src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AlcodonDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)\r
   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21   //---------------------------------/\r
  22  //- Imported classes and packages -/\r
  23 //---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.Alcodon;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class AlcodonDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class AlcodonDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  33 \r
  34 \r
  35       //--------------------------/\r
  36      //- Class/Member Variables -/\r
  37     //--------------------------/\r
  38 \r
  39     /**\r
  40      * Field _elementDefinition.\r
  41      */\r
  42     private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44     /**\r
  45      * Field _nsPrefix.\r
  46      */\r
  47     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49     /**\r
  50      * Field _nsURI.\r
  51      */\r
  52     private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54     /**\r
  55      * Field _xmlName.\r
  56      */\r
  57     private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59 \r
  60       //----------------/\r
  61      //- Constructors -/\r
  62     //----------------/\r
  63 \r
  64     public AlcodonDescriptor() {\r
  65         super();\r
  66         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  67         _xmlName = "alcodon";\r
  68         _elementDefinition = true;\r
  69         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  70         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  71         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  72         //-- initialize attribute descriptors\r
  73         \r
  74         //-- _pos1\r
  75         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Long.TYPE, "_pos1", "pos1", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  76         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  77             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  78                 throws IllegalStateException\r
  79             {\r
  80                 Alcodon target = (Alcodon) object;\r
  81                 if (!target.hasPos1()) { return null; }\r
  82                 return new java.lang.Long(target.getPos1());\r
  83             }\r
  84             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  85                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  86             {\r
  87                 try {\r
  88                     Alcodon target = (Alcodon) object;\r
  89                     // if null, use delete method for optional primitives \r
  90                     if (value == null) {\r
  91                         target.deletePos1();\r
  92                         return;\r
  93                     }\r
  94                     target.setPos1( ((java.lang.Long) value).longValue());\r
  95                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  96                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  97                 }\r
  98             }\r
  99             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 100                 return null;\r
 101             }\r
 102         };\r
 103         desc.setHandler(handler);\r
 104         desc.setMultivalued(false);\r
 105         addFieldDescriptor(desc);\r
 106         \r
 107         //-- validation code for: _pos1\r
 108         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 109         { //-- local scope\r
 110             org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;\r
 111             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();\r
 112             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 113         }\r
 114         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 115         //-- _pos2\r
 116         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Long.TYPE, "_pos2", "pos2", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 117         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 118             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 119                 throws IllegalStateException\r
 120             {\r
 121                 Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 122                 if (!target.hasPos2()) { return null; }\r
 123                 return new java.lang.Long(target.getPos2());\r
 124             }\r
 125             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 126                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 127             {\r
 128                 try {\r
 129                     Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 130                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 131                     if (value == null) {\r
 132                         target.deletePos2();\r
 133                         return;\r
 134                     }\r
 135                     target.setPos2( ((java.lang.Long) value).longValue());\r
 136                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 137                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 138                 }\r
 139             }\r
 140             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 141                 return null;\r
 142             }\r
 143         };\r
 144         desc.setHandler(handler);\r
 145         desc.setMultivalued(false);\r
 146         addFieldDescriptor(desc);\r
 147         \r
 148         //-- validation code for: _pos2\r
 149         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 150         { //-- local scope\r
 151             org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;\r
 152             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();\r
 153             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 154         }\r
 155         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 156         //-- _pos3\r
 157         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Long.TYPE, "_pos3", "pos3", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 158         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 159             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 160                 throws IllegalStateException\r
 161             {\r
 162                 Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 163                 if (!target.hasPos3()) { return null; }\r
 164                 return new java.lang.Long(target.getPos3());\r
 165             }\r
 166             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 167                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 168             {\r
 169                 try {\r
 170                     Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 171                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 172                     if (value == null) {\r
 173                         target.deletePos3();\r
 174                         return;\r
 175                     }\r
 176                     target.setPos3( ((java.lang.Long) value).longValue());\r
 177                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 178                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 179                 }\r
 180             }\r
 181             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 182                 return null;\r
 183             }\r
 184         };\r
 185         desc.setHandler(handler);\r
 186         desc.setMultivalued(false);\r
 187         addFieldDescriptor(desc);\r
 188         \r
 189         //-- validation code for: _pos3\r
 190         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 191         { //-- local scope\r
 192             org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;\r
 193             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();\r
 194             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 195         }\r
 196         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 197         //-- initialize element descriptors\r
 198         \r
 199     }\r
 200 \r
 201 \r
 202       //-----------/\r
 203      //- Methods -/\r
 204     //-----------/\r
 205 \r
 206     /**\r
 207      * Method getAccessMode.\r
 208      * \r
 209      * @return the access mode specified for this class.\r
 210      */\r
 211     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 212     ) {\r
 213         return null;\r
 214     }\r
 215 \r
 216     /**\r
 217      * Method getIdentity.\r
 218      * \r
 219      * @return the identity field, null if this class has no\r
 220      * identity.\r
 221      */\r
 222     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 223     ) {\r
 224         return super.getIdentity();\r
 225     }\r
 226 \r
 227     /**\r
 228      * Method getJavaClass.\r
 229      * \r
 230      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 231      */\r
 232     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 233     ) {\r
 234         return jalview.schemabinding.version2.Alcodon.class;\r
 235     }\r
 236 \r
 237     /**\r
 238      * Method getNameSpacePrefix.\r
 239      * \r
 240      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 241      */\r
 242     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 243     ) {\r
 244         return _nsPrefix;\r
 245     }\r
 246 \r
 247     /**\r
 248      * Method getNameSpaceURI.\r
 249      * \r
 250      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 251      * unmarshaling as XML.\r
 252      */\r
 253     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 254     ) {\r
 255         return _nsURI;\r
 256     }\r
 257 \r
 258     /**\r
 259      * Method getValidator.\r
 260      * \r
 261      * @return a specific validator for the class described by this\r
 262      * ClassDescriptor.\r
 263      */\r
 264     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 265     ) {\r
 266         return this;\r
 267     }\r
 268 \r
 269     /**\r
 270      * Method getXMLName.\r
 271      * \r
 272      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 273      */\r
 274     public java.lang.String getXMLName(\r
 275     ) {\r
 276         return _xmlName;\r
 277     }\r
 278 \r
 279     /**\r
 280      * Method isElementDefinition.\r
 281      * \r
 282      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 283      * of a global\r
 284      * element or element with anonymous type definition.\r
 285      */\r
 286     public boolean isElementDefinition(\r
 287     ) {\r
 288         return _elementDefinition;\r
 289     }\r
 290 \r
 291 }\r