src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/JSeqDescriptor.java

   1 /*
   2  * This class was automatically generated with
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
   4  * Schema.
   5  * $Id$
   6  */
   7
   8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
   9
  10 //---------------------------------/
  11 //- Imported classes and packages -/
  12 //---------------------------------/
  13
  14 import jalview.schemabinding.version2.JSeq;
  15
  16 /**
  17  * Class JSeqDescriptor.
  18  *
  19  * @version $Revision$ $Date$
  20  */
  21 public class JSeqDescriptor extends
  22         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
  23 {
  24
  25   // --------------------------/
  26   // - Class/Member Variables -/
  27   // --------------------------/
  28
  29   /**
  30    * Field _elementDefinition.
  31    */
  32   private boolean _elementDefinition;
  33
  34   /**
  35    * Field _nsPrefix.
  36    */
  37   private java.lang.String _nsPrefix;
  38
  39   /**
  40    * Field _nsURI.
  41    */
  42   private java.lang.String _nsURI;
  43
  44   /**
  45    * Field _xmlName.
  46    */
  47   private java.lang.String _xmlName;
  48
  49   // ----------------/
  50   // - Constructors -/
  51   // ----------------/
  52
  53   public JSeqDescriptor()
  54   {
  55     super();
  56     _nsURI = "www.jalview.org";
  57     _xmlName = "JSeq";
  58     _elementDefinition = true;
  59
  60     // -- set grouping compositor
  61     setCompositorAsSequence();
  62     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  63     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  64     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  65     // -- initialize attribute descriptors
  66
  67     // -- _colour
  68     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  69             java.lang.Integer.TYPE, "_colour", "colour",
  70             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  71     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  72     {
  73       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  74               throws IllegalStateException
  75       {
  76         JSeq target = (JSeq) object;
  77         if (!target.hasColour())
  78         {
  79           return null;
  80         }
  81         return new java.lang.Integer(target.getColour());
  82       }
  83
  84       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  85               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  86       {
  87         try
  88         {
  89           JSeq target = (JSeq) object;
  90           // if null, use delete method for optional primitives
  91           if (value == null)
  92           {
  93             target.deleteColour();
  94             return;
  95           }
  96           target.setColour(((java.lang.Integer) value).intValue());
  97         } catch (java.lang.Exception ex)
  98         {
  99           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 100         }
 101       }
 102
 103       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 104       {
 105         return null;
 106       }
 107     };
 108     desc.setHandler(handler);
 109     desc.setMultivalued(false);
 110     addFieldDescriptor(desc);
 111
 112     // -- validation code for: _colour
 113     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 114     { // -- local scope
 115       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 116       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 117       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 118       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 119       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 120     }
 121     desc.setValidator(fieldValidator);
 122     // -- _start
 123     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 124             java.lang.Integer.TYPE, "_start", "start",
 125             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 126     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 127     {
 128       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 129               throws IllegalStateException
 130       {
 131         JSeq target = (JSeq) object;
 132         if (!target.hasStart())
 133         {
 134           return null;
 135         }
 136         return new java.lang.Integer(target.getStart());
 137       }
 138
 139       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 140               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 141       {
 142         try
 143         {
 144           JSeq target = (JSeq) object;
 145           // ignore null values for non optional primitives
 146           if (value == null)
 147           {
 148             return;
 149           }
 150
 151           target.setStart(((java.lang.Integer) value).intValue());
 152         } catch (java.lang.Exception ex)
 153         {
 154           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 155         }
 156       }
 157
 158       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 159       {
 160         return null;
 161       }
 162     };
 163     desc.setHandler(handler);
 164     desc.setRequired(true);
 165     desc.setMultivalued(false);
 166     addFieldDescriptor(desc);
 167
 168     // -- validation code for: _start
 169     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 170     fieldValidator.setMinOccurs(1);
 171     { // -- local scope
 172       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 173       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 174       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 175       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 176       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 177     }
 178     desc.setValidator(fieldValidator);
 179     // -- _end
 180     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 181             java.lang.Integer.TYPE, "_end", "end",
 182             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 183     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 184     {
 185       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 186               throws IllegalStateException
 187       {
 188         JSeq target = (JSeq) object;
 189         if (!target.hasEnd())
 190         {
 191           return null;
 192         }
 193         return new java.lang.Integer(target.getEnd());
 194       }
 195
 196       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 197               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 198       {
 199         try
 200         {
 201           JSeq target = (JSeq) object;
 202           // ignore null values for non optional primitives
 203           if (value == null)
 204           {
 205             return;
 206           }
 207
 208           target.setEnd(((java.lang.Integer) value).intValue());
 209         } catch (java.lang.Exception ex)
 210         {
 211           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 212         }
 213       }
 214
 215       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 216       {
 217         return null;
 218       }
 219     };
 220     desc.setHandler(handler);
 221     desc.setRequired(true);
 222     desc.setMultivalued(false);
 223     addFieldDescriptor(desc);
 224
 225     // -- validation code for: _end
 226     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 227     fieldValidator.setMinOccurs(1);
 228     { // -- local scope
 229       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 230       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 231       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 232       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 233       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 234     }
 235     desc.setValidator(fieldValidator);
 236     // -- _id
 237     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 238             java.lang.String.class, "_id", "id",
 239             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 240     desc.setImmutable(true);
 241     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 242     {
 243       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 244               throws IllegalStateException
 245       {
 246         JSeq target = (JSeq) object;
 247         return target.getId();
 248       }
 249
 250       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 251               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 252       {
 253         try
 254         {
 255           JSeq target = (JSeq) object;
 256           target.setId((java.lang.String) value);
 257         } catch (java.lang.Exception ex)
 258         {
 259           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 260         }
 261       }
 262
 263       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 264       {
 265         return null;
 266       }
 267     };
 268     desc.setHandler(handler);
 269     desc.setRequired(true);
 270     desc.setMultivalued(false);
 271     addFieldDescriptor(desc);
 272
 273     // -- validation code for: _id
 274     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 275     fieldValidator.setMinOccurs(1);
 276     { // -- local scope
 277       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 278       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 279       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 280       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 281     }
 282     desc.setValidator(fieldValidator);
 283     // -- _hidden
 284     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 285             java.lang.Boolean.TYPE, "_hidden", "hidden",
 286             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 287     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 288     {
 289       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 290               throws IllegalStateException
 291       {
 292         JSeq target = (JSeq) object;
 293         if (!target.hasHidden())
 294         {
 295           return null;
 296         }
 297         return (target.getHidden() ? java.lang.Boolean.TRUE
 298                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 299       }
 300
 301       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 302               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 303       {
 304         try
 305         {
 306           JSeq target = (JSeq) object;
 307           // if null, use delete method for optional primitives
 308           if (value == null)
 309           {
 310             target.deleteHidden();
 311             return;
 312           }
 313           target.setHidden(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 314         } catch (java.lang.Exception ex)
 315         {
 316           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 317         }
 318       }
 319
 320       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 321       {
 322         return null;
 323       }
 324     };
 325     desc.setHandler(handler);
 326     desc.setMultivalued(false);
 327     addFieldDescriptor(desc);
 328
 329     // -- validation code for: _hidden
 330     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 331     { // -- local scope
 332       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 333       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 334       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 335     }
 336     desc.setValidator(fieldValidator);
 337     // -- initialize element descriptors
 338
 339     // -- _featuresList
 340     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 341             jalview.schemabinding.version2.Features.class, "_featuresList",
 342             "features", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 343     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 344     {
 345       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 346               throws IllegalStateException
 347       {
 348         JSeq target = (JSeq) object;
 349         return target.getFeatures();
 350       }
 351
 352       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 353               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 354       {
 355         try
 356         {
 357           JSeq target = (JSeq) object;
 358           target.addFeatures((jalview.schemabinding.version2.Features) value);
 359         } catch (java.lang.Exception ex)
 360         {
 361           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 362         }
 363       }
 364
 365       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 366               IllegalArgumentException
 367       {
 368         try
 369         {
 370           JSeq target = (JSeq) object;
 371           target.removeAllFeatures();
 372         } catch (java.lang.Exception ex)
 373         {
 374           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 375         }
 376       }
 377
 378       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 379       {
 380         return new jalview.schemabinding.version2.Features();
 381       }
 382     };
 383     desc.setHandler(handler);
 384     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 385     desc.setMultivalued(true);
 386     addFieldDescriptor(desc);
 387
 388     // -- validation code for: _featuresList
 389     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 390     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 391     { // -- local scope
 392     }
 393     desc.setValidator(fieldValidator);
 394     // -- _pdbidsList
 395     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 396             jalview.schemabinding.version2.Pdbids.class, "_pdbidsList",
 397             "pdbids", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 398     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 399     {
 400       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 401               throws IllegalStateException
 402       {
 403         JSeq target = (JSeq) object;
 404         return target.getPdbids();
 405       }
 406
 407       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 408               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 409       {
 410         try
 411         {
 412           JSeq target = (JSeq) object;
 413           target.addPdbids((jalview.schemabinding.version2.Pdbids) value);
 414         } catch (java.lang.Exception ex)
 415         {
 416           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 417         }
 418       }
 419
 420       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 421               IllegalArgumentException
 422       {
 423         try
 424         {
 425           JSeq target = (JSeq) object;
 426           target.removeAllPdbids();
 427         } catch (java.lang.Exception ex)
 428         {
 429           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 430         }
 431       }
 432
 433       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 434       {
 435         return new jalview.schemabinding.version2.Pdbids();
 436       }
 437     };
 438     desc.setHandler(handler);
 439     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 440     desc.setMultivalued(true);
 441     addFieldDescriptor(desc);
 442
 443     // -- validation code for: _pdbidsList
 444     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 445     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 446     { // -- local scope
 447     }
 448     desc.setValidator(fieldValidator);
 449     // -- _hiddenSequencesList
 450     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 451             java.lang.Integer.TYPE, "_hiddenSequencesList",
 452             "hiddenSequences", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 453     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 454     {
 455       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 456               throws IllegalStateException
 457       {
 458         JSeq target = (JSeq) object;
 459         return target.getHiddenSequences();
 460       }
 461
 462       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 463               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 464       {
 465         try
 466         {
 467           JSeq target = (JSeq) object;
 468           // ignore null values for non optional primitives
 469           if (value == null)
 470           {
 471             return;
 472           }
 473
 474           target.addHiddenSequences(((java.lang.Integer) value).intValue());
 475         } catch (java.lang.Exception ex)
 476         {
 477           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 478         }
 479       }
 480
 481       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 482               IllegalArgumentException
 483       {
 484         try
 485         {
 486           JSeq target = (JSeq) object;
 487           target.removeAllHiddenSequences();
 488         } catch (java.lang.Exception ex)
 489         {
 490           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 491         }
 492       }
 493
 494       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 495       {
 496         return null;
 497       }
 498     };
 499     desc.setHandler(handler);
 500     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 501     desc.setMultivalued(true);
 502     addFieldDescriptor(desc);
 503
 504     // -- validation code for: _hiddenSequencesList
 505     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 506     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 507     { // -- local scope
 508       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 509       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 510       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 511       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 512       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 513     }
 514     desc.setValidator(fieldValidator);
 515   }
 516
 517   // -----------/
 518   // - Methods -/
 519   // -----------/
 520
 521   /**
 522    * Method getAccessMode.
 523    *
 524    * @return the access mode specified for this class.
 525    */
 526   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 527   {
 528     return null;
 529   }
 530
 531   /**
 532    * Method getIdentity.
 533    *
 534    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 535    */
 536   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 537   {
 538     return super.getIdentity();
 539   }
 540
 541   /**
 542    * Method getJavaClass.
 543    *
 544    * @return the Java class represented by this descriptor.
 545    */
 546   public java.lang.Class getJavaClass()
 547   {
 548     return jalview.schemabinding.version2.JSeq.class;
 549   }
 550
 551   /**
 552    * Method getNameSpacePrefix.
 553    *
 554    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 555    */
 556   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 557   {
 558     return _nsPrefix;
 559   }
 560
 561   /**
 562    * Method getNameSpaceURI.
 563    *
 564    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 565    */
 566   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 567   {
 568     return _nsURI;
 569   }
 570
 571   /**
 572    * Method getValidator.
 573    *
 574    * @return a specific validator for the class described by this
 575    *         ClassDescriptor.
 576    */
 577   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 578   {
 579     return this;
 580   }
 581
 582   /**
 583    * Method getXMLName.
 584    *
 585    * @return the XML Name for the Class being described.
 586    */
 587   public java.lang.String getXMLName()
 588   {
 589     return _xmlName;
 590   }
 591
 592   /**
 593    * Method isElementDefinition.
 594    *
 595    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
 596    *         element or element with anonymous type definition.
 597    */
 598   public boolean isElementDefinition()
 599   {
 600     return _elementDefinition;
 601   }
 602
 603 }