src/ext/edu/ucsf/rbvi/strucviz2/StructureSettings.java

   1 package ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2;
   2
   3 /**
   4  * This object maintains the relationship between Chimera objects and Cytoscape
   5  * objects.
   6  */
   7 public class StructureSettings
   8 {
   9
  10   // @Tunable(description = "Path to UCSF Chimera application", gravity = 4.0)
  11   public String chimeraPath = null;
  12
  13   public StructureSettings(StructureManager manager)
  14   {
  15
  16     chimeraPath = manager.getCurrentChimeraPath(null);
  17
  18     // This seems a little strange, but it has to do with the order of tunable
  19     // interceptor
  20     // handling. We need to set these selectors in our structure manager and
  21     // dynamically
  22     // pull the data out as needed....
  23     manager.setStructureSettings(this);
  24   }
  25
  26   public String getChimeraPath()
  27   {
  28     return chimeraPath;
  29   }
  30 }