a class="newa" href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">Download</a> \r
        <a class="newa" href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
        <a class="newa" href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
        <a class="newa" href="contacts.html">Contact Us</a>\r
@@ -66,7 +66,7 @@
 \r
 <a name="qsc"/>\r
 <h3><a name="client"/>The JABAWS command line client</h3>\r
-<ul><li>Download <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">the Client Jar file</a></li>\r
+<ul><li>Download <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">the Client Jar file</a></li>\r
 </ul>\r
 <p>\r
   This is a single java archive which contains the JABAWS command line client. It requires Java \r
@@ -83,7 +83,7 @@
   <!-- TODO Provide list of libraries for different languages -->\r
 </p>\r
 </div><!-- content end--> \r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div> <!-- page end-->\r
 \r
index 3ca55d6..83021b3 100644 (file)
@@ -28,7 +28,7 @@
        <a class="newa" href="index.html">Home</a> \r
        <a class="newpressed" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
        <a class="newa" href="man_about.html">Manual</a> \r
-       <a class="newa" href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">Download</a> \r
+       <a class="newa" href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">Download</a> \r
        <a class="newa" href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
        <a class="newa" href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
        <a class="newa" href="contacts.html">Contact Us</a>\r
@@ -65,7 +65,7 @@
 \r
 <a name="qsc"/>\r
 <h3>Running JABAWS on your local machine</h3>\r
-<ul><li>Download <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">JABAWS Virtual Appliance</a></li>\r
+<ul><li>Download <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">JABAWS Virtual Appliance</a></li>\r
 </ul>\r
 <p>\r
 The Virtual Appliance (VA) package allows you to run a JABAWS server installed on TurnKey Linux as a \r
@@ -88,7 +88,7 @@ to the JABAWS VA</a> is given in the manual, but for the impatient, a brief inst
 </ol>\r
 </div>\r
 </div><!-- content end--> \r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div> <!-- page end-->\r
 \r
index a9beeed..2ac267b 100644 (file)
@@ -28,7 +28,7 @@
        <a class="newa" href="index.html">Home</a> \r
        <a class="newpressed" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
        <a class="newa" href="man_about.html">Manual</a> \r
-       <a class="newa" href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">Download</a> \r
+       <a class="newa" href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">Download</a> \r
        <a class="newa" href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
        <a class="newa" href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
        <a class="newa" href="contacts.html">Contact Us</a>\r
@@ -73,7 +73,7 @@
 </p>\r
 \r
 <ol>\r
-       <li>Download the <a href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">JABAWS WAR file</a></li>\r
+       <li>Download the <a href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">JABAWS WAR file</a></li>\r
        <li>Download and install <a href="http://tomcat.apache.org/download-70.cgi">Apache-Tomcat</a>.<br/>\r
                <span class="hightlight">You will need at least Tomcat version 5.5 of  (we would recommend version 7.0) and at least Java 1.6 (i.e. JAVA 6).</span>\r
        </li>\r
 \r
 <!--  TODO put JABAWS CMD test instructions here -->\r
 </div> <!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end -->\r
 \r
 \r
index 58258ad..13cfe79 100644 (file)
@@ -28,7 +28,7 @@
        <a class="newa" href="index.html">Home</a> \r
        <a class="newpressed" href="quick_start.html">Getting Started</a> \r
        <a class="newa" href="man_about.html">Manual</a> \r
-       <a class="newa" href="http://gjb-www-1.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8086/download">Download</a> \r
+       <a class="newa" href="http://gjb-www-4.cluster.lifesci.dundee.ac.uk:8091/download">Download</a> \r
        <a class="newa" href="PublicAnnualStat" title="JABAWS server usage statistics">Usage Statistics</a>\r
        <a class="newa" href="ServiceStatus" title="JABAWS webservices status. Click to test all web services. Please be patient while the services are being checked">Services Status</a>\r
        <a class="newa" href="contacts.html">Contact Us</a>\r
@@ -63,7 +63,7 @@
 </tr>\r
 </table>\r
 </div><!-- content end--> \r
-<div id="copyright">Last update: 14 October 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 30 April 2014<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div> <!-- page end-->\r
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