help/html/whatsNew.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   4  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  11  * of the License, or (at your option) any later version.
  12  *
  13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>What's new ?</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26   <p>
  27     <strong>What's new in Jalview 2.10.3b1 ?</strong>
  28   </p>
  29   <p>
  30     This is the January 2018 patch release, which addresses critical bugs in Version 2.10.3 (released November 2017).
  31     The bugs fixed in this release can be found in the <a href="releases.html#Jalview.2.10.3b1">2.10.3b1
  32       Release Notes</a>.
  33   </p>
  34   <p>The highlights for Jalview 2.10.3 include:
  35   </p>
  36   <ul>
  37     <li>Faster and more responsive UI when importing and working
  38       with wide alignments and handling hundreds and thousands of
  39       sequence features</li>
  40     <li>Improved usability with <a
  41       href="features/pdbsequencefetcher.html">PDB</a> and <a
  42       href="features/uniprotsequencefetcher.html">UniProt</a> Free Text
  43       Search dialog, and new tab for retrieval of sequences for lists of
  44       IDs.
  45     </li>
  46     <li>Short names assigned to sequences retrieved from UniProt</li>
  47     <li>Groovy console upgraded to 2.4.12 (improved support for Java 9)</li>
  48   </ul>
  49   <p>
  50     <strong><a name="experimental">Experimental Features</a></strong>
  51   </p>
  52   <p>
  53     Remember, please enable the <em>Experimental Features</em> option in
  54     the Jalview Desktop's <em>Tools</em> menu, and then restart Jalview
  55     if you want to try out features below:
  56   </p>
  57   <ul>
  58     <li><em>Annotation transfer between Chimera and Jalview</em><br />Two
  59       <a href="features/chimera.html#experimental">new entries in
  60         the Chimera viewer's Chimera menu</a> allow positional annotation to
  61       be exchanged between Chimera and Jalview.</li>
  62   </ul>
  63
  64 </body>
  65 </html>