src/jalview/gui/ColumnSelection.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import java.util.*;\r
  22 \r
  23 /**\r
  24  * NOTE: Columns are zero based.\r
  25  */\r
  26 public class ColumnSelection\r
  27 {\r
  28   Vector selected = new Vector();\r
  29 \r
  30   public void addElement(int col)\r
  31   {\r
  32     if(!selected.contains(new Integer(col)))\r
  33       selected.addElement(new Integer(col));\r
  34   }\r
  35 \r
  36   public void clear()\r
  37   {\r
  38     selected.removeAllElements();\r
  39   }\r
  40 \r
  41   public void removeElement(int col)\r
  42   {\r
  43     Integer colInt = new Integer(col);\r
  44     if (selected.contains(colInt))\r
  45     {\r
  46       selected.removeElement(colInt);\r
  47     }\r
  48   }\r
  49 \r
  50   public boolean contains(int col)\r
  51   {\r
  52     return selected.contains(new Integer(col));\r
  53   }\r
  54 \r
  55   public int columnAt(int i)\r
  56   {\r
  57     return ( (Integer) selected.elementAt(i)).intValue();\r
  58   }\r
  59 \r
  60   public int size()\r
  61   {\r
  62     return selected.size();\r
  63   }\r
  64 \r
  65   public int getMax()\r
  66   {\r
  67     int max = -1;\r
  68 \r
  69     for (int i = 0; i < selected.size(); i++)\r
  70     {\r
  71       if (columnAt(i) > max)\r
  72       {\r
  73         max = columnAt(i);\r
  74       }\r
  75     }\r
  76 \r
  77     return max;\r
  78   }\r
  79 \r
  80   public int getMin()\r
  81   {\r
  82     int min = 1000000000;\r
  83 \r
  84     for (int i = 0; i < selected.size(); i++)\r
  85     {\r
  86       if (columnAt(i) < min)\r
  87       {\r
  88         min = columnAt(i);\r
  89       }\r
  90     }\r
  91 \r
  92     return min;\r
  93   }\r
  94 \r
  95   public Vector asVector()\r
  96   {\r
  97     return selected;\r
  98   }\r
  99 \r
 100   public void compensateForEdit(int start, int change)\r
 101   {\r
 102     for (int i = 0; i < size(); i++)\r
 103     {\r
 104       int temp = columnAt(i);\r
 105 \r
 106       if (temp >= start)\r
 107       {\r
 108         selected.setElementAt(new Integer(temp - change), i);\r
 109       }\r
 110     }\r
 111   }\r
 112 }\r