src/jalview/ws/jws2/JabaPreset.java

   1 package jalview.ws.jws2;
   2
   3 import jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer.Jws2Instance;
   4 import jalview.ws.params.ArgumentI;
   5 import jalview.ws.params.WsParamSetI;
   6
   7 import java.util.List;
   8
   9 import compbio.metadata.Preset;
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  11 public class JabaPreset implements WsParamSetI {
  12   Preset p=null;
  13   Jws2Instance service;
  14   public JabaPreset(Jws2Instance svc, Preset preset) {
  15     service=svc;
  16     p=preset;
  17   }
  18   @Override
  19   public String getName()
  20   {
  21     return p.getName();
  22   }
  23   @Override
  24   public String getDescription()
  25   {
  26     return p.getDescription();
  27   }
  28   @Override
  29   public String[] getApplicableUrls()
  30   {
  31     return new String[] { service.getUri()};
  32   }
  33   @Override
  34   public String getSourceFile()
  35   {
  36     return null;
  37   }
  38   @Override
  39   public boolean isModifiable()
  40   {
  41     return false;
  42   }
  43   @Override
  44   public void setSourceFile(String newfile)
  45   {
  46     throw new Error("Cannot set source file for "+getClass());
  47   }
  48   @Override
  49   public List<ArgumentI> getArguments()
  50   {
  51     try {
  52     return JabaParamStore.getJwsArgsfromJaba(p.getArguments(service.getRunnerConfig()));
  53     }
  54     catch (Exception e)
  55     {
  56       e.printStackTrace();
  57       throw new Error("Probable mismatch between service instance and preset!");
  58     }
  59   }
  60   @Override
  61   public void setArguments(List<ArgumentI> args)
  62   {
  63     throw new Error("Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset");
  64   }
  65 }