src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AnnotationColoursDescriptor.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19
  20 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  21
  22   //---------------------------------/
  23  //- Imported classes and packages -/
  24 //---------------------------------/
  25
  26 import jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours;
  27
  28 /**
  29  * Class AnnotationColoursDescriptor.
  30  *
  31  * @version $Revision$ $Date$
  32  */
  33 public class AnnotationColoursDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {
  34
  35
  36       //--------------------------/
  37      //- Class/Member Variables -/
  38     //--------------------------/
  39
  40     /**
  41      * Field _elementDefinition.
  42      */
  43     private boolean _elementDefinition;
  44
  45     /**
  46      * Field _nsPrefix.
  47      */
  48     private java.lang.String _nsPrefix;
  49
  50     /**
  51      * Field _nsURI.
  52      */
  53     private java.lang.String _nsURI;
  54
  55     /**
  56      * Field _xmlName.
  57      */
  58     private java.lang.String _xmlName;
  59
  60
  61       //----------------/
  62      //- Constructors -/
  63     //----------------/
  64
  65     public AnnotationColoursDescriptor() {
  66         super();
  67         _nsURI = "www.jalview.org";
  68         _xmlName = "AnnotationColours";
  69         _elementDefinition = true;
  70         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;
  71         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;
  72         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;
  73         //-- initialize attribute descriptors
  74
  75         //-- _aboveThreshold
  76         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_aboveThreshold", "aboveThreshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  77         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
  78             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
  79                 throws IllegalStateException
  80             {
  81                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
  82                 if (!target.hasAboveThreshold()) { return null; }
  83                 return new java.lang.Integer(target.getAboveThreshold());
  84             }
  85             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  86                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  87             {
  88                 try {
  89                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
  90                     // if null, use delete method for optional primitives
  91                     if (value == null) {
  92                         target.deleteAboveThreshold();
  93                         return;
  94                     }
  95                     target.setAboveThreshold( ((java.lang.Integer) value).intValue());
  96                 } catch (java.lang.Exception ex) {
  97                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
  98                 }
  99             }
 100             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 101                 return null;
 102             }
 103         };
 104         desc.setHandler(handler);
 105         desc.setMultivalued(false);
 106         addFieldDescriptor(desc);
 107
 108         //-- validation code for: _aboveThreshold
 109         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 110         { //-- local scope
 111             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 112             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 113             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 114             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 115             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 116         }
 117         desc.setValidator(fieldValidator);
 118         //-- _annotation
 119         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_annotation", "annotation", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 120         desc.setImmutable(true);
 121         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 122             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 123                 throws IllegalStateException
 124             {
 125                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 126                 return target.getAnnotation();
 127             }
 128             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 129                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 130             {
 131                 try {
 132                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 133                     target.setAnnotation( (java.lang.String) value);
 134                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 135                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 136                 }
 137             }
 138             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 139                 return null;
 140             }
 141         };
 142         desc.setHandler(handler);
 143         desc.setMultivalued(false);
 144         addFieldDescriptor(desc);
 145
 146         //-- validation code for: _annotation
 147         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 148         { //-- local scope
 149             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 150             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 151             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 152             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 153         }
 154         desc.setValidator(fieldValidator);
 155         //-- _minColour
 156         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_minColour", "minColour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 157         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 158             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 159                 throws IllegalStateException
 160             {
 161                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 162                 if (!target.hasMinColour()) { return null; }
 163                 return new java.lang.Integer(target.getMinColour());
 164             }
 165             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 166                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 167             {
 168                 try {
 169                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 170                     // if null, use delete method for optional primitives
 171                     if (value == null) {
 172                         target.deleteMinColour();
 173                         return;
 174                     }
 175                     target.setMinColour( ((java.lang.Integer) value).intValue());
 176                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 177                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 178                 }
 179             }
 180             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 181                 return null;
 182             }
 183         };
 184         desc.setHandler(handler);
 185         desc.setMultivalued(false);
 186         addFieldDescriptor(desc);
 187
 188         //-- validation code for: _minColour
 189         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 190         { //-- local scope
 191             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 192             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 193             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 194             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 195             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 196         }
 197         desc.setValidator(fieldValidator);
 198         //-- _maxColour
 199         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_maxColour", "maxColour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 200         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 201             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 202                 throws IllegalStateException
 203             {
 204                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 205                 if (!target.hasMaxColour()) { return null; }
 206                 return new java.lang.Integer(target.getMaxColour());
 207             }
 208             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 209                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 210             {
 211                 try {
 212                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 213                     // if null, use delete method for optional primitives
 214                     if (value == null) {
 215                         target.deleteMaxColour();
 216                         return;
 217                     }
 218                     target.setMaxColour( ((java.lang.Integer) value).intValue());
 219                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 220                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 221                 }
 222             }
 223             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 224                 return null;
 225             }
 226         };
 227         desc.setHandler(handler);
 228         desc.setMultivalued(false);
 229         addFieldDescriptor(desc);
 230
 231         //-- validation code for: _maxColour
 232         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 233         { //-- local scope
 234             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 235             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 236             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 237             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 238             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 239         }
 240         desc.setValidator(fieldValidator);
 241         //-- _colourScheme
 242         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_colourScheme", "colourScheme", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 243         desc.setImmutable(true);
 244         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 245             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 246                 throws IllegalStateException
 247             {
 248                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 249                 return target.getColourScheme();
 250             }
 251             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 252                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 253             {
 254                 try {
 255                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 256                     target.setColourScheme( (java.lang.String) value);
 257                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 258                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 259                 }
 260             }
 261             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 262                 return null;
 263             }
 264         };
 265         desc.setHandler(handler);
 266         desc.setMultivalued(false);
 267         addFieldDescriptor(desc);
 268
 269         //-- validation code for: _colourScheme
 270         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 271         { //-- local scope
 272             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 273             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 274             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 275             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 276         }
 277         desc.setValidator(fieldValidator);
 278         //-- _threshold
 279         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Float.TYPE, "_threshold", "threshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 280         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 281             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 282                 throws IllegalStateException
 283             {
 284                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 285                 if (!target.hasThreshold()) { return null; }
 286                 return new java.lang.Float(target.getThreshold());
 287             }
 288             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 289                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 290             {
 291                 try {
 292                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 293                     // if null, use delete method for optional primitives
 294                     if (value == null) {
 295                         target.deleteThreshold();
 296                         return;
 297                     }
 298                     target.setThreshold( ((java.lang.Float) value).floatValue());
 299                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 300                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 301                 }
 302             }
 303             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 304                 return null;
 305             }
 306         };
 307         desc.setHandler(handler);
 308         desc.setMultivalued(false);
 309         addFieldDescriptor(desc);
 310
 311         //-- validation code for: _threshold
 312         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 313         { //-- local scope
 314             org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;
 315             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();
 316             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 317             typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);
 318             typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);
 319         }
 320         desc.setValidator(fieldValidator);
 321         //-- _perSequence
 322         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_perSequence", "perSequence", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 323         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 324             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 325                 throws IllegalStateException
 326             {
 327                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 328                 if (!target.hasPerSequence()) { return null; }
 329                 return (target.getPerSequence() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);
 330             }
 331             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 332                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 333             {
 334                 try {
 335                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 336                     // if null, use delete method for optional primitives
 337                     if (value == null) {
 338                         target.deletePerSequence();
 339                         return;
 340                     }
 341                     target.setPerSequence( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 342                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 343                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 344                 }
 345             }
 346             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 347                 return null;
 348             }
 349         };
 350         desc.setHandler(handler);
 351         desc.setMultivalued(false);
 352         addFieldDescriptor(desc);
 353
 354         //-- validation code for: _perSequence
 355         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 356         { //-- local scope
 357             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 358             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 359             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 360         }
 361         desc.setValidator(fieldValidator);
 362         //-- _predefinedColours
 363         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_predefinedColours", "predefinedColours", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 364         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 365             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 366                 throws IllegalStateException
 367             {
 368                 AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 369                 if (!target.hasPredefinedColours()) { return null; }
 370                 return (target.getPredefinedColours() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);
 371             }
 372             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 373                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 374             {
 375                 try {
 376                     AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 377                     // if null, use delete method for optional primitives
 378                     if (value == null) {
 379                         target.deletePredefinedColours();
 380                         return;
 381                     }
 382                     target.setPredefinedColours( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 383                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 384                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 385                 }
 386             }
 387             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 388                 return null;
 389             }
 390         };
 391         desc.setHandler(handler);
 392         desc.setMultivalued(false);
 393         addFieldDescriptor(desc);
 394
 395         //-- validation code for: _predefinedColours
 396         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 397         { //-- local scope
 398             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 399             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 400             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 401         }
 402         desc.setValidator(fieldValidator);
 403         //-- initialize element descriptors
 404
 405     }
 406
 407
 408       //-----------/
 409      //- Methods -/
 410     //-----------/
 411
 412     /**
 413      * Method getAccessMode.
 414      *
 415      * @return the access mode specified for this class.
 416      */
 417     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(
 418     ) {
 419         return null;
 420     }
 421
 422     /**
 423      * Method getIdentity.
 424      *
 425      * @return the identity field, null if this class has no
 426      * identity.
 427      */
 428     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(
 429     ) {
 430         return super.getIdentity();
 431     }
 432
 433     /**
 434      * Method getJavaClass.
 435      *
 436      * @return the Java class represented by this descriptor.
 437      */
 438     public java.lang.Class getJavaClass(
 439     ) {
 440         return jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours.class;
 441     }
 442
 443     /**
 444      * Method getNameSpacePrefix.
 445      *
 446      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 447      */
 448     public java.lang.String getNameSpacePrefix(
 449     ) {
 450         return _nsPrefix;
 451     }
 452
 453     /**
 454      * Method getNameSpaceURI.
 455      *
 456      * @return the namespace URI used when marshaling and
 457      * unmarshaling as XML.
 458      */
 459     public java.lang.String getNameSpaceURI(
 460     ) {
 461         return _nsURI;
 462     }
 463
 464     /**
 465      * Method getValidator.
 466      *
 467      * @return a specific validator for the class described by this
 468      * ClassDescriptor.
 469      */
 470     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(
 471     ) {
 472         return this;
 473     }
 474
 475     /**
 476      * Method getXMLName.
 477      *
 478      * @return the XML Name for the Class being described.
 479      */
 480     public java.lang.String getXMLName(
 481     ) {
 482         return _xmlName;
 483     }
 484
 485     /**
 486      * Method isElementDefinition.
 487      *
 488      * @return true if XML schema definition of this Class is that
 489      * of a global
 490      * element or element with anonymous type definition.
 491      */
 492     public boolean isElementDefinition(
 493     ) {
 494         return _elementDefinition;
 495     }
 496
 497 }