src/jalview/datamodel/ContactRange.java

   1 package jalview.datamodel;
   2
   3 /**
   4  * bean for max/min positions for a given range
   5  *
   6  * @author jprocter
   7  *
   8  */
   9 public class ContactRange
  10 {
  11   int minPos;
  12
  13   double min;
  14
  15   int maxPos;
  16
  17   double max;
  18
  19   int from_column, to_column;
  20
  21   private double mean;
  22
  23   /**
  24    * update the bean with given values
  25    *
  26    * @param from_column
  27    * @param to_column
  28    * @param minPos
  29    * @param min
  30    * @param maxPos
  31    * @param max
  32    */
  33   public void update(int from_column, int to_column, int minPos, double min,
  34           int maxPos, double max, double mean)
  35   {
  36     this.from_column = from_column;
  37     this.to_column = to_column;
  38     this.minPos = minPos;
  39     this.min = min;
  40     this.maxPos = maxPos;
  41     this.max = max;
  42     this.mean = mean;
  43   }
  44
  45   /**
  46    * @return the minPos
  47    */
  48   public int getMinPos()
  49   {
  50     return minPos;
  51   }
  52
  53   /**
  54    * @param minPos
  55    *          the minPos to set
  56    */
  57   public void setMinPos(int minPos)
  58   {
  59     this.minPos = minPos;
  60   }
  61
  62   /**
  63    * @return the min
  64    */
  65   public double getMin()
  66   {
  67     return min;
  68   }
  69
  70   /**
  71    * @param min
  72    *          the min to set
  73    */
  74   public void setMin(double min)
  75   {
  76     this.min = min;
  77   }
  78
  79   /**
  80    * @return the maxPos
  81    */
  82   public int getMaxPos()
  83   {
  84     return maxPos;
  85   }
  86
  87   /**
  88    * @param maxPos
  89    *          the maxPos to set
  90    */
  91   public void setMaxPos(int maxPos)
  92   {
  93     this.maxPos = maxPos;
  94   }
  95
  96   /**
  97    * @return the max
  98    */
  99   public double getMax()
 100   {
 101     return max;
 102   }
 103
 104   /**
 105    * @param max
 106    *          the max to set
 107    */
 108   public void setMax(double max)
 109   {
 110     this.max = max;
 111   }
 112
 113   /**
 114    * @return the mean
 115    */
 116   public double getMean()
 117   {
 118     return mean;
 119   }
 120
 121   /**
 122    * @param mean
 123    *          the mean to set
 124    */
 125   public void setMean(double mean)
 126   {
 127     this.mean = mean;
 128   }
 129
 130   /**
 131    * @return the from_column
 132    */
 133   public int getFrom_column()
 134   {
 135     return from_column;
 136   }
 137
 138   /**
 139    * @param from_column
 140    *          the from_column to set
 141    */
 142   public void setFrom_column(int from_column)
 143   {
 144     this.from_column = from_column;
 145   }
 146
 147   /**
 148    * @return the to_column
 149    */
 150   public int getTo_column()
 151   {
 152     return to_column;
 153   }
 154
 155   /**
 156    * @param to_column
 157    *          the to_column to set
 158    */
 159   public void setTo_column(int to_column)
 160   {
 161     this.to_column = to_column;
 162   }
 163 }