src/jalview/binding/JSeq.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.binding;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import java.io.IOException;\r
  15 import java.io.Reader;\r
  16 import java.io.Serializable;\r
  17 import java.io.Writer;\r
  18 import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
  19 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
  20 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
  21 import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
  22 import org.xml.sax.ContentHandler;\r
  23 \r
  24 /**\r
  25  * Class JSeq.\r
  26  * \r
  27  * @version $Revision$ $Date$\r
  28  */\r
  29 public class JSeq implements java.io.Serializable {\r
  30 \r
  31 \r
  32       //--------------------------/\r
  33      //- Class/Member Variables -/\r
  34     //--------------------------/\r
  35 \r
  36     /**\r
  37      * Field _colour\r
  38      */\r
  39     private int _colour;\r
  40 \r
  41     /**\r
  42      * keeps track of state for field: _colour\r
  43      */\r
  44     private boolean _has_colour;\r
  45 \r
  46     /**\r
  47      * Field _start\r
  48      */\r
  49     private int _start;\r
  50 \r
  51     /**\r
  52      * keeps track of state for field: _start\r
  53      */\r
  54     private boolean _has_start;\r
  55 \r
  56     /**\r
  57      * Field _end\r
  58      */\r
  59     private int _end;\r
  60 \r
  61     /**\r
  62      * keeps track of state for field: _end\r
  63      */\r
  64     private boolean _has_end;\r
  65 \r
  66     /**\r
  67      * Field _id\r
  68      */\r
  69     private int _id;\r
  70 \r
  71     /**\r
  72      * keeps track of state for field: _id\r
  73      */\r
  74     private boolean _has_id;\r
  75 \r
  76 \r
  77       //----------------/\r
  78      //- Constructors -/\r
  79     //----------------/\r
  80 \r
  81     public JSeq() {\r
  82         super();\r
  83     } //-- jalview.binding.JSeq()\r
  84 \r
  85 \r
  86       //-----------/\r
  87      //- Methods -/\r
  88     //-----------/\r
  89 \r
  90     /**\r
  91      * Method deleteColour\r
  92      * \r
  93      */\r
  94     public void deleteColour()\r
  95     {\r
  96         this._has_colour= false;\r
  97     } //-- void deleteColour() \r
  98 \r
  99     /**\r
 100      * Method deleteEnd\r
 101      * \r
 102      */\r
 103     public void deleteEnd()\r
 104     {\r
 105         this._has_end= false;\r
 106     } //-- void deleteEnd() \r
 107 \r
 108     /**\r
 109      * Method deleteId\r
 110      * \r
 111      */\r
 112     public void deleteId()\r
 113     {\r
 114         this._has_id= false;\r
 115     } //-- void deleteId() \r
 116 \r
 117     /**\r
 118      * Method deleteStart\r
 119      * \r
 120      */\r
 121     public void deleteStart()\r
 122     {\r
 123         this._has_start= false;\r
 124     } //-- void deleteStart() \r
 125 \r
 126     /**\r
 127      * Returns the value of field 'colour'.\r
 128      * \r
 129      * @return int\r
 130      * @return the value of field 'colour'.\r
 131      */\r
 132     public int getColour()\r
 133     {\r
 134         return this._colour;\r
 135     } //-- int getColour() \r
 136 \r
 137     /**\r
 138      * Returns the value of field 'end'.\r
 139      * \r
 140      * @return int\r
 141      * @return the value of field 'end'.\r
 142      */\r
 143     public int getEnd()\r
 144     {\r
 145         return this._end;\r
 146     } //-- int getEnd() \r
 147 \r
 148     /**\r
 149      * Returns the value of field 'id'.\r
 150      * \r
 151      * @return int\r
 152      * @return the value of field 'id'.\r
 153      */\r
 154     public int getId()\r
 155     {\r
 156         return this._id;\r
 157     } //-- int getId() \r
 158 \r
 159     /**\r
 160      * Returns the value of field 'start'.\r
 161      * \r
 162      * @return int\r
 163      * @return the value of field 'start'.\r
 164      */\r
 165     public int getStart()\r
 166     {\r
 167         return this._start;\r
 168     } //-- int getStart() \r
 169 \r
 170     /**\r
 171      * Method hasColour\r
 172      * \r
 173      * \r
 174      * \r
 175      * @return boolean\r
 176      */\r
 177     public boolean hasColour()\r
 178     {\r
 179         return this._has_colour;\r
 180     } //-- boolean hasColour() \r
 181 \r
 182     /**\r
 183      * Method hasEnd\r
 184      * \r
 185      * \r
 186      * \r
 187      * @return boolean\r
 188      */\r
 189     public boolean hasEnd()\r
 190     {\r
 191         return this._has_end;\r
 192     } //-- boolean hasEnd() \r
 193 \r
 194     /**\r
 195      * Method hasId\r
 196      * \r
 197      * \r
 198      * \r
 199      * @return boolean\r
 200      */\r
 201     public boolean hasId()\r
 202     {\r
 203         return this._has_id;\r
 204     } //-- boolean hasId() \r
 205 \r
 206     /**\r
 207      * Method hasStart\r
 208      * \r
 209      * \r
 210      * \r
 211      * @return boolean\r
 212      */\r
 213     public boolean hasStart()\r
 214     {\r
 215         return this._has_start;\r
 216     } //-- boolean hasStart() \r
 217 \r
 218     /**\r
 219      * Method isValid\r
 220      * \r
 221      * \r
 222      * \r
 223      * @return boolean\r
 224      */\r
 225     public boolean isValid()\r
 226     {\r
 227         try {\r
 228             validate();\r
 229         }\r
 230         catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
 231             return false;\r
 232         }\r
 233         return true;\r
 234     } //-- boolean isValid() \r
 235 \r
 236     /**\r
 237      * Method marshal\r
 238      * \r
 239      * \r
 240      * \r
 241      * @param out\r
 242      */\r
 243     public void marshal(java.io.Writer out)\r
 244         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 245     {\r
 246         \r
 247         Marshaller.marshal(this, out);\r
 248     } //-- void marshal(java.io.Writer) \r
 249 \r
 250     /**\r
 251      * Method marshal\r
 252      * \r
 253      * \r
 254      * \r
 255      * @param handler\r
 256      */\r
 257     public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
 258         throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 259     {\r
 260         \r
 261         Marshaller.marshal(this, handler);\r
 262     } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
 263 \r
 264     /**\r
 265      * Sets the value of field 'colour'.\r
 266      * \r
 267      * @param colour the value of field 'colour'.\r
 268      */\r
 269     public void setColour(int colour)\r
 270     {\r
 271         this._colour = colour;\r
 272         this._has_colour = true;\r
 273     } //-- void setColour(int) \r
 274 \r
 275     /**\r
 276      * Sets the value of field 'end'.\r
 277      * \r
 278      * @param end the value of field 'end'.\r
 279      */\r
 280     public void setEnd(int end)\r
 281     {\r
 282         this._end = end;\r
 283         this._has_end = true;\r
 284     } //-- void setEnd(int) \r
 285 \r
 286     /**\r
 287      * Sets the value of field 'id'.\r
 288      * \r
 289      * @param id the value of field 'id'.\r
 290      */\r
 291     public void setId(int id)\r
 292     {\r
 293         this._id = id;\r
 294         this._has_id = true;\r
 295     } //-- void setId(int) \r
 296 \r
 297     /**\r
 298      * Sets the value of field 'start'.\r
 299      * \r
 300      * @param start the value of field 'start'.\r
 301      */\r
 302     public void setStart(int start)\r
 303     {\r
 304         this._start = start;\r
 305         this._has_start = true;\r
 306     } //-- void setStart(int) \r
 307 \r
 308     /**\r
 309      * Method unmarshal\r
 310      * \r
 311      * \r
 312      * \r
 313      * @param reader\r
 314      * @return Object\r
 315      */\r
 316     public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
 317         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 318     {\r
 319         return (jalview.binding.JSeq) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.JSeq.class, reader);\r
 320     } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
 321 \r
 322     /**\r
 323      * Method validate\r
 324      * \r
 325      */\r
 326     public void validate()\r
 327         throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 328     {\r
 329         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
 330         validator.validate(this);\r
 331     } //-- void validate() \r
 332 \r
 333 }\r