help/html/whatsNew.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   4  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  11  * of the License, or (at your option) any later version.
  12  *
  13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>What's new ?</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26   <p>
  27     <strong>What's new in Jalview 2.10.4 ?</strong>
  28   </p>
  29   <p>
  30     This is the May 2018 release of Jalview, and the last in the 2.10.x series. Jalview 2.10.4 includes:
  31   </p>
  32   <ul>
  33     <li>Numerous efficiency improvements in the renderer and overview when working with large alignments with lots of hidden columns</li>
  34     <li>Use of HTTPS when connecting to Uniprot, Ensembl and other EBI web services</li>
  35     <li>Critical patches for running Jalview on OSX with Java 10</li>
  36     <li>Easier adjustment of the Alignment ID panel and Annotation panel</li>
  37     <li>Improved support for mapping between 3D Structures and Uniprot Protein Sequences</li>
  38     <li>Improved support for discovering CDS and transcripts for Proteins and Ensembl gene IDs</li>
  39     <li>New buttons on the Structure Chooser for adding structures
  40       to an existing view, and disabling automatic superposition
  41       according to linked alignments</li>
  42     <li>Annotation transfer between Chimera and Jalview <em>(formerly only
  43         available in 'Experimental' mode)</em></li>
  44   </ul>
  45   <p>
  46     The full list of bugs fixed in this release can be found in the <a href="releases.html#Jalview.2.10.4">2.10.4
  47       Release Notes</a>.
  48   </p>
  49 </body>
  50 </html>