src/jalview/ws/utils/UrlDownloadClient.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21
  22 package jalview.ws.utils;
  23
  24 import jalview.util.Platform;
  25
  26 import java.io.ByteArrayInputStream;
  27 import java.io.File;
  28 import java.io.FileOutputStream;
  29 import java.io.IOException;
  30 import java.net.URL;
  31 import java.nio.channels.Channels;
  32 import java.nio.channels.ReadableByteChannel;
  33 import java.nio.file.Files;
  34 import java.nio.file.Path;
  35 import java.nio.file.Paths;
  36 import java.nio.file.StandardCopyOption;
  37
  38 public class UrlDownloadClient
  39 {
  40   public UrlDownloadClient()
  41   {
  42
  43   }
  44
  45   /**
  46    * Download and save a file from a URL
  47    *
  48    * @param urlstring
  49    *          url to download from, as string
  50    * @param outfile
  51    *          the name of file to save the URLs to
  52    * @throws IOException
  53    */
  54   public static void download(String urlstring, String outfile)
  55           throws IOException
  56   {
  57
  58       FileOutputStream fos = null;
  59       ReadableByteChannel rbc = null;
  60       Path temp = null;
  61       try
  62       {
  63         temp = Files.createTempFile(".jalview_", ".tmp");
  64
  65         URL url = new URL(urlstring);
  66         rbc = Channels.newChannel(url.openStream());
  67         fos = new FileOutputStream(temp.toString());
  68         fos.getChannel().transferFrom(rbc, 0, Long.MAX_VALUE);
  69
  70         // copy tempfile to outfile once our download completes
  71         // incase something goes wrong
  72         Files.copy(temp, Paths.get(outfile),
  73                 StandardCopyOption.REPLACE_EXISTING);
  74       } catch (IOException e)
  75       {
  76         throw e;
  77       } finally
  78       {
  79         try
  80         {
  81           if (fos != null)
  82           {
  83             fos.close();
  84           }
  85         } catch (IOException e)
  86         {
  87           System.out.println(
  88                   "Exception while closing download file output stream: "
  89                           + e.getMessage());
  90         }
  91         try
  92         {
  93           if (rbc != null)
  94           {
  95             rbc.close();
  96           }
  97         } catch (IOException e)
  98         {
  99           System.out.println("Exception while closing download channel: "
 100                   + e.getMessage());
 101         }
 102         try
 103         {
 104           if (temp != null)
 105           {
 106             Files.deleteIfExists(temp);
 107           }
 108         } catch (IOException e)
 109         {
 110           System.out.println("Exception while deleting download temp file: "
 111                   + e.getMessage());
 112         }
 113       }
 114
 115   }
 116
 117   public static void download(String urlstring, File tempFile) throws IOException
 118   {
 119           // BH 2019.01.25  this said "...getFileAsBytes(..." which cannot work.
 120           // maybe we cannot get here?
 121     if (Platform.isJS()) {
 122         /** @j2sNative
 123          * tempFile._bytes = swingjs.JSUtil.getFileAsBytes$O(urlstring);
 124          */
 125     } else {
 126       download(urlstring, tempFile.toString());
 127     }
 128   }
 129 }