73da48cf34c6e6fa3e884491e843573d25a1a7ba
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 action.force_quit = Force Quit
36 label.quit_jalview = Are you sure you want to quit Jalview?
37 label.unsaved_changes = There are unsaved changes.
38 label.save_in_progress = Some files are still saving:
39 label.unknown = Unknown
40 action.wait = Wait
41 action.cancel_quit = Cancel quit
42 action.expand_views = Expand Views
43 action.gather_views = Gather Views
44 action.page_setup = Page Setup...
45 action.reload = Reload
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47 action.open = Open
48 action.cancel = Cancel
49 action.create = Create
50 action.update = Update
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52 action.clear = Clear
53 action.accept = Accept
54 action.select_ddbb = --- Select Database ---
55 action.undo = Undo
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57 action.reset = Reset
58 action.remove_left = Remove left
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71 action.set_as_reference = Set as Reference 
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74 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
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76 action.by_conservation = By Conservation
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80 action.find = Find
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92 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
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95 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
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118 action.apply = Apply
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120 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
121 action.by_chain = By Chain
122 action.by_sequence = By Sequence
123 action.paste_annotations = Paste Annotations
124 action.format = Format
125 action.select = Select
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127 action.new_structure_view_with = Open new structure view with {0}
128 action.close = Close
129 action.add = Add
130 action.save_as = Save as...
131 action.save = Save
132 action.change_font = Change Font
133 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
134 action.colour = Colour
135 action.calculate = Calculate
136 action.select_all = Select all
137 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
138 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
139 action.deselect_all = Deselect all
140 action.invert_selection = Invert selection
141 action.using_jmol = Using Jmol
142 action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
143 action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
144 action.link = Link
145 action.group_link = Group Link
146 action.show_chain = Show Chain
147 action.show_group = Show Group
148 action.fetch_db_references = Fetch DB References
149 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
150 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
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153 label.url\: = URL:
154 label.input_file_url = Enter URL or Input File
155 label.select_feature = Select feature
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158 label.name_param = Name: {0}
159 label.group = Group
160 label.group\: = Group:
161 label.group_name = Group Name
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163 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
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165 label.description = Description
166 label.description\: = Description:
167 label.start = Start:
168 label.end = End:
169 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
170 label.service_action = Service Action:
171 label.post_url = POST URL:
172 label.url_suffix = URL Suffix
173 label.per_seq = per Sequence
174 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
175 label.amend = Amend
176 label.undo_command = Undo {0}
177 label.redo_command = Redo {0}
178 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
179 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
180 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
181 label.choose_calculation = Choose Calculation
182 label.calc_title = {0} Using {1}
183 label.tree_calc_av = Average Distance
184 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
185 label.score_model_pid = % Identity
186 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
187 label.score_model_pam250 = PAM 250
188 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
189 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
190 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
191 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
192 label.status_bar = Status bar
193 label.out_to_textbox = Output to Textbox
194 label.occupancy = Occupancy
195 # delete Clustal - use FileFormat name instead
196 label.clustal = Clustal
197 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
198 label.colourScheme_clustal = Clustal
199 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
200 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
201 label.colourScheme_zappo = Zappo
202 label.colourScheme_taylor = Taylor
203 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
204 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
205 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
206 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
207 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
208 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
209 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
210 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
211 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
212 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
213 label.colourScheme_gecos\:flower = gecos Flower
214 label.colourScheme_gecos\:blossom = gecos Blossom
215 label.colourScheme_gecos\:sunset = gecos Sunset
216 label.colourScheme_gecos\:ocean = gecos Ocean
217 label.blc = BLC
218 label.fasta = Fasta
219 label.msf = MSF
220 label.pfam = PFAM
221 label.pileup = Pileup
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223 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
224 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
225 label.show_annotations = Show annotations
226 label.hide_annotations = Hide annotations
227 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
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229 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
230 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
231 label.hide_all = Hide all
232 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
233 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
234 label.colour_text = Colour Text
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270 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
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278 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
279 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
280 label.structure_viewer = Default structure viewer
281 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
282 label.viewer_path = Path to {0} program
283 label.viewer_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
284 label.invalid_viewer_path = Path not found or not executable
285 label.viewer_missing = Structure viewer not found.<br/>Please enter the path to the executable (if installed),<br/>or download and install the program.
286 label.open_viewer_failed = Error opening {0} - is it installed?\nCheck configured path in Structure tab of Jalview''s Preferences 
287 label.min_colour = Minimum Colour
288 label.max_colour = Maximum Colour
289 label.no_colour = No Colour
290 label.use_original_colours = Use Original Colours
291 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
292 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
293 label.selection = Selection
294 label.group_colour = Group Colour
295 label.sequence = Sequence
296 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
297 label.min_value = Min value
298 label.max_value = Max value
299 label.no_value = No value
300 label.new_feature = New Feature
301 label.match_case = Match Case
302 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
303 label.labels = Labels
304 label.output_values = Output Values...
305 label.output_points = Output points...
306 label.output_transformed_points = Output transformed points
307 label.input_data = Input Data...
308 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
309 label.protein_matrix = Protein matrix
310 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
311 label.show_distances = Show distances
312 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
313 label.fit_to_window = Fit To Window
314 label.newick_format = Newick Format
315 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
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318 label.wireframe = Wireframe
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321 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
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323 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
324 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
325 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
326 label.removed_columns = Removed {0} columns.
327 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
328 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
329 label.order_by_params = Order by {0}
330 label.html_content = <html>{0}</html>
331 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
332 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
333 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
334 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
335 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
336 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
337 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
338 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
339 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
340 label.paste_your = Paste your
341 label.finished_searching = Finished searching
342 label.subsequence_matches_found = {0} subsequence matches found
343 label.search_results= Search results {0} : {1}
344 label.found_match_for = Found match for {0}
345 label.font = Font:
346 label.size = Size:
347 label.style = Style:
348 label.calculating = Calculating....
349 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
350 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
351 label.set_this_label_text = set this label text
352 label.sequences_from = Sequences from {0}
353 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
354 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
355 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
356 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
357 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
358 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
359 label.source_to_target = {0} ... {1}
360 label.per_sequence_only= Per-sequence only
361 label.to_file = to File
362 label.to_textbox = to Textbox
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366 label.channels = Channels
367 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
368 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
369 label.groovy_console = Groovy Console...
370 label.lineart = Lineart
371 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
372 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
373 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
374 label.invert_selection = Invert Selection
375 label.optimise_order = Optimise Order
376 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
377 label.load_colours = Load Colours
378 label.save_colours = Save Colours
379 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
380 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
381 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
382 label.database_param = Database: {0}
383 label.example = Example
384 label.example_param = Example: {0}
385 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
386 label.file_format_not_specified = File format not specified
387 label.couldnt_save_file = Couldn''t save file: {0}
388 label.error_saving_file = Error Saving File
389 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
390 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
391 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
392 label.invalid_selection = Invalid Selection
393 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
394 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
395 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
396 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
397 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
398 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
399 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
400 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
401 label.translation_failed = Translation Failed
402 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
403 label.implementation_error  = Implementation error:
404 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
405 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
406 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
407 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
408 label.view_name_original = Original
409 label.enter_view_name = Enter View Name
410 label.enter_label = Enter label
411 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
412 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
413 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
414 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
415 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
416 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn''t read the pasted text {0}
417 label.error_parsing_text = Error parsing text
418 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
419 label.input_alignment = Input Alignment
420 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
421 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
422 label.url_not_found = URL not found
423 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
424 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
425 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
426 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
427 label.invalid_url = Invalid URL !
428 label.error_loading_file = Error loading file
429 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
430 label.file_open_error = File open error
431 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
432 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
433 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
434 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
435 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
436 label.alignment_props = Alignment Properties
437 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
438 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
439 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
440 label.annotations = Annotations
441 label.structure_options = Structure Options
442 label.features = Features
443 label.overview_params = Overview {0}
444 label.paste_newick_file = Paste Newick file
445 label.load_tree_from_file = From File - 
446 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
447 label.selection_output_command = Selection output - {0}
448 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
449 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
450 label.pca_details = PCA details
451 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
452 label.user_defined_colours = User defined colours
453 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
454 label.jaview_build_date = Build date: {0}
455 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
456 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
457 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
458 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
459 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
460 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
461 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
462 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
463 label.right_click = Right click
464 label.to_add_annotation = to add annotation
465 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
466 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
467 label.label = Label
468 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
469 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
470 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
471 label.calculating_pca= Calculating PCA
472 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
473 label.jalview_applet = Jalview applet
474 label.loading_data = Loading data
475 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
476 label.calculating_tree = Calculating tree
477 label.state_queueing = queuing
478 label.state_running = running
479 label.state_completed = finished
480 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
481 label.state_job_error = job error!
482 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
483 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
484 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
485 label.structure_type = Structure type
486 label.settings_for_type = Settings for {0}
487 label.view_full_application = View in Full Application
488 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
489 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
490 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
491 label.load_vcf_file = Load VCF File
492 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
493 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
494 label.export_features = Export Features...
495 label.export_annotations = Export Annotations...
496 label.to_upper_case = To Upper Case
497 label.to_lower_case = To Lower Case
498 label.toggle_case = Toggle Case
499 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
500 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
501 label.edit_sequence = Edit Sequence
502 label.edit_sequences = Edit Sequences
503 label.insert_gap = Insert 1 gap
504 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
505 label.delete_gap = Delete 1 gap
506 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
507 label.sequence_details = Sequence Details
508 label.viewer_help = {0} Help
509 label.close_viewer = Close Viewer
510 label.confirm_close_viewer = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the {1} window as well?
511 label.all = All
512 label.sort_by = Sort alignment by
513 label.sort_by_score = Sort by Score
514 label.sort_by_density = Sort by Density
515 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
516 label.sort_ann_by = Sort annotations by
517 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
518 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
519 label.reveal = Reveal
520 label.hide_columns = Hide Columns
521 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
522 label.load_tree_file = Load a tree file
523 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
524 label.standard_databases = Standard Databases
525 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
526 label.fetch_uniprot_references = Fetch Uniprot references
527 label.search_3dbeacons = Search 3D-Beacons
528 label.find_models_from_3dbeacons = Search 3D-Beacons for 3D structures and models
529 label.3dbeacons = 3D-Beacons
530 label.fetch_references_for = Fetch database references for {0} sequences ?
531 label.fetch_references_for_3dbeacons = 3D Beacons needs to fetch Uniprot References for {0} sequences.  Do you want to continue ?
532 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
533 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
534 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
535 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
536 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
537 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
538 label.adjust_threshold = Adjust threshold
539 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
540 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
541 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
542 label.open_url_param = Open URL {0}
543 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
544 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
545 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
546 label.dark_colour = Dark Colour
547 label.light_colour = Light Colour
548 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
549 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
550 label.copy_format_from = Copy format from
551 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
552 label.select_all_views = Select all views
553 label.select_many_views = Select many views
554 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
555 label.open_local_file = Open local file
556 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
557 label.listen_for_selections = Listen for selections
558 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
559 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
560 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
561 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
562 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
563 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
564 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
565 label.no_services = <No Services>
566 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
567 label.from_url = from URL
568 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
569 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
570 label.from_textbox = from Textbox
571 label.window = Window
572 label.preferences = Preferences
573 label.tools = Tools
574 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
575 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
576 label.collect_garbage = Collect Garbage
577 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
578 label.show_java_console = Show Java Console
579 label.show_jalview_news = Show Jalview News
580 label.take_snapshot = Take snapshot
581 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
582 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
583 label.monospaced_font= Monospaced
584 label.quality = Quality
585 label.maximize_window = Maximize Window
586 label.conservation = Conservation
587 label.consensus = Consensus
588 label.histogram = Histogram
589 label.logo = Logo
590 label.non_positional_features = List Non-positional Features
591 label.database_references = List Database References
592 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
593 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
594 label.gap_symbol = Gap Symbol
595 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
596 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
597 label.address = Address
598 label.host = Host
599 label.port = Port
600 label.default_browser_unix_windows = Default Browser (Unix, Windows)
601 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
602 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
603 label.check_for_latest_version = Check for latest version
604 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
605 label.no_proxy = No proxy servers
606 label.system_proxy = System proxy servers (http={0}; https={1})
607 label.use_proxy_server = Use these proxy servers
608 label.auth_required = Authentication required
609 label.username = Username
610 label.password = Password
611 label.proxy_password_required = Proxy password required
612 label.not_stored = not stored in Preferences file
613 label.rendering_style = {0} rendering style
614 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
615 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
616 label.smooth_font = Smooth Font
617 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
618 label.pad_gaps = Pad Gaps
619 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
620 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
621 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
622 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
623 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
624 label.right_align_ids = Right Align Ids
625 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
626 label.open_overview = Open Overview
627 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
628 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
629 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
630 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
631 label.visual = Visual
632 label.connections = Connections
633 label.output = Output
634 label.editing = Editing
635 label.web_services = Web Services
636 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
637 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
638 label.fetch_viewer_attributes = Fetch {0} attributes
639 label.fetch_viewer_attributes_tip = Copy {0} attribute to Jalview feature
640 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
641 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
642 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
643 label.new_service_url = New Service URL
644 label.edit_service_url = Edit Service URL
645 label.delete_service_url = Delete Service URL
646 label.details = Details
647 label.options = Options
648 label.parameters = Parameters
649 label.proxy_servers = Proxy Servers
650 label.file_output = File Output
651 label.select_input_type = Select input type
652 label.set_options_for_type = Set options for type
653 label.data_input_parameters = Data input parameters
654 label.data_returned_by_service = Data returned by service
655 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
656 label.parsing_errors = Parsing errors
657 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
658 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
659 label.input_parameter_name = Input Parameter name
660 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
661 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
662 label.brief_description_service = Brief description of service
663 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
664 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
665 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
666 label.gap_character = Gap character
667 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
668 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
669 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
670 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
671 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
672 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
673 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
674 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
675 label.input_output = Input/Output
676 label.cut_paste = Cut'n'Paste
677 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
678 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
679 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
680 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
681 label.from_file = From File
682 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
683 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
684 label.text_colour = Text Colour...
685 label.structure = Structure
686 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
687 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
688 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
689 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
690 label.sequence_name = Sequence Name
691 label.sequence_description = Sequence Description
692 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
693 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
694 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
695 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
696 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
697 label.web_browser_not_found = Web browser not found
698 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
699 label.html = HTML
700 label.wrap = Wrap
701 label.show_database_refs = Show Database Refs
702 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
703 label.save_png_image = Save As PNG Image
704 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
705 label.export_image = Export Image
706 label.vamsas_store = VAMSAS store
707 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
708 label.reverse = Reverse
709 label.reverse_complement = Reverse Complement
710 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
711 label.extract_scores = Extract Scores
712 label.get_cross_refs = Get Cross-References
713 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
714 label.add_sequences = Add Sequences
715 label.new_window = New Window
716 label.split_window = Split Window
717 label.set_as_default = Set as Default
718 label.show_labels = Show labels
719 action.background_colour = Background Colour...
720 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
721 label.link_name = Link Name
722 label.pdb_file = PDB file
723 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
724 label.let_viewer_manage_structure_colours = Let viewer manage structure colours
725 label.colour_with_viewer = Colour in structure viewer
726 label.superpose_structures = Superpose Structures
727 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
728 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
729 label.create_viewer_attributes = Write Jalview features
730 label.create_viewer_attributes_tip = Set structure residue attributes for Jalview features
731 label.attributes_set = {0} attribute values set on {1}
732 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
733 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
734 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
735 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
736 label.case_sensitive = Case Sensitive
737 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
738 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
739 label.index_by_host = Index by Host
740 label.index_by_type = Index by Type
741 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
742 label.display_warnings = Display Warnings
743 label.move_url_up = Move URL Up
744 label.move_url_down = Move URL Down
745 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
746 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
747 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
748 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
749 label.sequences_updated = Sequences updated
750 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
751 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
752 label.paste_new_window = Paste To New Window
753 label.settings_for_param = Settings for {0}
754 label.view_params = View {0}
755 label.aacon_calculations = AACon Calculations
756 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
757 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
758 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
759 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
760 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
761 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
762 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
763 label.all_views = All Views
764 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
765 label.realign_with_params = Realign with {0}
766 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
767 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
768 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
769 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
770 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
771 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
772 label.view_documentation = View documentation
773 label.select_return_type = Select return type
774 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
775 label.features_for_params = Features for - {0}
776 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
777 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
778 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
779 label.varna_params = VARNA - {0}
780 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
781 label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
782 label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
783 label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
784 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
785 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
786 label.points_for_params = Points for {0}
787 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
788 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
789 label.select_background_colour = Select Background Colour
790 label.invalid_font = Invalid Font
791 label.search_db_all = Search all of {0}
792 label.search_db_index = Search {0} index {1}
793 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
794 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0} separated by a semi-colon ";"
795 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
796 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
797 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
798 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
799 label.example_query_param = Example query: {0}
800 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
801 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
802 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
803 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
804 label.select_columns_containing = Select columns containing
805 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
806 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
807 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
808 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
809 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
810 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
811 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
812 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
813 label.use_sequence_id_4 = 
814 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
815 label.switch_server = Switch server
816 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
817 label.services_at = Services at {0}
818 label.rest_client_submit = {0} using {1}
819 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
820 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
821 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
822 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
823 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
824 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
825 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
826 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
827 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
828 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
829 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
830 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
831 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
832 label.user_preset = User Preset
833 label.service_preset = Service Preset
834 label.run_with_preset = Run {0} with preset
835 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
836 action.by_title_param = By {0}
837 label.source_from_db_source = Sources from {0}
838 label.from_msname = from {0}
839 label.superpose_with = Superpose with
840 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
841 label.add_new_row = Add New Row
842 label.edit_label_description = Edit Label/Description
843 label.hide_row = Hide This Row
844 label.delete_row = Delete This Row
845 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
846 label.export_annotation = Export Annotation
847 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
848 label.helix = Helix
849 label.sheet = Sheet
850 label.rna_helix = RNA Helix
851 label.remove_annotation = Remove Annotation
852 label.colour_by = Colour by...
853 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
854 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
855 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
856 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
857 label.multiharmony = Multi-Harmony
858 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
859 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
860 label.prompt_each_time = Prompt each time
861 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
862 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
863 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
864 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
865 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
866 label.invalid_name = Invalid name
867 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
868 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
869 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
870 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn''t be located.
871 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
872 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
873 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
874 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
875 label.feature_type = Feature Type
876 label.show = Show
877 label.service_url = Service URL
878 label.copied_sequences = Copied sequences
879 label.cut_sequences = Cut Sequences
880 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
881 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
882 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
883 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
884 label.save_features_to_file = Save Features to File
885 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
886 label.save_pdb_file = Save PDB File
887 label.save_text_to_file = Save Text to File
888 label.save_state = Save State
889 label.restore_state = Restore State
890 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
891 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
892 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
893 label.select_startup_file = Select startup file
894 label.select_default_browser = Select default web browser
895 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
896 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
897 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
898 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
899 label.save_as_html = Save as HTML
900 label.recently_opened = Recently Opened
901 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
902 label.tree = Tree
903 label.tree_from = Tree from {0}
904 label.webservice_job_title = {0} using {1}
905 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
906 label.visible = Visible
907 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
908 label.visible_region_of = visible region of
909 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
910 label.loading_file = Loading File: {0}
911 label.edit_params = Edit {0}
912 label.as_percentage = As Percentage
913 error.not_implemented = Not implemented
914 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
915 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
916 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
917 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
918 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
919 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
920 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
921 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
922 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
923 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
924 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
925 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
926 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
927 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
928 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
929 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
930 error.implementation_error = Implementation error
931 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
932 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
933 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
934 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
935 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
936 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
937 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
938 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
939 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
940 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
941 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
942 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
943 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
944 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
945 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
946 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
947 label.cancelled_params = Cancelled {0}
948 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
949 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
950 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
951 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
952 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
953 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
954 error.invalid_value_for_option = Invalid value ''{0}'' for option ''{1}''
955 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
956 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
957 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
958 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
959 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
960 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
961 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
962 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
963 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
964 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
965 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
966 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
967 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
968 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
969 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
970 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
971 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
972 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
973 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
974 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
975 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
976 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
977 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
978 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
979 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
980 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
981 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
982 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
983 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
984 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can''t locate either oldname ({0}) or presetName ({1}) in the datastore!"
985 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
986 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
987 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
988 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
989 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
990 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
991 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
992 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn''t encode {0} as UTF-8.
993 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
994 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
995 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
996 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
997 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
998 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
999 label.no_highlighted_regions_marked = No highlighted regions marked
1000 label.toggled = Toggled
1001 label.marked = Marked
1002 label.containing = containing
1003 label.not_containing = not containing
1004 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
1005 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
1006 label.submission_params = Submission {0}
1007 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1008 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1009 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1010 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1011 label.pca_calculating = Calculating PCA
1012 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1013 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1014 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1015 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1016 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1017 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1018 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1019 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1020 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1021 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1022 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1023 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1024 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1025 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1026 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1027 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1028 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1029 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1030 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1031 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1032 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1033 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1034 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1035 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1036 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1037 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1038 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1039 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1040 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1041 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1042 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1043 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1044 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1045 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1046 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1047 label.mapped = mapped
1048 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1049 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn''t parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1050 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1051 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1052 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn''t access datasource ({0})
1053 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn''t process data as RNAML file ({0})
1054 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1055 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1056 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1057 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1058 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1059 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1060 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn''t store sequence mappings for {0}
1061 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1062 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1063 exception.browser_unable_to_launch = Unable to launch browser: {0}
1064 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1065 exception.browser_os_not_supported = Launching browser on this operating system not supported.  Use URL\n{0}
1066 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1067 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1068 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1069 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1070 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1071 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1072 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1073 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1074 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1075 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1076 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1077 label.remove_gaps = Remove Gaps
1078 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1079 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1080 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1081 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1082 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1083 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1084 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1085 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1086 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1087 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1088 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1089 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1090 warn.service_not_supported = Service not supported!
1091 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1092 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1093 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1094 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn''t support this program.\n{0}
1095 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1096 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1097 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1098 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1099 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1100 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1101 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1102 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1103 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1104 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1105 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1106 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1107 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1108 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1109 label.eps_file = EPS file
1110 label.png_image = PNG image
1111 status.export_complete = {0} Export completed
1112 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1113 status.refreshing_news = Refreshing news
1114 status.opening_params = Opening {0}
1115 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1116 status.finshed_querying = Finished querying
1117 status.parsing_results = Parsing results.
1118 status.processing = Processing...
1119 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1120 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1121 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1122 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1123 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1124 status.searching_3d_beacons = Searching 3D Beacons
1125 status.no_structures_discovered_from_3d_beacons = No models discovered from 3D Beacons
1126 status.opening_file_for = opening file for
1127 status.colouring_structures = Colouring structures
1128 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1129 label.font_too_small = Font size is too small
1130 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1131 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1132 label.out_of_memory = Out of memory
1133 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1134 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1135 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1136 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1137 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1138 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1139 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1140 label.test_server = Test Server?
1141 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1142 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1143 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1144 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1145 label.file_already_exists = File exists
1146 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1147 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1148 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1149 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1150 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1151 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1152 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1153 label.delete_all = Delete all sequences
1154 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1155 label.add_annotations_for = Add annotations for
1156 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1157 label.choose_annotations = Choose Annotations
1158 label.find = Find
1159 label.in = in
1160 label.invalid_search = Search string invalid
1161 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1162 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1163 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1164 label.show_group_logo = Show Group Logo
1165 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1166 label.show_histogram = Show Histogram
1167 label.show_logo = Show Logo
1168 label.normalise_logo = Normalise Logo
1169 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1170 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1171 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1172 label.open_split_window = Open split window
1173 action.no = No
1174 action.yes = Yes
1175 label.for = for
1176 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1177 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1178 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1179 label.alpha_helix = Alpha Helix
1180 label.beta_strand = Beta Strand
1181 label.turn = Turn
1182 label.select_all = Select All
1183 label.structures_filter = Structures Filter
1184 label.search_filter = Search Filter
1185 label.include_description= Include Description
1186 action.back = Back
1187 label.hide_insertions = Hide Insertions
1188 label.mark_as_representative = Mark as representative
1189 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1190 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1191 label.result = result
1192 label.results = results
1193 label.structure_chooser = Structure Chooser
1194 label.invert = Invert 
1195 label.select_pdb_file = Select PDB File
1196 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1197 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1198 label.search_result = Search Result
1199 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1200 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1201 label.start_jalview = Start Jalview
1202 label.biojs_html_export = BioJS
1203 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1204 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1205 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1206 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1207 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1208 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1209 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1210 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1211 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1212 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1213 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1214 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1215 action.export_groups = Export Groups
1216 action.export_annotations = Export Annotations
1217 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1218 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1219 action.export_features = Export Features
1220 label.export_settings = Export Settings
1221 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1222 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1223 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1224 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1225 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1226 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1227 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1228 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1229 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1230 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1231 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1232 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1233 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1234 label.run_groovy = Run Groovy console script
1235 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1236 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1237 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1238 action.next_page= >> 
1239 action.prev_page= << 
1240 label.next_page_tooltip=Next Page
1241 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1242 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1243 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1244 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1245 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1246 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1247 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1248 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1249 label.column = Column
1250 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1251 label.operation_failed = Operation failed
1252 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1253 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1254 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1255 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1256 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1257 action.customfilter = Custom only
1258 action.showall = Show All
1259 label.insert = Insert:
1260 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1261 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1262 label.primary = Double Click
1263 label.inmenu = In Menu
1264 label.id = ID
1265 label.database = Database
1266 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1267 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1268 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1269 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1270 label.urllinks = Links
1271 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1272 label.togglehidden = Show hidden regions
1273 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1274 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1275 label.consensus_descr = PID
1276 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1277 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1278 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1279 label.show_experimental = Enable experimental features
1280 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1281 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1282 label.overview_settings = Overview settings
1283 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1284 label.gap_colour = Gap colour:
1285 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1286 label.hidden_colour = Hidden colour:
1287 label.select_gap_colour = Select gap colour
1288 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1289 label.overview = Overview
1290 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1291 label.oview_calc = Recalculating overview...
1292 label.feature_details = Feature details
1293 label.matchCondition_contains = Contains
1294 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1295 label.matchCondition_matches = Matches
1296 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1297 label.matchCondition_present = Is present
1298 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1299 label.matchCondition_eq = =
1300 label.matchCondition_ne = not =
1301 label.matchCondition_lt = <
1302 label.matchCondition_le = <=
1303 label.matchCondition_gt = >
1304 label.matchCondition_ge = >=
1305 label.numeric_required = The value should be numeric
1306 label.filter = Filter
1307 label.filters = Filters
1308 label.join_conditions = Join conditions with
1309 label.delete_condition = Delete this condition
1310 label.score = Score
1311 label.colour_by_label = Colour by label
1312 label.variable_colour = Variable colour...
1313 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1314 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1315 option.autosearch = Autosearch
1316 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1317 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1318 label.simple_colour = Simple Colour
1319 label.colour_by_text = Colour by text
1320 label.graduated_colour = Graduated Colour
1321 label.by_text_of = By text of
1322 label.by_range_of = By range of
1323 label.or = Or
1324 label.and = And
1325 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1326 label.best_quality = Best Quality
1327 label.best_resolution = Best Resolution
1328 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1329 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1330 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1331 label.cached_structures = Cached Structures
1332 label.free_text_search = Free Text Search
1333 label.annotation_name = Annotation Name
1334 label.annotation_description = Annotation Description 
1335 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1336 label.alignment = alignment
1337 label.pca = PCA
1338 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1339 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1340 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1341 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1342 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1343 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1344 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1345 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1346 label.continue_operation = Continue operation?
1347 label.continue = Continue
1348 label.backups = Backups
1349 label.backup = Backup
1350 label.backup_files = Backup Files
1351 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1352 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1353 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1354 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1355 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1356 label.scheme_examples = Scheme examples
1357 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1358 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1359 label.keep_files = Deleting old backup files
1360 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1361 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1362 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1363 label.always_ask = Always ask
1364 label.auto_delete = Automatically delete
1365 label.filename = filename
1366 label.braced_oldest = (oldest)
1367 label.braced_newest = (most recent)
1368 label.configuration = Configuration
1369 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1370 label.schemes = Schemes
1371 label.customise = Customise
1372 label.custom = Custom
1373 label.default = Default
1374 label.single_file = Single backup
1375 label.keep_all_versions = Keep all versions
1376 label.rolled_backups = Rolled backup files
1377 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1378 label.custom_description = Your own saved scheme
1379 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1380 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1381 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1382 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1383 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1384 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1385 label.include_backup_files = Include backup files
1386 label.cancel_changes = Cancel changes
1387 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1388 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1389 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1390 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1391 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1392 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1393 label.delete = Delete
1394 label.rename = Rename
1395 label.keep = Keep
1396 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1397 label.annotation_name = Annotation Name
1398 label.annotation_description = Annotation Description 
1399 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1400 label.alignment = alignment
1401 label.pca = PCA
1402 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1403 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1404 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu
1405 label.show_linked_features = Show {0} features
1406 label.on_top = on top
1407 label.include_linked_features = Include {0} features
1408 label.include_linked_tooltip = Include visible {0} features<br>converted to local sequence coordinates
1409 label.features_not_shown = {0} feature(s) not shown
1410 label.no_features_to_sort_by = No features to sort by
1411 label.ignore_hidden = Ignore hidden columns
1412 label.ignore_hidden_tooltip = Ignore any characters in hidden columns when matching
1413 label.log_level = Log level
1414 label.log_level_tooltip = Temporarily set the log level for this console. The log level will revert to {0} when this Java console is closed.
1415 label.copy_to_clipboard = Copy to clipboard
1416 label.copy_to_clipboard_tooltip = Copy all of the log text in this console to the system clipboard
1417 label.startup = Startup
1418 label.memory = Memory
1419 label.customise_memory_settings = Customise maximum memory settings
1420 label.memory_setting_text = New memory settings will only come into effect the next time you start Jalview
1421 label.maximum_memory_used = Maximum memory limited to both
1422 label.percent_of_physical_memory = Maximum percent of physical memory
1423 label.maximum_memory = Maximum absolute memory
1424 label.maximum_memory_tooltip = Enter memory as an integer number optionally followed by 'b', 'k', 'm', 'g' or 't'
1425 label.adjustments_for_this_computer = Adjustments for this computer
1426 label.memory_example_text = Maximum memory that would be used with these settings on this computer
1427 label.memory_example_tooltip = The memory allocated to Jalview is the smaller of the percentage of physical memory (default 90%) and the maximum absolute memory (default 32GB). If your computer's memory cannot be ascertained then the maximum absolute memory defaults to 8GB (if not customised).<br>Jalview will always try and reserve 512MB for the OS and at least 512MB for itself.
1428 warning.wrong_jvm_version_title = Wrong Java Version
1429 warning.wrong_jvm_version_message = The Java version being used (Java {0}) may lead to problems.\nThis installation of Jalview should be used with Java {1}.