src/jalview/bin/JalviewLite.java

   1 /*\r
   2 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3 * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4 *\r
   5 * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6 * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7 * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8 * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9 *\r
  10 * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13 * GNU General Public License for more details.\r
  14 *\r
  15 * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16 * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18 */\r
  19 \r
  20 package jalview.bin;\r
  21 \r
  22 import java.applet.*;\r
  23 import java.awt.*;\r
  24 import java.awt.event.*;\r
  25 import jalview.datamodel.*;\r
  26 import jalview.io.*;\r
  27 import jalview.appletgui.AlignFrame;\r
  28 \r
  29 public class JalviewLite extends Applet\r
  30 {\r
  31   static int lastFrameX = 200;\r
  32   static int lastFrameY = 200;\r
  33   static Applet applet;\r
  34   boolean fileFound = true;\r
  35   String file = "No file";\r
  36   Button launcher = new Button("Start Jalview");\r
  37 \r
  38   public void init()\r
  39   {\r
  40     applet = this;\r
  41     this.setBackground(Color.white);\r
  42 \r
  43     file = getParameter("file");\r
  44     if (file != null)\r
  45     {\r
  46       add(launcher);\r
  47       file = applet.getCodeBase() + file;\r
  48       launcher.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
  49      {\r
  50        public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  51        {\r
  52          String format = jalview.io.IdentifyFile.Identify( file, "URL");\r
  53          LoadFile(file, "URL", format);\r
  54        }\r
  55      });\r
  56     }\r
  57      else\r
  58      {\r
  59        file = "NO FILE";\r
  60        fileFound = false;\r
  61      }\r
  62    }\r
  63 \r
  64 \r
  65    public static void showURL(String url)\r
  66    {\r
  67      try{\r
  68        applet.getAppletContext().showDocument(new java.net.URL(url), "HELP_WINDOW");\r
  69      }catch(Exception ex){}\r
  70    }\r
  71 \r
  72    public void LoadFile(String file, String protocol,  String format)\r
  73    {\r
  74      LoadingThread loader = new LoadingThread(file, protocol, format, this);\r
  75      loader.start();\r
  76    }\r
  77 \r
  78    public static void addFrame(final Frame frame, String title, int width, int height)\r
  79    {\r
  80      frame.setLocation(lastFrameX,lastFrameY);\r
  81      lastFrameX+=40; lastFrameY+=40;\r
  82      frame.setSize(width,height);\r
  83      frame.setTitle(title);\r
  84      frame.addWindowListener(new WindowAdapter()\r
  85     {\r
  86       public void windowClosing(WindowEvent e)\r
  87       {\r
  88         frame.dispose();\r
  89       }\r
  90     });\r
  91     frame.setVisible(true);\r
  92    }\r
  93 \r
  94 \r
  95    public void paint(Graphics g)\r
  96    {\r
  97      if(!fileFound)\r
  98      {\r
  99        g.setColor(new Color(200,200,200));\r
 100        g.setColor(Color.cyan);\r
 101        g.fillRect(0,0,getSize().width, getSize().height);\r
 102        g.setColor(Color.red);\r
 103        g.drawString("Jalview can't open file", 5, 15);\r
 104        g.drawString("\""+ file+"\"", 5, 30);\r
 105      }\r
 106    }\r
 107 \r
 108    class LoadingThread extends Thread\r
 109    {\r
 110      String file, protocol, format;\r
 111      JalviewLite jlapplet;\r
 112 \r
 113      public LoadingThread(String file, String protocol,  String format, JalviewLite applet)\r
 114      {\r
 115        this.file = file;\r
 116        this.protocol = protocol;\r
 117        this.format = format;\r
 118        this.jlapplet = applet;\r
 119      }\r
 120      public void run()\r
 121      {\r
 122        SequenceI [] sequences = null;\r
 123        sequences = FormatAdapter.readFile(file, protocol, format);\r
 124 \r
 125        if (sequences != null && sequences.length>0)\r
 126        {\r
 127          AlignFrame af = new AlignFrame(new Alignment(sequences), jlapplet );\r
 128          addFrame(af, file, AlignFrame.NEW_WINDOW_WIDTH, AlignFrame.NEW_WINDOW_HEIGHT);\r
 129          af.statusBar.setText("Successfully loaded file " + file);\r
 130        }\r
 131        else\r
 132        {\r
 133          fileFound = false;\r
 134          remove(launcher);\r
 135          repaint();\r
 136        }\r
 137      }\r
 138    }\r
 139 }\r
 140 \r
 141 \r