test/jalview/ext/ensembl/EnsemblSeqProxyAdapter.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ext.ensembl;
  22
  23 import jalview.datamodel.SequenceFeature;
  24
  25 /**
  26  * A convenience class to simplify writing unit tests (pending Mockito or
  27  * similar?)
  28  */
  29 public class EnsemblSeqProxyAdapter extends EnsemblSeqProxy
  30 {
  31   /**
  32    * Default constructor (to use rest.ensembl.org)
  33    */
  34   public EnsemblSeqProxyAdapter()
  35   {
  36     super();
  37   }
  38
  39   /**
  40    * Constructor given the target domain to fetch data from
  41    *
  42    * @param d
  43    */
  44   public EnsemblSeqProxyAdapter(String d)
  45   {
  46     super(d);
  47   }
  48
  49   @Override
  50   public String getDbName()
  51   {
  52     return null;
  53   }
  54
  55   @Override
  56   protected EnsemblFeatureType[] getFeaturesToFetch()
  57   {
  58     return null;
  59   }
  60
  61   @Override
  62   protected EnsemblSeqType getSourceEnsemblType()
  63   {
  64     return null;
  65   }
  66
  67   @Override
  68   protected boolean identifiesSequence(SequenceFeature sf, String accId)
  69   {
  70     return false;
  71   }
  72
  73 }