src/jalview/datamodel/xdb/embl/Qualifier.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.datamodel.xdb.embl;
  20
  21 public class Qualifier
  22 {
  23   String name;
  24
  25   String[] values;
  26
  27   String[] evidence;
  28
  29   /**
  30    * @return the name
  31    */
  32   public String getName()
  33   {
  34     return name;
  35   }
  36
  37   /**
  38    * @param name
  39    *                the name to set
  40    */
  41   public void setName(String name)
  42   {
  43     this.name = name;
  44   }
  45
  46   /**
  47    * @return the values
  48    */
  49   public String[] getValues()
  50   {
  51     return values;
  52   }
  53
  54   /**
  55    * @param values
  56    *                the values to set
  57    */
  58   public void setValues(String[] values)
  59   {
  60     this.values = values;
  61   }
  62
  63   public void addEvidence(String qevidence)
  64   {
  65     if (evidence == null)
  66     {
  67       evidence = new String[1];
  68     }
  69     else
  70     {
  71       String[] temp = new String[evidence.length + 1];
  72       System.arraycopy(evidence, 0, temp, 0, evidence.length);
  73       evidence = temp;
  74     }
  75     evidence[evidence.length - 1] = qevidence;
  76   }
  77
  78   public void addValues(String value)
  79   {
  80     if (values == null)
  81     {
  82       values = new String[1];
  83     }
  84     else
  85     {
  86       String[] temp = new String[values.length + 1];
  87       System.arraycopy(values, 0, temp, 0, values.length);
  88       values = temp;
  89     }
  90     values[values.length - 1] = value;
  91   }
  92
  93   /**
  94    * @return the evidence
  95    */
  96   public String[] getEvidence()
  97   {
  98     return evidence;
  99   }
 100
 101   /**
 102    * @param evidence
 103    *                the evidence to set
 104    */
 105   public void setEvidence(String[] evidence)
 106   {
 107     this.evidence = evidence;
 108   }
 109 }