utils/getdown/bin/jalview.ps1

   1 #!/usr/bin/env pwsh
   2
   3 # save args and first parameter
   4 $myArgs = $args.Clone()
   5 $myArg1 = $args[0]
   6
   7 # setup for powershell version < 6.0
   8 [bool] $myIsWindows = 0
   9 [bool] $myIsMacOS = 0
  10 if ( $IsWindows -eq $null ) {
  11   # for powershell version < 6.0 let's assume Windows
  12   $myIsWindows = 1
  13   $myIsMacOS = 0
  14 } else {
  15   $myIsWindows = $IsWindows
  16   $myIsMacOS = $IsMacOS
  17 }
  18
  19 # parent dir of this actual script (which should be the getdown appdir/bin). Follow all symlinks.  Like GNU readlink -f
  20 function Readlink-f {
  21   Param($Link)
  22   $Return = $null
  23   $c = 0
  24   $max = 100 # just in case we end up in a loop
  25   [bool] $found = 0
  26   $file = Get-Item -Path $Link
  27   $prevfile = $null
  28   While ( $c -lt $max -and "${file}" -ne "${prevfile}" -and -not $found ) {
  29     $prevfile = $file
  30     [string] $target = ( $file ).Target
  31     If ( $target -eq $null -or ( $file ).LinkType -ne "SymbolicLink" ) {
  32       $Return = $file
  33       $found = 1
  34     } Else {
  35       If ( $( Split-Path -Path $target -IsAbsolute ) ) {
  36         $file = Get-Item -Path $target
  37       } Else {
  38 # symbolic link is relative: combine previous link parent dir with the link target and resolve
  39         $file = Get-Item -Path ( Join-Path -Path ( Split-Path -Path $prevfile -Parent ) -ChildPath $target -Resolve )
  40       }
  41     }
  42     $c++
  43   }
  44   if ( -not $found ) {
  45     throw "Could not determine path to actual file $( Split-Path -Path $Link -Leaf )"
  46   }
  47   $Return
  48 }
  49
  50 # Avert problem with unix version of powershell and tell user the reason (Windows must always have .ps1 extension)
  51 if ( $MyInvocation.MyCommand.Path -eq $null ) {
  52   throw "Script or link to script must have extension .ps1"
  53 }
  54
  55
  56 $CMDPATH = ( Get-Item $MyInvocation.MyCommand.Path )
  57 $SCRIPTPATH = Readlink-f -Link $CMDPATH
  58 $DIR = Split-Path -Path $SCRIPTPATH -Parent
  59
  60 $APPDIR = If ( ( Split-Path -Path $DIR -Leaf ) -eq "bin" ) { Split-Path -Path $DIR -Parent } Else { $DIR }
  61 $JAVAEXE = If ( $myIsWindows ) { "java.exe" } Else { "java" }
  62 $JAVA = Join-Path -Path $APPDIR -ChildPath ( "jre/" + $( If ( $myIsMacOS ) { "Contents/Home/" } Else { "" } ) + "bin/${JAVAEXE}" )
  63 $GETDOWNTXT = Join-Path -Path $APPDIR -ChildPath "getdown.txt"
  64
  65 # look for getdown.txt -- needed to create classpath
  66 if ( -not ( Test-Path -Path "${GETDOWNTXT}" ) ) {
  67   throw "Cannot find ${GETDOWNTXT}"
  68 }
  69
  70 # look for bundled JRE. Might not be there if unix installer used in which case just invoke "java"
  71 if ( -not ( Test-Path -Path "${JAVA}" ) ) {
  72   Write-Host "Cannot find bundled ${JAVAEXE}. Using system ${JAVAEXE} and hoping for the best!"
  73   $JAVA = $JAVAEXE
  74 }
  75
  76 $CLASSPATH = ( Select-String -Path "${GETDOWNTXT}" -AllMatches -Pattern "code\s*=\s*(.*)$" | foreach { Join-Path -Path $APPDIR -ChildPath $($_.Matches.Groups[1].Value ) } ) -join $( If ( $myIsWindows ) { ";" } Else { ":" } )
  77
  78 # get console width
  79 $CONSOLEWIDTH = $Host.UI.RawUI.WindowSize.Width
  80
  81 # quote the args and the command (in case of spaces) with escape chars (`) and precede with & to indicate command not string
  82 $myArgsString = '"' + $($myArgs -join '" "') + '"'
  83 Invoke-Expression -Command "& `"${JAVA}`" `"-DCONSOLEWIDTH=${CONSOLEWIDTH}`" -cp `"${CLASSPATH}`" jalview.bin.Launcher ${myArgsString}"
  84