src/vamsas/objects/simple/SeqSearchResult.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package vamsas.objects.simple;\r
  20 \r
  21 public class SeqSearchResult extends vamsas.objects.simple.Result implements\r
  22         java.io.Serializable\r
  23 {\r
  24   private vamsas.objects.simple.Alignment alignment;\r
  25 \r
  26   private java.lang.String annotation;\r
  27 \r
  28   private java.lang.String features;\r
  29 \r
  30   private java.lang.String newickTree;\r
  31 \r
  32   public SeqSearchResult()\r
  33   {\r
  34   }\r
  35 \r
  36   public SeqSearchResult(vamsas.objects.simple.Alignment alignment,\r
  37           java.lang.String annotation, java.lang.String features,\r
  38           java.lang.String newickTree)\r
  39   {\r
  40     this.alignment = alignment;\r
  41     this.annotation = annotation;\r
  42     this.features = features;\r
  43     this.newickTree = newickTree;\r
  44   }\r
  45 \r
  46   /**\r
  47    * Gets the alignment value for this SeqSearchResult.\r
  48    * \r
  49    * @return alignment\r
  50    */\r
  51   public vamsas.objects.simple.Alignment getAlignment()\r
  52   {\r
  53     return alignment;\r
  54   }\r
  55 \r
  56   /**\r
  57    * Sets the alignment value for this SeqSearchResult.\r
  58    * \r
  59    * @param alignment\r
  60    */\r
  61   public void setAlignment(vamsas.objects.simple.Alignment alignment)\r
  62   {\r
  63     this.alignment = alignment;\r
  64   }\r
  65 \r
  66   /**\r
  67    * Gets the annotation value for this SeqSearchResult.\r
  68    * \r
  69    * @return annotation\r
  70    */\r
  71   public java.lang.String getAnnotation()\r
  72   {\r
  73     return annotation;\r
  74   }\r
  75 \r
  76   /**\r
  77    * Sets the annotation value for this SeqSearchResult.\r
  78    * \r
  79    * @param annotation\r
  80    */\r
  81   public void setAnnotation(java.lang.String annotation)\r
  82   {\r
  83     this.annotation = annotation;\r
  84   }\r
  85 \r
  86   /**\r
  87    * Gets the features value for this SeqSearchResult.\r
  88    * \r
  89    * @return features\r
  90    */\r
  91   public java.lang.String getFeatures()\r
  92   {\r
  93     return features;\r
  94   }\r
  95 \r
  96   /**\r
  97    * Sets the features value for this SeqSearchResult.\r
  98    * \r
  99    * @param features\r
 100    */\r
 101   public void setFeatures(java.lang.String features)\r
 102   {\r
 103     this.features = features;\r
 104   }\r
 105 \r
 106   /**\r
 107    * Gets the newickTree value for this SeqSearchResult.\r
 108    * \r
 109    * @return newickTree\r
 110    */\r
 111   public java.lang.String getNewickTree()\r
 112   {\r
 113     return newickTree;\r
 114   }\r
 115 \r
 116   /**\r
 117    * Sets the newickTree value for this SeqSearchResult.\r
 118    * \r
 119    * @param newickTree\r
 120    */\r
 121   public void setNewickTree(java.lang.String newickTree)\r
 122   {\r
 123     this.newickTree = newickTree;\r
 124   }\r
 125 \r
 126   private java.lang.Object __equalsCalc = null;\r
 127 \r
 128   public synchronized boolean equals(java.lang.Object obj)\r
 129   {\r
 130     if (!(obj instanceof SeqSearchResult))\r
 131       return false;\r
 132     SeqSearchResult other = (SeqSearchResult) obj;\r
 133     if (obj == null)\r
 134       return false;\r
 135     if (this == obj)\r
 136       return true;\r
 137     if (__equalsCalc != null)\r
 138     {\r
 139       return (__equalsCalc == obj);\r
 140     }\r
 141     __equalsCalc = obj;\r
 142     boolean _equals;\r
 143     _equals = super.equals(obj)\r
 144             && ((this.alignment == null && other.getAlignment() == null) || (this.alignment != null && this.alignment\r
 145                     .equals(other.getAlignment())))\r
 146             && ((this.annotation == null && other.getAnnotation() == null) || (this.annotation != null && this.annotation\r
 147                     .equals(other.getAnnotation())))\r
 148             && ((this.features == null && other.getFeatures() == null) || (this.features != null && this.features\r
 149                     .equals(other.getFeatures())))\r
 150             && ((this.newickTree == null && other.getNewickTree() == null) || (this.newickTree != null && this.newickTree\r
 151                     .equals(other.getNewickTree())));\r
 152     __equalsCalc = null;\r
 153     return _equals;\r
 154   }\r
 155 \r
 156   private boolean __hashCodeCalc = false;\r
 157 \r
 158   public synchronized int hashCode()\r
 159   {\r
 160     if (__hashCodeCalc)\r
 161     {\r
 162       return 0;\r
 163     }\r
 164     __hashCodeCalc = true;\r
 165     int _hashCode = super.hashCode();\r
 166     if (getAlignment() != null)\r
 167     {\r
 168       _hashCode += getAlignment().hashCode();\r
 169     }\r
 170     if (getAnnotation() != null)\r
 171     {\r
 172       _hashCode += getAnnotation().hashCode();\r
 173     }\r
 174     if (getFeatures() != null)\r
 175     {\r
 176       _hashCode += getFeatures().hashCode();\r
 177     }\r
 178     if (getNewickTree() != null)\r
 179     {\r
 180       _hashCode += getNewickTree().hashCode();\r
 181     }\r
 182     __hashCodeCalc = false;\r
 183     return _hashCode;\r
 184   }\r
 185 \r
 186 }\r