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[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
1 <html>
2 <!--
3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
4  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
5  * 
6  * This file is part of Jalview.
7  * 
8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
9  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
11  * of the License, or (at your option) any later version.
12  *  
13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
17  * 
18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
21  -->
22 <head>
23 <title>What's new ?</title>
24 </head>
25 <body>
26   <p>
27     <strong>What's new in Jalview 2.10.5 ?</strong>
28   </p>
29   <p>Jalview 2.10.5 is a minor release that includes critical
30     patches for users working with Ensembl, and RNA secondary structure
31     annotation.</p>
32   <ul>
33     <li>EPS, PNG and SVG export now includes hidden sequence
34       markers, and representative sequences are marked in bold.</li>
35     <li>Ensembl Client updated for Ensembl Rest API v7.<br />The
36       latest Ensembl API is not backwards compatible with earlier
37       versions of Jalview, so if you require Ensembl functionality you
38       will need to install this release.
39     </li>
40     <li>Improved support for VIENNA extended dot-bracket notation
41       for RNA secondary structure</li>
42     <li>Positional and selected region highlighting in VARNA
43       'trimmed sequence' view now more reliable</li>
44   </ul>
45   <p>The majority of improvement in 2.10.5 are due to Jalview users
46     contacting us via the jalview-discuss email list. Thanks to everyone
47     who took the time to do this !</p>
48   <p>
49     The full list of bugs fixed in this release can be found in the <a
50       href="releases.html#Jalview.2.10.5">2.10.5 Release Notes</a>.
51   </p>
52 </body>
53 </html>