src/jalview/datamodel/CigarSimple.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.datamodel;\r
  20 \r
  21 /**\r
  22  * <p>\r
  23  * Title:\r
  24  * </p>\r
  25  * \r
  26  * <p>\r
  27  * Description:\r
  28  * </p>\r
  29  * \r
  30  * <p>\r
  31  * Copyright: Copyright (c) 2004\r
  32  * </p>\r
  33  * \r
  34  * <p>\r
  35  * Company: Dundee University\r
  36  * </p>\r
  37  * \r
  38  * @author not attributable\r
  39  * @version 1.0\r
  40  */\r
  41 public abstract class CigarSimple extends CigarBase\r
  42 {\r
  43   /**\r
  44    * Return a symbol sequence with edits (gaps, insertions and deletions)\r
  45    * applied\r
  46    * \r
  47    * @param GapChar\r
  48    *                char\r
  49    * @return String\r
  50    */\r
  51   public abstract String getSequenceString(char GapChar);\r
  52 \r
  53 }\r