test/jalview/schemes/JalviewColourSchemeTest.java

   1 package jalview.schemes;
   2
   3 import static org.testng.Assert.assertEquals;
   4 import static org.testng.Assert.assertTrue;
   5
   6 import org.testng.annotations.Test;
   7
   8 public class JalviewColourSchemeTest
   9 {
  10   @Test(groups = "Functional")
  11   public void testGetSchemeClass()
  12   {
  13     assertTrue(JalviewColourScheme.Clustal
  14             .getSchemeClass() == ClustalxColourScheme.class);
  15     assertTrue(JalviewColourScheme.Blosum62
  16             .getSchemeClass() == Blosum62ColourScheme.class);
  17     assertTrue(JalviewColourScheme.PID
  18             .getSchemeClass() == PIDColourScheme.class);
  19     assertTrue(JalviewColourScheme.Hydrophobic
  20             .getSchemeClass() == HydrophobicColourScheme.class);
  21     assertTrue(JalviewColourScheme.Zappo
  22             .getSchemeClass() == ZappoColourScheme.class);
  23     assertTrue(JalviewColourScheme.Taylor
  24             .getSchemeClass() == TaylorColourScheme.class);
  25     assertTrue(JalviewColourScheme.Helix
  26             .getSchemeClass() == HelixColourScheme.class);
  27     assertTrue(JalviewColourScheme.Strand
  28             .getSchemeClass() == StrandColourScheme.class);
  29     assertTrue(JalviewColourScheme.Turn
  30             .getSchemeClass() == TurnColourScheme.class);
  31     assertTrue(JalviewColourScheme.Buried
  32             .getSchemeClass() == BuriedColourScheme.class);
  33     assertTrue(JalviewColourScheme.Nucleotide
  34             .getSchemeClass() == NucleotideColourScheme.class);
  35     assertTrue(JalviewColourScheme.PurinePyrimidine
  36             .getSchemeClass() == PurinePyrimidineColourScheme.class);
  37     assertTrue(JalviewColourScheme.TCoffee
  38             .getSchemeClass() == TCoffeeColourScheme.class);
  39     assertTrue(JalviewColourScheme.RNAHelices
  40             .getSchemeClass() == RNAHelicesColour.class);
  41     assertTrue(JalviewColourScheme.IdColour
  42             .getSchemeClass() == IdColourScheme.class);
  43   }
  44
  45   @Test(groups = "Functional")
  46   public void testToString()
  47   {
  48     assertEquals(JalviewColourScheme.Clustal.toString(), "Clustal");
  49     assertEquals(JalviewColourScheme.Blosum62.toString(), "Blosum62");
  50     assertEquals(JalviewColourScheme.PID.toString(), "% Identity");
  51     assertEquals(JalviewColourScheme.Zappo.toString(), "Zappo");
  52     assertEquals(JalviewColourScheme.Taylor.toString(), "Taylor");
  53     assertEquals(JalviewColourScheme.Hydrophobic.toString(), "Hydrophobic");
  54     assertEquals(JalviewColourScheme.Helix.toString(), "Helix Propensity");
  55     assertEquals(JalviewColourScheme.Strand.toString(),
  56             "Strand Propensity");
  57     assertEquals(JalviewColourScheme.Turn.toString(), "Turn Propensity");
  58     assertEquals(JalviewColourScheme.Buried.toString(), "Buried Index");
  59     assertEquals(JalviewColourScheme.Nucleotide.toString(), "Nucleotide");
  60     assertEquals(JalviewColourScheme.PurinePyrimidine.toString(),
  61             "Purine/Pyrimidine");
  62     assertEquals(JalviewColourScheme.TCoffee.toString(), "T-Coffee Scores");
  63     assertEquals(JalviewColourScheme.RNAHelices.toString(), "RNA Helices");
  64     assertEquals(JalviewColourScheme.IdColour.toString(), "Sequence ID");
  65   }
  66 }