help/html/whatsNew.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   4  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  11  * of the License, or (at your option) any later version.
  12  *
  13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>What's new ?</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26   <p>
  27     <strong>What's new in Jalview 2.10.3 ?</strong>
  28   </p>
  29   <p>
  30     Version 2.10.3 was released in November 2017. The major focus was to
  31     improve Jalview's sequence features datamodel and the scalability of
  32     the alignment rendering system. The full list of bug fixes and new
  33     features can be found in the <a href="releases.html#Jalview.2.10.3">2.10.3
  34       Release Notes</a>. Key improvements include:
  35   </p>
  36   <ul>
  37     <li>Faster and more responsive UI when importing and working
  38       with wide alignments and handling hundreds and thousands of
  39       sequence features</li>
  40     <li>Improved usability with <a
  41       href="features/pdbsequencefetcher.html">PDB</a> and <a
  42       href="features/uniprotsequencefetcher.html">UniProt</a> Free Text
  43       Search dialog, and new tab for retrieval of sequences for lists of
  44       IDs.
  45     </li>
  46     <li>Short names assigned to sequences retrieved from UniProt</li>
  47     <li>Groovy console upgraded to 2.4.12 (improved support for Java 9)</li>
  48   </ul>
  49   <p>
  50     <strong><a name="experimental">Experimental Features</a></strong>
  51   </p>
  52   <p>
  53     Remember, please enable the <em>Experimental Features</em> option in
  54     the Jalview Desktop's <em>Tools</em> menu, and then restart Jalview
  55     if you want to try out features below:
  56   </p>
  57   <ul>
  58     <li><em>Annotation transfer between Chimera and Jalview</em><br />Two
  59       <a href="features/chimera.html#experimental">new entries in
  60         the Chimera viewer's Chimera menu</a> allow positional annotation to
  61       be exchanged between Chimera and Jalview.</li>
  62   </ul>
  63
  64 </body>
  65 </html>