src/jalview/binding/JalviewModel.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with\r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 /*\r
   9 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
  10 * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
  11 *\r
  12 * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
  13 * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
  14 * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
  15 * of the License, or (at your option) any later version.\r
  16 *\r
  17 * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  18 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  19 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  20 * GNU General Public License for more details.\r
  21 *\r
  22 * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  23 * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  24 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  25 */\r
  26 \r
  27 package jalview.binding;\r
  28 \r
  29   //---------------------------------/\r
  30  //- Imported classes and packages -/\r
  31 //---------------------------------/\r
  32 \r
  33 import java.io.IOException;\r
  34 import java.io.Reader;\r
  35 import java.io.Serializable;\r
  36 import java.io.Writer;\r
  37 import java.util.Date;\r
  38 import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
  39 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
  40 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
  41 import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
  42 import org.xml.sax.ContentHandler;\r
  43 \r
  44 /**\r
  45  * Class JalviewModel.\r
  46  *\r
  47  * @version $Revision$ $Date$\r
  48  */\r
  49 public class JalviewModel implements java.io.Serializable {\r
  50 \r
  51 \r
  52       //--------------------------/\r
  53      //- Class/Member Variables -/\r
  54     //--------------------------/\r
  55 \r
  56     /**\r
  57      * Field _creationDate\r
  58      */\r
  59     private java.util.Date _creationDate;\r
  60 \r
  61     /**\r
  62      * Field _vamsasModel\r
  63      */\r
  64     private jalview.binding.VamsasModel _vamsasModel;\r
  65 \r
  66     /**\r
  67      * Field _jalviewModelSequence\r
  68      */\r
  69     private jalview.binding.JalviewModelSequence _jalviewModelSequence;\r
  70 \r
  71 \r
  72       //----------------/\r
  73      //- Constructors -/\r
  74     //----------------/\r
  75 \r
  76     public JalviewModel() {\r
  77         super();\r
  78     } //-- jalview.binding.JalviewModel()\r
  79 \r
  80 \r
  81       //-----------/\r
  82      //- Methods -/\r
  83     //-----------/\r
  84 \r
  85     /**\r
  86      * Returns the value of field 'creationDate'.\r
  87      *\r
  88      * @return Date\r
  89      * @return the value of field 'creationDate'.\r
  90      */\r
  91     public java.util.Date getCreationDate()\r
  92     {\r
  93         return this._creationDate;\r
  94     } //-- java.util.Date getCreationDate()\r
  95 \r
  96     /**\r
  97      * Returns the value of field 'jalviewModelSequence'.\r
  98      *\r
  99      * @return JalviewModelSequence\r
 100      * @return the value of field 'jalviewModelSequence'.\r
 101      */\r
 102     public jalview.binding.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence()\r
 103     {\r
 104         return this._jalviewModelSequence;\r
 105     } //-- jalview.binding.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence()\r
 106 \r
 107     /**\r
 108      * Returns the value of field 'vamsasModel'.\r
 109      *\r
 110      * @return VamsasModel\r
 111      * @return the value of field 'vamsasModel'.\r
 112      */\r
 113     public jalview.binding.VamsasModel getVamsasModel()\r
 114     {\r
 115         return this._vamsasModel;\r
 116     } //-- jalview.binding.VamsasModel getVamsasModel()\r
 117 \r
 118     /**\r
 119      * Method isValid\r
 120      *\r
 121      *\r
 122      *\r
 123      * @return boolean\r
 124      */\r
 125     public boolean isValid()\r
 126     {\r
 127         try {\r
 128             validate();\r
 129         }\r
 130         catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
 131             return false;\r
 132         }\r
 133         return true;\r
 134     } //-- boolean isValid()\r
 135 \r
 136     /**\r
 137      * Method marshal\r
 138      *\r
 139      *\r
 140      *\r
 141      * @param out\r
 142      */\r
 143     public void marshal(java.io.Writer out)\r
 144         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 145     {\r
 146 \r
 147         Marshaller.marshal(this, out);\r
 148     } //-- void marshal(java.io.Writer)\r
 149 \r
 150     /**\r
 151      * Method marshal\r
 152      *\r
 153      *\r
 154      *\r
 155      * @param handler\r
 156      */\r
 157     public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
 158         throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 159     {\r
 160 \r
 161         Marshaller.marshal(this, handler);\r
 162     } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler)\r
 163 \r
 164     /**\r
 165      * Sets the value of field 'creationDate'.\r
 166      *\r
 167      * @param creationDate the value of field 'creationDate'.\r
 168      */\r
 169     public void setCreationDate(java.util.Date creationDate)\r
 170     {\r
 171         this._creationDate = creationDate;\r
 172     } //-- void setCreationDate(java.util.Date)\r
 173 \r
 174     /**\r
 175      * Sets the value of field 'jalviewModelSequence'.\r
 176      *\r
 177      * @param jalviewModelSequence the value of field\r
 178      * 'jalviewModelSequence'.\r
 179      */\r
 180     public void setJalviewModelSequence(jalview.binding.JalviewModelSequence jalviewModelSequence)\r
 181     {\r
 182         this._jalviewModelSequence = jalviewModelSequence;\r
 183     } //-- void setJalviewModelSequence(jalview.binding.JalviewModelSequence)\r
 184 \r
 185     /**\r
 186      * Sets the value of field 'vamsasModel'.\r
 187      *\r
 188      * @param vamsasModel the value of field 'vamsasModel'.\r
 189      */\r
 190     public void setVamsasModel(jalview.binding.VamsasModel vamsasModel)\r
 191     {\r
 192         this._vamsasModel = vamsasModel;\r
 193     } //-- void setVamsasModel(jalview.binding.VamsasModel)\r
 194 \r
 195     /**\r
 196      * Method unmarshal\r
 197      *\r
 198      *\r
 199      *\r
 200      * @param reader\r
 201      * @return Object\r
 202      */\r
 203     public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
 204         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 205     {\r
 206         return (jalview.binding.JalviewModel) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.JalviewModel.class, reader);\r
 207     } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader)\r
 208 \r
 209     /**\r
 210      * Method validate\r
 211      *\r
 212      */\r
 213     public void validate()\r
 214         throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 215     {\r
 216         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
 217         validator.validate(this);\r
 218     } //-- void validate()\r
 219 \r
 220 }\r